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「R」传统图形绘制

我们也可以在图像区域或外部区域使用一般在绘图区域使用的函数,不过有点麻烦。我们需要先设定 xpd 的状态。下面展示了一个例子:将绘制出的一个在两个图像之间穿越的矩形。...特殊情况 隐藏的坐标轴尺度 因为这个原因,在条形图和箱线图中添加图形输出会比较麻烦。为何做到这点,我们需要获取函数的返回值。这个值会给出函数绘制的每一个条形的中点 x 位置。...创建绘图函数 xy.coords()允许在新建的函数中灵活指定 x 与 y 参数。该函数接收 x 参数与 y 参数并且创建一个标准的包含 x 值、y 值以及坐标轴合理标签的对象。...一个新的绘图函数可能需要强制将 xpd 状态设定为 NA,从而在绘图区域外绘制线条和文本。这种情况下可以在函数的末尾恢复初始的绘图状态。...),提供了一个供他人使用的绘图函数的出发点。

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    判断数据是否服从某一分布(二)——简单易用fitdistrplus包

    ;boot,默认从数据的bootstrap样品中得到偏度-峰度点;method,默认“unbiased样品的无偏估计值,也可“sample",样品值;graph,是否图画出来;obs.col,点的颜色;...) # data,输入的数据;distr,待拟合的分布,偏度-峰度图上出现的分布,也可以是自己写的函数;method方法,默认mle(最大似然估计);start,如果有自己写的分布并且需要填入起始变量值的话...,start就是需要输入的分布起始值;fix.arg,指定待拟合分布的参数;discrete是否是离散的分布;keepdata,确定返回的是数据集还是数据子集,默认返回数据集;keepdata.nb,如果...keepdata值为FALSE,keppdata.nb的值决定长度大于多少的子集才返回。...三、实例 例一 引入《判断数据是否服从某一分布(一)》中例二。

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    R-tmap+grid 实现南海小地图的添加

    起初我在查阅tmap官网时也确实发现了类似功能的绘图函数tm_minimap() 。 ? 但在尝试 多次后始终无法实现。最终使用其他方法实现了该功能,也完美衔接tmap绘图体系。...2 tmap 绘制主要地图部分 南海小地图绘制 本部分的主要的绘图函数和之前的推文R-tmap绘制带有指北针和比例尺的空间地图 一样,此外,我们添加了单独绘制南海区域(即需要单独绘制的南海部分地图),主要代码如下...这也就是我们需要单独绘制的小地图。...3 grid 包实现南海小地图添加 这里使用了grid包中的viewport() 函数实现该效果,其主要包含的参数设置如下: x:viewport()导出图中心点横坐标x值。...此外,我们大致介绍了另一个绘制空间地图强大的R包cartography。希望大家可以掌握技巧并尝试使用其他包进行绘制。能力有限,大家可以进群讨论交流哦,偷偷告诉你,群里的大牛是真多哦

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    FFT_频谱分析(数字信号处理)

    经常需要进行谱分析的信号是模拟信号和时域离散信号。对信号进行谱分析的重点在于频谱分辨率及分析误差。频谱分辨率D和频谱分析的点数N直接相关,其分辨率为2π/N 。...(二)实验步骤 1.对以下序列进行频谱分析 为上三角有限长序列,序列长度为8; 为下三角有限长序列,序列长度为8。...),可以得出当FFT变换点数N为8 时, 和 频谱特性相同(见图3中的b1与b2),而N为16时, 和 频谱特性曲线不相同(见图3中的c1与c2)。...出现这两种不同情况的原因为 和 为序列为8的有限长序列(如图3的a1和a2)当取N为8时,将两个序列做周期延拓后发现 两个周期序列的波形仅存在相位上的差别,将 向右移动4个单位长度即可得到 ,即,因而两序列的频谱特性相等...当N=32或64时,观察时间Tp=0.5s或1s, 是周期的整数倍,所以会得到正确的频谱(如图4中b3和c3),频谱中有3根谱线正好对应位于4Hz,8Hz和10Hz。

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    RNA-seq 差异分析的点点滴滴(4)

