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    python绘图 | 气象雷达入门级讲解&多种雷达图像可视化方法

    气象雷达是专门用于大气探测的雷达。它是一种主动式微波大气遥感设备。 气象雷达是气象观测的重要设备,特别是在突发性、灾害性的监测、预报和警报中具有极为重要的作用,是用于小尺度天气系统(如台风和暴雨云系)的主要探测工具之一。 在国内,我们最常见到和使用的气象雷达,是新一代多普勒天气雷达(CINRAD)。我们在气象局之类建筑楼顶上见到的那些球形建筑,大都属于这一种雷达。这种雷达可以探测反射率因子、多普勒径向速度、谱宽等基本气象要素,从而为短临尺度上的天气预报和预警提供数据支撑。特别是雷达反射率数据,因为其与强对流天气系统直接相关,最常被大家使用。 雷达数据在日常业务科研中的应用非常多,比如雷达数据可以用于数值模式同化中,为数值模式提供一个更加准确的初始场;基于雷达反射率数据的雷达短临预报系统可以预报未来2小时内,雷达探测范围内的强对流天气。例如,眼控科技自主研发的基于深度学习的AI对流临近预报系统就是利用雷达反射率数据,对未来两小时之内强对流天气,进行准确的预报。看了一下,下面的这个预报效果确实很好。

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    NeuroImage:任务态fMRI时间分辨的有效连接:共激活模式的心理生理交互

    用功能磁共振研究任务依赖的功能连接(FC)的调制对于揭示认知过程的神经性基质非常关键。目前大多研究方法假设任务期间是持续的FC,但最近研究发现这种假设太局限。虽然很多研究聚焦于静息态的功能动态,但基于任务的研究仍没有完全揭开网络调制。 此处,我们提出一个基于种子的方法通过揭示共激活模式的心理生理交互(PPI-CAPs)来探测任务依赖的脑活动调节。这个基于点过程的方法将任务调制的连接时间上分解为动态模块,这种动态模块当前的方法都无法捕捉,如PPI或动态因果模型。另外,它确定了单个frame分辨率共激活模式的出现,而非基于窗的方法。 在一个受试者看电视节目的自然设置中,我们找到了以后扣带回(PCC)为种子的共激活的几个模式,其发生率和极性在种子活动上或两者之间的交互上随观看的内容而改变。另外,我们发现跨时间和受试者的有效连接的一致性,让我们得以揭示PPI-CAPs和包含在视频中具体刺激之间的联系。 我们的研究表明,明确地追踪瞬态连接模式对于促进我们理解大脑不同区域在接收到一系列线索时是如何动态沟通的至关重要。

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    Research | 构建基于Transformer的集成框架实现蛋白相互作用位点准确预测

    本文介绍来自浙江大学药学院朱峰教授课题组发表在国际综合性学术期刊Research上的最新工作。该研究提出了一种基于Transformer和门控卷积残差神经网络的集成框架EnsemPPIS,仅需要蛋白质的序列信息即可准确识别潜在的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)位点。所构建的模型不仅有效提取残基所处的全局和局部序列环境特征,还利用Transformer算法的自注意力机制从蛋白质序列上学习残基相互作用信息,进而使用集成学习策略将多种特征进行有机整合,在多个基准数据集上实现了卓越的预测性能,并展示出广泛的适用性,能够应用于全蛋白质组范围内的PPI位点预测。此外,模型的可解释性分析证明了该模型具备从蛋白质序列中捕捉局部结构内残基相互作用信息的能力。EnsemPPIS有望加深人们对生理病理机制的理解,助力蛋白质功能研究,推动靶向药物,尤其是蛋白类药物的研发。

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    Drug Discov. Today | 生物信息学资源支持蛋白质-蛋白质相互作用的药物靶标发现

    今天为大家介绍的是来自杨光富团队的一篇论文。蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)对于多种细胞性过程至关重要,为药物靶点发现提供了一个有前景的途径。PPIs的特征是多层次的复杂性:在蛋白质层面,可以利用相互作用网络来识别潜在的靶点;而在残基层面,可以利用单个PPIs的相互作用细节来检查一个靶点的可药性。在通过多层次PPI相关的计算方法进行靶点发现方面,已经取得了巨大的进展,但这些资源尚未得到充分讨论。在这里,作者系统地调查了用于识别和评估潜在药物靶点的生物信息学工具,检查它们的特性、限制和应用。这项工作将帮助将更广泛的蛋白质到网络的上下文与详细的结合机制分析相结合,以支持药物靶点的发现。

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