Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言,运行在超过 100 种计算机平台上,适用广泛,从大型机到便携设备,从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域,Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发,系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux(主要是 CentOS)、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0
Perl5是一种全功能的编程语言。它用于所有类型的生产项目,包括世界各地的商业业务系统。Perlbrew是Perl5的安装和版本切换工具,您可以安装,删除,并在之间切换Perl版本。
今天又有小伙伴微信问我perl模块安装的问题,因为ENSEMBL发布的大多数数据库以及软件都是基于perl的,尤其是分量很重的VEP,所以即使你再如何如何的讨厌perl,也不得不与之打交道。 这种细节问题问我,我当然无法直接给出答案咯。毕竟,我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客,才意识到,我竟然已经写了7篇教程,关于perl的模块。目录如下: ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe
Shell脚本语言是实现Linux/UNIX系统管理及自动化运维所必备的重要工具, Linux/UNIX系统的底层及基础应用软件的核心大都涉及Shell脚本的内容。每一个合格 的Linux系统管理员或运维工程师,都需要能够熟练地编写Shell脚本语言,并能够阅 读系统及各类软件附带的Shell脚本内容。只有这样才能提升运维人员的工作效率,适 应曰益复杂的工作环境,减少不必要的重复工作,从而为个人的职场发展奠定较好的基础
在linux/unix环境下使用perl当然很方便了,常用的Vim就能搞定。但毕竟工作的机器使用的是Windows,又不想嫌麻烦去安装虚拟机(机器又会变慢),所以就想在windows下跑perl了
conda这个东西,非常多人给我推荐过,即使是像我这样安装过上千款生物信息学软件的高手有时候也很痛苦各个软件的依赖关系,如果有省事的,我也比较乐意迁移我的习惯,但是,悲剧来了。
环境:AIX 6.1 + Oracle 10.2.0.4 现象:在做xtts测试时,源环境使用Oracle自带的perl执行xttdriver.pl报错如下:
当需要一次执行多个命令的时候,可以同时输入,不同命令之间可以使用分号“;”隔开,示例如下:
下载地址:http://dev.mysql.com/downloads/mysql/5.6.html#downloads
每个手册页面都有一个简短的描述。whatis 搜索手册页,显示匹配的手册页中 NAME 一节内容。
版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载。 https://blog.csdn.net/haluoluo211/article/details/77752331
周末宅在家里,捣鼓了一天,在本地用虚拟机搭建了 4 个 Linux 的集群环境,机器之间实现了相互访问。从此以后我的本地就有一套集群环境了,真正意义上可以模拟分布式的环境了!后面还可以模拟大型电商项目的高并发场景,美滋滋!
3.zlib 库提供了很多种压缩和解压缩的方式, nginx 使用 zlib 对 http 包的内容进行 gzip ,所以需要在 Centos 上安装 zlib 库。
mysql-5.6.34-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz (300MB+)
理论上在个人Windows电脑上面做生物信息学数据分析是不实际的,因为太多的生物信息学相关软件的开发者对windows并不熟练,没办法提供完善的基于windows操作系统的软件。 而且个人Windows电脑配置肯定不会太高,一般的组学测序数据都是10~500G一个样本,而且很多软件运行的时候对内存要求很高,最后这些数据的分析过程会非常耗时,个人电脑在硬盘,内存,cpu方面均不足以承担这个重任。
习惯了Windows电脑下的所见即所得,找到程序或文件双击即可运行或打开;于是我们被惯得以为电脑会像人一样聪明,给他一个名字就可以运行程序或打开文件;于是在命令行下或程序里不断碰壁,为啥这个命令不运行了呢?
