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    分子对接教程 | (6) AutoDock对接操作与对接结果解读

    对接的中心坐标并不一定非常准确,只要对接的盒子包含了配体可能结合的最大区域即可。 ? 我这里没有详细去查,所以选择全部包裹。通过调整后,蛋白已被全部包裹。 ? 这里看不见蛋白了。...设置搜索参数和算法,在最后一个弹出框中,第一个选项,Number of GA Runs表示我们对接多少次,这里默认0次,官方建议对接50次以上,这里演示就设置10次。...设置对接参数 ? 接下来输出dpf文件。 ?...同样不能关闭这个窗口或点击Dismiss,这个过程会在工作目录产生一个相应的dlg格式文件,这个文件就是对接结果。 ? 在对接完成之后需要分析分子对接结果,也是做分子对接最重要的部分。...然后就显示了结果,但我们不是有10个对接结果吗,这里只显示一个。 ? ? 会弹出这么一个窗口 ? 然后按下图操作,显示对接信息。 ?

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