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GEO数据上传

1、创建账号 将数据上传到GEO数据库,首先要创建并登陆NCBI帐号, 然后进入提交的网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/submission.html...以高通量测序数据为例: 2.准备文件 点进去需要填写三个文件,分别为:Metadata spreadsheet、Processed data files、Raw data files。...Metadata spreadsheet表格 3.填写文件 Metadata spreadsheet提供了两个例子,每个填写的栏目都给出了提示和说明,也可以根据给出的示例进行填写: image.png 4.数据上传...转到提交数据操作的网页 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/submissionftp.html 数据上传给出了详细的步骤,step1给出了上传的位置。...在linux可以使用 lftp进行上传上传的代码在上面example linux sessions已经给出,只需要自己将Folder_with_submission_files改成自己要上传数据的绝对路径的文件目录即可

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【玩转腾讯云】PAI助力迎祥花园线上开盘

[项目已上线] 总述 项目最终通过微信小程序进行开发完成,通过租用腾讯云PAI服务器,自动绑定已经备案的域名。...服务器需要安装docker环境,通过docker-compose进行启动,自动启动需要使用.pai.yml这个文件进行动态服务拉取自动对服务进行启动停止和重启操作。...总的来说,腾讯云PAI服务器给我们开发者带来了很多硬件上的帮助,这些无关开发,然而很大程度上减少开发者们烦恼的方面,比如小程序开发域名需备案:) 诚然,这款服务器还是有相当一部分的坑存在,需要可能也是接下来...PAI的优化方向 部署脚本 由于PAI服务器没有给我们提供相关的shell脚本,这个时候需要我们自己创建相关的文件,阅读了官方提供的脚本 [官方部署脚本demo] 大致猜得出来要怎么使用了,可惜无奈的是我们创建的过程...这个文件书写起来就简单很多了,规定docker-compose.yml基础文件,之后就是使用shell, docker-compose up等等 对于.pai.yml这个启动过程,其实PAI团队可以写一个类似

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iOS开发之NSURLSessionUploadTask上传数据

服务器开发 环境:IDEA 14 +Tomcat 8.x+JDK 8 1、编写服务器端代码 由于上传数据与下载数据不同,下载的时候只要把数据丢进服务器就可以了。但是上传需要服务器自己来处理。...但是在使用NSURLSessionUploadTask进行上传时最麻烦的是上传数据的构造,其遵循严格的规范,如下图,不能随意书写,不能随意书写,不能随意书写~,重要的事情说三遍,否则坑得你生活不能自理。...NSData *uploadData = [self getData]; //7、创建上传任务 上传数据来自getData方法 NSURLSessionUploadTask.../jpeg")]; //换行符 [data appendData:YFEnter]; //换行符 [data appendData:YFEnter]; //2、上传的文件数据...客户端演示.gif 再看服务器端最终上传数据,不重要以为是图片,静静观察一会儿~~~有变化 ? 服务器端.gif

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【AutoML】当前有哪些可用的AutoML平台?

以视觉为例,当我们想要使用一个服务时,只需要三步: (1) 上传图片到Google Cloud Storage。 (2) 创建一个图片和对应标签的CSV文件。...(3) 使用AutoML Vision格式化数据集,然后训练和部署模型。 Cloud AutoML提供了API调用和图形界面,想试用的自己去尝试吧。...使用流程包含四步: (1) 数据上传数据标注 (2) 训练任务配置及调参 (3) 模型效果评估 (4) 模型部署 ?...3 阿里云PAI 阿里云机器学习平台PAI(Platform of Artificial Intelligence)是阿里巴巴推出的机器学习服务平台,包含3个子产品,分别是机器学习可视化开发工具PAI-STUDIO...,云端交互式代码开发工具PAI-DSW,模型在线服务PAI-EAS, 提供了从数据处理、模型训练、服务部署到预测的一站式服务。

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测序文章数据上传找哪里

在我们发表高通量测序文章之前通常要上传测序数据到GEO数据库,现总结流程如下。 注册账户、填写MetaSheet 在NCBI GEO官网注册一个账号,然后登陆。...数据上传,原始测序的fastq一般采用gzip压缩后上传。 在Linux系统,使用的是lftp上传; Windows可以使用FileZilla....Linux下lftp上传 为了方便lftp上传,我写了一个bash脚本, 命名为GEO_upload.sh,只需提供FTP服务器的地址、用户名、密码、上传文件所在目录和上传到FTP服务器的目录即可。...将左侧窗口要上传的文件拖动到右侧窗口,开始上传。 在菜单栏的传输—对已存在文件的默认操作—选择上传-继续文件传输即可实现断点续传。...Best, Name 获取GEO号 待GEO的工作人员审核处理后,你可以在GEO的账户下查看已上次的数据的GEO 号和供Reviewer访问的私人链接用于文章审阅。

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动态 | MSRA联合四大高校,共建新一代AI开放科研教育平台