sudo man man man命令的详细解释 man命令是Linux下的帮助指令,执行两次出现问题后输入下面的代码读取使用bin/sh
第 5 章 计算资源及编程 5.1 硬件配置 理论上在个人Windows电脑上面做生物信息学数据分析是不实际的,因为太多的生物信息学相关软件的开发者对windows并不熟练,没办法提供完善的基于windows操作系统的软件。 而且个人Windows电脑配置肯定不会太高,一般的组学测序数据都是10~500G一个样本,而且很多软件运行的时候对内存要求很高,最后这些数据的分析过程会非常耗时,个人电脑在硬盘,内存,cpu方面均不足以承担这个重任。 所以一般建议使用配置比较高的服务器,而且建议给服务器安装linux系
LAMP架构是目前成熟的企业网站应用模式之一,指的是协同工作的一整台系统和相关软件,能够提供动态web站点服务及其应用开发环境
linux的发行版非常多,其实本质上差别不大,哪怕是mac的OS应该是也是同样的管理操作模式。以下针对于ubuntu适用,当然ubuntu本身也有版本的区别,目前是16,我下面的操作是在12上进行的。 java1.7.0_03的安装 1、JDK官网上 http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html选择 2、将打开终端,建立目录: Sudo mkdir /usr/lib/java 3、将下载的jdk-7u3-linux-i5
声明:个人觉得文章不错,所以转载过来分享以及自己收藏,只是原出处已经无法查明,只能附上我见文章的地址:
相信你听过很多关于python的介绍,不论是朋友圈里或者各大广告都会说Python很好,python很强!
4、建立Go的工作空间(workspace,也就是GOPATH环境变量指向的目录)
1、virtual box 官网下载最新 (opens new window)(本次笔记使用的是 VirtualBox-6.0.4-128413-Win.exe),安装完成之后,需要先配置下虚拟电脑的默认位置:管理 -> 全局设定 -> 虚拟电脑位置
数值的比较操作符其含义与使用与数学中相同,而字符串的比较操作符则会对字符串从左到右进行一一对比,参照的是字符在ASCII编码或拓展到Unicode编码中的顺序(参照sort操作符),比较操作符会返回真(true)或假(false),如下所示:
centos7不支持mysql,内部集成了mariadb, 而安装mysql的话会和mariadb文件冲突,所以需要先卸载mariadb, 以下为卸载mariadb,安装mysql的步骤
该安装方式适合:mysql-5.6.33-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz 这个版本
Linux开源社区(微信号:cn_linux) 英文:Aaron Kili,翻译:Linux中国/ch-cn 链接:linux.cn/article-8618-1.html Shell 脚本编程 是你在 Linux 下学习或练习编程的最简单的方式。尤其对 系统管理员要处理着自动化任务,且要开发新的简单的实用程序或工具等(这里只是仅举几例)更是必备技能。 本文中,我们将分享 10 个写出高效可靠的 bash 脚本的实用技巧,它们包括: 1、 脚本中多写注释 这是不仅可应用于 shell 脚本程序中,也可用在
Shell 脚本编程是你在 Linux 下学习或练习编程的最简单的方式。尤其对系统管理员要处理着自动化任务,且要开发新的简单的实用程序或工具等(这里只是仅举几例)更是必备技能。 -- Aaron Kili
如果你和我一样,你可能在某一个地方有一个“沙盒”,你可以在那里进行你正在做的任何项目。随着时间的推移,沙盒会变得杂乱无章,充斥着各种想法、工具链元素、你不使用的代码模块,以及其他你不需要的东西。当你完成某件事情时,这会使你的部署变得复杂,因为你可能不确定项目的实际依赖关系 —— 随着时间推移你在沙盒中已经有了一些工具,但是你忘了必须安装它。你需要一个干净的环境,将所有的依赖关系放在一个地方,以便以后更方便。
在Linux的系统中经常碰到字符集导致的错误,下面总结了设置修改系统语言环境的方法。
Shell脚本语言是实现Linux/Unix系统管理及自动化运维所必须的重要工具,Linux系统的底层以及基础应用软件的核心大都涉及Shell脚本的内容。
Linux是一个多用户的操作系统。每个用户登录系统后,都会有一个专用的运行环境。 通常每个用户默认的环境都是相同的,这个默认环境实际上就是一组环境变量的定义。 环境变量是全局的,设置好的环境变量可以被所有当前用户所运行的程序所使用。 用户可以对自己的运行环境进行定制,其方法就是修改相应的系统环境变量。 环境变量有很多,需要重点理解的就是PATH,很多时候大家看到教程某些软件的使用,比如 mkdir -p ~/tmp/chrX_Y/hg19/cd ~/tmp/chrX_Y/hg19/#conda inst
