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Python-科学计算-pandas-07-Df条件筛选

系统:Windows 7 语言版本:Anaconda3-4.3.0.1-Windows-x86_64 编辑器:pycharm-community-2016.3.2 pandas:0.19.2 这个系列讲讲...Python的科学计算版块 今天讲讲pandas模块:根据条件Df进行筛选 Part 1:示例 已知df_1,有3列["value1", "value2", "value3"], 不同筛选条件下,获取新的...df 筛选条件1:value2列大于0.6,且,value3列小于5,获得df_2 筛选条件2:value2列大于0.6,或,value3列小于5,获得df_3 筛选条件3:value2列大于0.6,且...Part 2:代码 import pandas as pd dict_1 = {"value1": ["P1", "P2", "P3"], "value2": [0.5, 0.8,...Part 3:部分代码解读 df_2 = df_1[(df_1["value2"] > 0.6) & (df_1["value3"] < 5)],两个条件分别放置于()内,即df[(条件1) & (条件

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Pandas查询数据df.query

Pandas查询数据的简便方法df.query pandas中数据查询query函数 方法对比: 使用df[(df[“a”] > 3) & (df[“b”]<5)]的方式; 使用df.query...[:, "bWendu"] = df["bWendu"].str.replace("℃", "").astype('int32') df.loc[:, "yWendu"] = df["yWendu"]....str.replace("℃", "").astype('int32') 使用dataframe条件表达式查询 最低温度低于-10度的列表 df[df["yWendu"] < -10].head()...东北风 1-2级 27 优 1 359 2018-12-26 -2 -11 晴~多云 东北风 2级 26 优 1 360 2018-12-27 -5 -12 多云~晴 西北风 3级 48 优 1 复杂条件查询...注意,组合条件用&符号合并,每个条件判断都得带括号 ## 查询最高温度小于30度,并且最低温度大于15度,并且是晴天,并且天气为优的数据 df[ (df["bWendu"]<=30)

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Pandas数据分组的函数应用(df.apply()、df.agg()和df.transform()、df.applymap())

文章目录 apply()函数 介绍 样例 性能比较 apply() 数据聚合agg() 数据转换transform() applymap() 将自己定义的或其他库的函数应用于Pandas对象,有以下...这个函数需要自己实现,函数的传入参数根据axis来定,比如axis = 1,就会把一行数据作为Series的数据 结构传入给自己实现的函数中,我们在函数中实现对Series不同属性之间的计算,返回一个结果...) >>> df['score_math'].apply('mean') 86.33333333333333 >>> type...(df['score_math'].apply(np.mean)) #逐行求每个学生的平均分 >>> df.apply(np.mean...()的特例,可以对pandas对象进行逐行或逐列的处理; 能使用agg()的地方,基本上都可以使用apply()代替。

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根据线粒体基因进行过滤

那这期我们来了解一下如何根据线粒体、核糖体以及红血蛋白基因的比例,对细胞进行过滤 为什么要基于这些基因进行过滤 单细胞中表达量最高的基因一般是线粒体基因、核糖体基因等 #抽样查看TOP50基因 # 这里的...nFeature_RNA和nCount_RNA,统计一下全部基因的表达量 但是并不会计算线粒体、核糖体这些单独的基因的比例,所以需要我们自行计算一下这些基因,然后也保存在meta.data里面 计算方法: 根据基因名特征进行整理...一般简单的过滤就是基于可视化的结果,设置一个上限 #过滤指标2:线粒体/核糖体基因比例(根据上面的violin图) selected_mito <- WhichCells(sce.all, expression...sce.all_filt <- subset(sce.all_filt, cells = selected_hb) dim(sce.all_filt) table(sce.all_filt$orig.ident) 根据线粒体核糖体基因进行过滤...在过滤线粒体核糖体基因推文中提到了过滤的方式 1.

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Python-科学计算-pandas-24-创建空DF

系统:Windows 10 编辑器:JetBrains PyCharm Community Edition 2018.2.2 x64 pandas:1.1.5 这个系列讲讲Python的科学计算及可视化...今天讲讲pandas模块 生成一个空的df Part 1:场景描述 一些情况下需要对df进行操作,若这个df是中间计算出来,有可能是空字符串,这样后续的很多运算就会报错 其中的一个方法就是给其赋值一个空的...df Part 2:代码1 import pandas as pd df = pd.DataFrame(columns=['A', 'B', 'C', 'D']) print(df) if df.empty...: print("为空的df") print(type(df)) 代码截图 执行结果 Part 3:代码2 import pandas as pd df = pd.DataFrame...df来说,其实可以不需要列名 代码2中无列名,生成的空df更纯粹一点 注意两者的类型都是pandas.core.frame.DataFrame ---- 本文为原创作品,欢迎分享朋友圈

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