数据:在平台合作框架下,微软将开放自身人工智能领域的数据集供合作高校科研和教育使用,各高校也将通过平台贡献各自在多个领域的数据集,如中国科学技术大学国家类脑实验室的海量类脑数据等。...为深度学习量身定做,可扩展支撑更多 AI 和大数据框架 通过创新的 PAI 运行环境支持,几乎所有深度学习框架如 CNTK,TensorFlow, PyTorch 等无需修改即可运行;其基于 Docker...详见https://github.com/Microsoft/pai/blob/master/pai-management/README.md 访问 Web Portal 进行任务提交和集群管理。...然后是提交深度学习 Job 示例 将你的数据和代码上传至 HDFS:如用 hdfs 命令行将数据上传至hdfs://host:port/path/tensorflow-distributed-jobguid...Job"上传配置文件,即可提交你的 Job。

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上传数据到GEO数据库获得GEO号

high-throughput sequence data to GEOHow to upload files to GEO以及我师兄给我写的教程 大致的流程从网站上截取下来的 第一步是申请一个GEO账号用来传输数据...第二步是准备提交的数据 准备的数据有三个 There are three required components for the spreadsheet-based submission method...GEO上是这么说的,我就是把处理得到的表达谱作为processed data files raw data files 原始的测序数据就是fastq文件,这边需要提供这些文件的md5sum 以便于检查文件的完整性...数据准备完之后就是需要上传这些数据到GEO ftp 上,这个过程比较麻烦,GEO 的服务器真的是不太好用,速度很慢。 第三步就是传输准备好的数据到GEO ftp 上。...,但是不知道是不是因为续传的原因只有一个数据是完整的 其他数据geo 工作者说是corrupted 然后我看了geo 服务器上的数据和本地服务器上的数据是一样的 并不知道为什么他们说不一样 难过 第二个方法使用命令行的方式

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AI绘画专栏之statble diffusion SDXL 1.0 换脸roop easyphoto (24)

上传完成后,我们就可以在界面上看到已经上传的图像啦!...该参数是保证每个epoch结束后数据加载迭代器不释放,不用每个epoch都初始化,从而节约时间。...只需点击上传照片即可上传图片,点击清除照片即可删除上传的图片;右边是训练参数,不能为第一次训练进行调整。点击上传照片后,我们可以开始上传图像这里最好上传5到20张图像,包括不同的角度和光照。...dataloader num workers数据加载的works数量,windows下不生效,因为设置了会报错,Linux正常设置。...在cpu资源充足的情况下,设置的值越大,数据加载速度越快,训练速度越快。learning rate训练Lora的学习率,默认为1e-4。

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工业数据采集上传云端工业网关应用

工业5G网关对设备开关、模拟量及其他上报数据进行采集,通过配置传感器,还可以实现对设备温度、震动及环境湿度等多种数据进行采集;通过配套计讯物联云平台系统,用户既可以在工控机上实现数据监测和设备控制,也可以通过手机...图片1.png 工业数据采集上传云端工业物联网网关http://www.top-iot.com/list-55-1.html 1、通过直接连接设备或部署传感器,实现工业制造业检测环节的环境信息、设备信息的检测...图片3.png 工业数据采集上传云端优势 1、降低存储成本:从设备传感器上采集的数据点往往是时序连续的过程量,随着采集频率的提高和周期延长,数据量是非常大的,如果考虑对海量的数据的存储、备份和还原全生命周期的管理...4、数据共享更便利:企业应该把自身看成“大数据”价值链中的一部分,那么企业既是贡献者也是受益者,工业大数据的价值可以共享给企业上下游使用,采用统一的公有云平台,促进数据资源的融会贯通,使得数据共享更方便...在越来越多的制造业把大数据放在云端进行处理的时候,在网络、存储和计算能力有效的情况下,采用对数据进行压缩和对数据特征进行选取的方法进行数据轻量化处理,可以满足数据业务的分析需求和提升处理效率。

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SpringMVC【参数绑定、数据回显、文件上传

前言 本文主要讲解的知识点如下: 参数绑定 数据回显 文件上传 参数绑定 我们在Controller使用方法参数接收值,就是把web端的值给接收到Controller中处理,这个过程就叫做参数绑定… 默认支持的参数类型...其实数据回显我们现在的话就一点也不陌生了….我们刚使用EL表达式的时候就已经学会了数据回显了,做SSH项目的时候也有三圈问题的数据回显… 在页面上数据回显本质上就是获取reqeust域的值.....---- SpringMVC文件上传 我们使用Struts2的时候,觉得Struts2的文件上传方式比传统的文件上传方式好用多了… http://blog.csdn.net/hon_3y/article.../details/71091593 既然我们正在学习SpringMVC,那么我们也看一下SpringMVC究竟是怎么上传文件的… 配置虚拟目录 在这次,我们并不是把图片上传到我们的工程目录中… 那为啥不将图片直接上传到我们的工程目录中呢...@ModelAttribute注解能够将数据绑定到model中(也就是request中),如果经常需要绑定到model中的数据,抽取成方法来使用这个注解还是不错的。

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