    引言 本系列[1]将开展全新的转录组分析专栏,主要针对使用DESeq2时可能出现的问题和方法进行展开。 提升速度与并行计算的思考 对于大多数分析任务,上述步骤的耗时通常不会超过30秒。...需要注意的是,在DESeq2中使用glmGamPoi时,必须指定测试类型为"LRT",并定义一个简化的设计模型。 其次,用户可以利用并行计算的优势。...作为BPPARAM的另一种选择,用户可以在分析开始时注册核心,然后在调用函数时只需设置parallel=TRUE即可。...需要注意的是,结果函数会自动根据每个基因的标准化计数均值进行独立筛选,以优化在给定的假发现率(FDR)阈值,即 α 下,拥有调整后 p 值低于该阈值的基因数量。独立筛选的更多细节将在后文讨论。...在 DESeq2 中,可以通过在设计中包含已知的批次变量,或者使用 sva 包中的 svaseq 函数/包或 RUVSeq 中的 RUV 函数来估计并校正这些不希望的变异。

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    【MATLAB】基本绘图 ( 修改对象属性 | 修改坐标轴属性 | 修改坐标轴范围 | 修改文字大小 | 修改刻度 | 修改线属性 )

    | 创建对象时获取句柄值 | 函数获取句柄值 | 获取 / 设置 对象属性 | 获取对象属性 )二、获取对象属性 2、获取 坐标轴 对象属性 博客章节 , 获取 gca 坐标轴对象属性时 , 有 x...使用 set(句柄值, 属性值字符串, 属性值) 可以修改对应属性参数 ; 下面的代码就是修改坐标轴的显示范围 ; % 设置 x 轴显示范围 set(gca, 'XLim', [0, 2 * pi]...使用 xlim / ylim 函数也可以修改坐标轴显示范围 ; % 设置 x 轴显示范围 xlim([0, 2 * pi]); % 设置 y 轴显示范围 ylim([-1, 3]); 代码示例...: 3、修改坐标轴文字大小 上面获取 gca 坐标轴对象属性时 , 有 FontSize 字体大小属性 , 默认 10 像素 ; FontSize: 10 通过代码修改这两个属性值 , 使用 set...个数值 x = linspace(0, 2 * pi, 1000); % y 轴变量 y = sin(x); % 使用 h 变量接受 plot 函数绘制的曲线图像句柄值 h = plot(x, y

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    原创 | matplotlib画图教程,设置坐标轴标签和间距

    在上周的文章当中我们介绍了如何通过xlabel和ylabel设置坐标轴的名称,以及这两个函数的花式设置方法,可以设置出各种各样的名称显示方法。今天我们来介绍介绍其他的设置。...这个时候我们就可以使用xlim这个函数来设置x轴的范围,但是需要注意的是,我们在调用xlim的时候只是限制了x轴的结果,并没有限制y轴。...这也不是我吹,因为和这两个函数比起来前面介绍的xlim和ylim真的就只是个弟弟。 xlim能够设置的基本上只有坐标轴的范围,而xticks和yticks既可以设置范围也可以设置每个刻度之间的间距。...有的时候,自动绘制出来的图像的范围以及间隔可能没有那么好,需要我们进行调整,这时候就需要用到xticks和yticks函数了。 除了设置间隔和范围之外,xticks还可以设置标签以及标签的旋转角度。...从表面上来看xlim能做的事情xticks也都可以实现,但实际上这两者的应用场景其实是不同的,xlim的使用场景是当我们想要放大或者缩小图像的时候,使用xlim只需要传入上下界,而如果使用xticks则还需要指定间隔

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    离散傅立叶变换的Python实现

    正是因为傅立叶变换中这些“无穷”的特点,导致了其不能在计算机上实现,所以就出现了离散傅立叶变换。 现实世界中获得的数据,只能是有限的时间段,且我们只能针对其中有限个点进行采样。...为了获取连续函数的离散值,我们的抽取时间间隔取T_s。其实在做信号分析前,我们对信号是一无所知的。...使用Numpy创建三个不同频率、不同振幅的正弦函数y_0, y_1, y_2,然后将其相加合并成为一个函数y_3。...但是当我们对该函数进行DFT,从频域的角度我们会发现y_0, y_1, y_2函数中的振幅、频率信息仍然保存在函数y_3中。...这也就是为什么我们需要将函数返回的振幅值y_3_fft进行y_3_fft_norm = y_3_fft / N * 2后,才可以得到真正的振幅值。

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    还在对Matplotlib繁琐的图层设置感到烦恼!?快来看看这个Python绘图工具包吧

