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    癌症样本全转录组数据的融合基因鉴定

    是8个碱基 --alignSJDBoverhangMin 1 # 注释过的junction的最少的overhang是1个碱基 ## 其他参数 --alignSJstitchMismatchNmax...文件可直接用于融合基因 --chimSegmentReadGapMax 0 # 嵌合读段之间不允许空位 --chimJunctionOverhangMin 20 # 嵌合的junction的最少的overhang...产生机制及鉴定方法(https://zhuanlan.zhihu.com/p/84928559#tocbar--jig2lh) 在STAR比对工具原理及使用介绍这篇推文中,作者进一步说明了什么是overhang...,以及如何区分可变剪接和基因融合事件(当overhang同时匹配上原基因和其它基因外显子区域时) ---- 结果解读: 参考 RNA-seq数据分析完全指北-07:STAR比对结果解读 STAR比对工具原理及使用介绍...AC;6:GT/AT; 在可变剪接数据库中是否存在,0=unannotated,1=annotated 跨过该剪接位点的唯一比对reads数目 跨过该剪接位点的多处比对reads数目 该剪接位点的最长overhang

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