Python(英语发音:/ˈpaɪθən/), 是一种面向对象、解释型计算机程序设计语言,由Guido van Rossum于1989年底发明,第一个公开发行版发行于1991年,Python 源代码同样遵循 GPL(GNU General Public License)协议[1] 。Python语法简洁而清晰,具有丰富和强大的类库。它常被昵称为胶水语言,能够把用其他语言制作的各种模块(尤其是C/C++)很轻松地联结在一起。常见的一种应用情形是,使用Python快速生成程序的原型(有时甚至是程序的最终界面),然后对其中有特别要求的部分,用更合适的语言改写,比如3D游戏中的图形渲染模块,性能要求特别高,就可以用C/C++重写,而后封装为Python可以调用的扩展类库。需要注意的是在您使用扩展类库时可能需要考虑平台问题,某些可能不提供跨平台的实现。
相信大部分的程序员都会使用过 Linux 的命令吧,比如我,用惯了 Linux 的命令回过头来用 Windows 的 cmd 就感觉不舒服了,而且 Linux 命令在 cmd 里面不能用 ? 用过
Node.js 发布于2009年5月,由 Ryan Dahl 开发,是一个基于 Chrome V8 引擎的 JavaScript 运行环境,使用了一个事件驱动、非阻塞式 I/O 模型,让 JavaScript 运行在服务端的开发平台,它让 JavaScript 成为与 PHP、Python、Perl、Ruby 等服务端语言平起平坐的脚本语言。
fyne 是一个用于 Go 语言的 GUI 包,它提供了一个简单而强大的界面构建框架。 fyne 的核心是一个事件驱动的渲染引擎,它可以轻松地创建具有丰富交互性的图形界面。该框架提供了丰富的内置控件,如按钮、文本框、标签、列表等,并且支持自定义控件的创建。 此外,fyne 还提供了一系列的工具和函数,用于处理界面事件、绘制图形、处理图像和字体等。它还支持跨平台开发,可以在 Windows、macOS 和 Linux 等多个操作系统上运行。 总的来说,fyne 是一个非常强大和灵活的 GUI 包,可以帮助开发人员快速创建具有高交互性的图形界面。它简单易用,并且具有很高的可扩展性,可以满足各种不同的界面需求。
本章的内容描述从源代码发布安装PostgreSQL(如果你安装的是打包好的版本如RPM或Debian包,那么请略过这一章并且阅读打包者的指导)。
网络配置的配置文件在/etc/sysconfig/network-scripts/下,文件名前缀为ifcfg-后面跟的就是网卡的名称,可以通过双TAB键查看然后编辑,也可以使用ifconfig查看,也可以使用命令:ls /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-*列出所有的设备
可见在权限位置有一个s权限。那么这个s的作用是什么呢? 答案是当其他用户执行该文件时,该文件会以root的身份执行。 这里就涉及到了Effective UID和Real UID以及Saved UID Effective UID: 程序实际操作时生效的UID Real UID: 执行该程序的用户的实际UID Saved UID: 在高权限用户降权后,保留的其原本UID (不展开说)
安装签名工具ldid 先确保安装了brew $ /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)" 利用brew安装ldid $ brew install ldid 修改环境变量 编辑用户的配置文件 $ vim ~/.bash_profile 在.bash_profile文件后面加入以下2行 export THEOS=~/theos export PATH=$TH
线上论坛和应用程序的验证码功能都是使用的ImageMagick,但是版本比较老(CentOS yum安装的ImageMagick6.5.9).接到最新漏洞预报,紧急升级!
python系列文章:https://blog.zeruns.tech/category/Python/
下载地址:http://www.erlang.org/download.html
文章目录📃 一、💾参考链接 二、📭Go+介绍概述 1、Go+简介💬 2、Go+特点💎 3、Go+优势🏆 三、🔑Go+安装与配置 前期准备🔊: 1、📗安装Go语言环境(以Linux系统为例) (1)下载并上传二进制包📘 (2)将二进制包解压至 /usr/local目录📙 (3)将 /usr/local/go/bin 目录添加至PATH环境变量📕 (4)验证Go环境是否配置成功📘 (5)创建go程序测试Go编程环境📗 正式安装🔊 2、🌈 拷贝 Git 仓库到本地 3、📚 执行./all.bash命令安装Go+
8复制解压目录下面的mysql.server文件到/etc/init.d/mysqld
Unity3D打包android应用程序时,如果不对DLL加密,很容易被反编译,导致代码的泄露。通常的做法是通过加密DLL或者对代码进行混淆。本文的所要探讨的是通过加密的方式来对DLL进行保护,并详细记录加密的操作过程。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云