    是不是因常常记不住某一个图层设置函数而被迫看又长又枯燥的API文档?又或者是不是在面对多个matplotlib子图时写了大量的循环代码来设置属性?...ProPlot 库介绍 ProPlot 实例演示 ProPlot 库介绍 使用Python-matplotlib绘制图表时,默认的颜色以及格式主题只能帮助我们熟悉绘图函数,而想要设计出优秀的可视化作品...(无论是出版级别还是略带艺术气息) 都需要熟悉大量的绘图函数,如颜色、刻度、轴脊、字体等,当涉及绘制多子图时,这些操作都会耗费我们大量的精力,不经导致编写代码冗长,而且还易出错,具体可以查看下我之前的文章...除此之外,如果你每天都需要使用matplotlib绘图且经常需要对图表进行美化,那Proplot 绘图包就太适合你了,也不要担心会不适应,人家可是对matplotlib进行高度封装,极大简化绘图函数而已...只是简单的绘制,其他的设置也需要熟悉绘图函数,这里就给大家做个简单的演示。

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    Pandas可视化综合指南:手把手从零教你绘制数据图表

    在数据帧上进行操作的plot()函数只是matplotlib中plt.plot()函数的一个简单包装 ,可以帮助你在绘图过程中省去那些长长的matplotlib代码。...此外,Pandas中还有一个辅助函数pandas.plotting.table,它创建一个来自数据帧的表格,并将其添加到matplotlib Axes实例中。...坐标轴的设置 取值范围 使用xlim和ylim两个参数可设置x和y轴的范围。在折线图中,我们要将x轴设置为0到20,y限制为从0到100。...对数坐标 如果数据的跨度范围非常大,横跨好几个数量级,那么用线性坐标就无法很好地展示数据。这时候我们需要用到对数坐标,设置方法是将logx或者logy的值设置为Ture。...当subplot 设置为True 时,在设置一组title的值,即可在列表上方加入标题。

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    Pandas可视化综合指南:手把手从零教你绘制数据图表

    在数据帧上进行操作的plot()函数只是matplotlib中plt.plot()函数的一个简单包装 ,可以帮助你在绘图过程中省去那些长长的matplotlib代码。...此外,Pandas中还有一个辅助函数pandas.plotting.table,它创建一个来自数据帧的表格,并将其添加到matplotlib Axes实例中。...坐标轴的设置 取值范围 使用xlim和ylim两个参数可设置x和y轴的范围。在折线图中,我们要将x轴设置为0到20,y限制为从0到100。...对数坐标 如果数据的跨度范围非常大,横跨好几个数量级,那么用线性坐标就无法很好地展示数据。这时候我们需要用到对数坐标,设置方法是将logx或者logy的值设置为Ture。...当subplot 设置为True 时,在设置一组title的值,即可在列表上方加入标题。

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    Pandas可视化综合指南:手把手从零教你绘制数据图表

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    MATLAB 矢量图(风场、电场等)标明矢量大小的方法——箭头比例尺及风矢杆图的绘制

    在数值天气预报、气候模拟等领域,需要进行大量的运算,对算法的性能及硬件的处理速度比较关注。而MATLAB所使用的算法都是科研和工程计算中的最新研究成果。...美中不足的一点是,MATLAB的自带函数中,没有给矢量图绘制箭头比例尺的函数,这一点需要用户进行手动操作。...如下代码仍在Satellite投影上绘制了例1中的矢量场,所不同的是使用m_vec函数替代了m_quiver函数。...在使用get函数时,对象的后面再加上属性名称,即可获取相应的属性值,如获取风异常场的位置(‘position’)。...但该函数采用的标准不同,是5节画一短横,而我们的标准是2 m/s画一短横,使用时需要注意,画图时可将单位设为节、速度乘以2.5以适应我们的标准。

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    Pandas可视化综合指南:手把手从零教你绘制数据图表

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    Pandas可视化综合指南:手把手从零教你绘制数据图表

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    Pandas可视化综合指南:手把手从零教你绘制数据图表

    在数据帧上进行操作的plot()函数只是matplotlib中plt.plot()函数的一个简单包装 ,可以帮助你在绘图过程中省去那些长长的matplotlib代码。...此外,Pandas中还有一个辅助函数pandas.plotting.table,它创建一个来自数据帧的表格,并将其添加到matplotlib Axes实例中。...03 坐标轴的设置 1. 取值范围 使用xlim和ylim两个参数可设置x和y轴的范围。在折线图中,我们要将x轴设置为0到20,y限制为从0到100。...对数坐标 如果数据的跨度范围非常大,横跨好几个数量级,那么用线性坐标就无法很好地展示数据。这时候我们需要用到对数坐标,设置方法是将logx或者logy的值设置为Ture。...当subplot 设置为True 时,在设置一组title的值,即可在列表上方加入标题。 ?

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