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胎儿视网膜和干细胞来源的视网膜类器官的scATAC-seq发现细胞命运改变过程中的染色质变化

文章对人胎儿视网膜和hESC来源的视网膜organoid进行了scATAC-seq,包括7个胎儿视网膜(其中2个在体外培养了4天)和5个organoid样本,根据年龄的不同,包含大约10-20个organoids...Fig4 想看organoid多大程度和胚胎发育过程相似,比较了 organoid和胚胎来源培养的视网膜球(分群的不同、peaks的基因通路富集、和scRNAseq数据整合分析)。...视网膜organoid的染色质可及性 Fig4 organoid和视网膜球(reinospheres)的比较 organoid 里的细胞群和胚胎样本中的很相似。...接着分析比较了我们组之前发表的scRNAseq数据 , NOTCH信号通路的组分在organoid中表达很低 (Fig4D), AC和HC 的细胞数量在organoid中有降低 (Fig4E-F)。...Fig6 视网膜organoid添加 Notch 抑制剂后染色质开放性的变化 接着又在视网膜organoid中检测Notch抑制剂的作用。

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肿瘤类器官研究发展大事件

英国研究团队在实验室成功培养出第一个人类原发性肝癌的迷你生物模型,这项也称为「类器官」(organoid)的模型已应用于测试数种癌症用药,包括现行癌症治疗用药及研发中癌症新药,初步结果相当令人振奋。...此项研究的主持人之一Meritxell Huch 博士说,「我们之前曾利用健康肝脏组织成功创造出类器官(organoid),但这次类肿瘤(tumouroid)的创造对肝癌研究又更推进了一大步。...2017-Brca1-mutation-mouse-orgnoids 使用类器官(Organoid)进行药物研发是类器官的重要应用方向。...类器官(Organoid)是把干细胞在体外3D条件下培养,产生的“类似”器官样的结构。类器官具有广泛的用途,可以用作各种疾病模型,在肿瘤研究精准医学研究中具有重要意义。

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