本公众号之前已发过《离线安装PySCF程序》一文,可在“文章分类->软件教程->PySCF”中查看。当时的安装教程适用于PySCF 1.5之前的版本,而在1.5及之后,由于需要版本更高的xcfun库,若仍按前文安装会出现XC_PARTIAL_DERIVATIVES变量未定义等问题。现更新适用于PySCF 1.5及之后版本的安装教程。
平均场计算是 PySCF 程序包里优化得比较并全面的模块之一。在平均场模块里,PySCF支持 RHF, UHF, ROHF, GHF, RKS, UKS, ROKS, GKS 等一系列方法来研究闭壳层体系、开壳层体系、复数哈密顿量体系、相对论效应、溶剂化效应。同时 PySCF 提供了大量的辅助功能来帮助平均场计算收敛。以下我们通过一些例子来演示在 PySCF 里收敛平均场计算的技巧。
PySCF联网在线安装只需pip install pyscf一行命令即可,能联网的建议通过联网安装。本文介绍的是离线安装步骤,适合不允许联网或很难联网的内部节点。读者在开始编译前需确认自己机子上有gcc和g++编译器,有MKL数学库,以及cmake软件。运行如下命令可查看自己机子上是否存在
由于PySCF程序更新较为频繁,不少小伙伴反映按照本公众号之前发过的离线安装教程《离线安装PySCF程序(1.5及更高版本)》经常会出现编译无法通过等问题,因此再次更新一下安装教程。作为一款量子化学软件,PySCF现在十分强大,支持的功能非常多,此处随意列举几个:
MOKIT是免费、开源的轨道转换和接口程序,提供各种小程序和模块,能够在常见量子化学软件间传递分子轨道。其中的automr程序可以进行多参考态方法的自动化、黑箱式计算,详细介绍见《自动做多参考态计算的程序MOKIT》。近期笔者和另一开发者wsr在MOKIT程序中加入了fchk(),py2molpro,py2molcas,py2qchem等模块,可用于从PySCF程序向其他量子化学程序传递分子轨道。尤其是通过fchk()产生.fch文件,可方便地用于轨道可视化、波函数分析。
XYG3型泛函是一类重要的双杂化泛函,包括XYG3, XYGJ-OS, XYG7等。其中XYG3泛函由张颖、徐昕和W. A. Goddard III于2009年在PNAS杂志上发表。由于这类泛函使用了不同泛函来计算密度和能量(即能量泛函是非自洽的),使得用户往往不能简单地在常见程序中使用。目前,通过内置或非内置的形式可以做XYG3型泛函计算的程序包括但不限于:Q-Chem, Gaussian, PySCF, FHI-aims, ORCA, ...
由于CASCI/CASSCF计算量随活性空间呈指数增长,超过(16,16)的计算在高配机器上几乎不可能。近似求解大活性空间的方法通常有DMRG, selected CI等等。Block-1.5是做DMRG计算的经典程序,由Sandeep Sharma和Garnet Chan开发,虽然早在5年前就不更新了,但其计算速度仍高于很多同类程序。Block-1.5一般结合PySCF使用,可以进行DMRG-CASCI,DMRG-CASSCF和DMRG-SC-NEVPT2等计算。笔者之前在公众号上将该程序的安装拆分为几篇短文
如文献[1]所指出,不同PBC-HF程序之间的严格对比是不可能的,原因包括不同的实现方法、不同的优化水平、不同的license类型等。本文对比了几个PBC-HF程序对金刚石3-21G的计算结果。结果先列在下表里,后文再稍微做点分析。其中Gaussian、CRYSTAL和PySCF的结果是笔者算的,MPQC的结果来自文献[1],未给出Gap和
李林 编译自 Google Research Blog 量子位 出品 | 公众号 QbitAI 各大公司前赴后继入局的量子计算,最初源于科学家一个朴实而宏大的愿景: 根据量子力学规则来操作一台计算机,
本文主要介绍一下如何利用常见的程序做轨道局域化(也称定域化),为后续多参考态计算系列篇做点铺垫。轨道局域化的简介可参看《局域分子轨道简介》一文。至于如何自己写轨道局域化的代码,这又是另一个话题,以后再介绍。
Wannier函数是周期性体系里和分子轨道对应的概念。很多固体物理教材都详细介绍了Wannier函数,如南京大学教材《固体理论》[1]的第八章。Wannier函数定义为Bloch函数的一个傅立叶变换:
最常见的Spin-flip方法为SF-CIS和SF-TDDFT,它们一般以高自旋三重态为参考态波函数,将一个alpha电子翻转为beta电子,产生满足<
本公众号之前发过几篇多组态(multi-configurational)方法的介绍:
在使用量子化学软件时基本上都需要进行自洽场(SCF)迭代计算,一些时候会遇到SCF不收敛的情况,在这里将详细介绍Amesp软件中解决SCF不收敛时的办法,其中大多数关键词都是在“>scf”模块中设置。
2022年11月30日,法国约瑟夫傅立叶大学的研究者在Journal of Chemical Information and Modeling上发表论文pDynamo3 Molecular Modeling and Simulation Program。论文详细介绍了作者开发的基于Python的分子建模与模拟程序--pDynamo3。
本公众号之前发过自然轨道的原理介绍,详见《从密度矩阵产生自然轨道-理论篇》和《S^(1/2)的一些性质》。对其中原理和公式熟悉的读者,可以自己编写代码从密度矩阵产生自然轨道,无需阅读本文。笔者也写过这部分代码,可以提供一个参考
本篇文章中我们讨论XYG3型泛函在ORCA中的使用方法。关于XYG3型泛函的介绍可见上期链接。
在自己写量化程序或者验证量化方法的时候,需要使用到各种类型的电子积分。电子积分计算比较复杂,程序编写的门槛很高。而调用其他的程序(如PySCF)的时候也需要读懂程序的接口,这种方式也不是很方便,门槛也高。本文将介绍使用Amesp很方便地计算并提取多种类型的电子积分,帮助读者验证自己的方法以及对标自己程序的结果。
本公众号前期发过两篇CASSCF方法计算的入门教程《用Gaussian做CASSCF计算》和《激发态计算之如何选取特定的分子轨道作为活性空间》。若有读者从未接触过CASSCF计算,建议先看上述两篇介绍。一个较为顺利的CASSCF计算强烈依赖于以下两个因素,缺一不可:
(1)在ORCA中进行了RIJK或RIJCOSX加速的大体系HF/DFT计算,想传轨道给其他程序进行后续计算,或想产生fch文件方便可视化。
XYG3型泛函没有内置在主流的Gaussian、ORCA等程序中,因此需要一些其他方法来进行XYG3泛函的计算。我们曾经推送过两篇关于如何在Gaussian、PySCF、ORCA中实现XYG3泛函的计算。本文将在前文的基础上,更详细地介绍如何使用由张颖老师(XYG3泛函的主要开发者之一)开发的xDH4Gau程序来进行XYG3型双杂化泛函的计算。
设立CCF-腾讯犀牛鸟基金线上学术报告交流活动,其主要目的是为参与基金项目的青年学者、企业研发专家及项目相关的研究型人才提供一个广泛而专业的学术交流平台。 项目组将定期邀请学界学者与企业研发专家举行在线或线下学术研讨会,讨论专项研究课题,分享最新的研究及实践成果。 基金期待大家在这个平台上自由地进行分享,理性地进行讨论,从而碰撞出更为闪耀的学术火花。通过丰富的学术与思想交流,基金期待更好地助力参与者在产学研合作过程中拓宽学术视野,提升实践能力,为科技自主研发的探索和创新储备能量。 报告时间:2019年
假如一个python项目需要依赖于numpy==1.20.1的版本,另一个python项目必须依赖于numpy==1.20.2的版本。虽然我们也可以直接使用docker或者其他的容器方案来隔离编程环境,但是这会消耗比较大的资源,因为我们并不需要重新构造一整个系统。因此python也提供了一种更加优雅的解决方案:使用virtualenv来构造一个虚拟的python库的环境,这里面我们可以定制化自己所需的python依赖的版本。比较详细的virtualenv使用方法可以参考官方文档,这里我们仅做一些简单的使用方法的介绍和演示。
前言 SCF云函数对于我来说真的是非常好用,原先部署在服务器上的一些处理数据的函数可以直接交付给SCF来处理,省了很多服务器的费用。现在腾讯云可以免费试用SCF个人高级版三个月https://clou
SCF CLI 是腾讯云无服务器云函数 SCF(Serverless Cloud Function)产品的命令行工具。通过SCF命令行工具,用户可以方便的实现函数打包、部署以及本地调试,并在本地生成云函数的项目并基于 demo 项目进一步的开发。
| 导语 本文主要介绍腾讯云Serverless SCF云函数中Custom Runtime怎样解锁语言限制,以及通过实例说明如何使用SCF Custom Runtime。 引言 SCF作为腾讯云Faas核心产品,支持javascript, python, php, java, go等多语言函数。但是,在实际使用过程中。我们从用户方面发现以下问题: - 更多语言支持。我们时常会收到来自内外的各种关于编程语言的咨询,比如SCF是否支持dotnet, rust, deno甚至C等多种语言环境 - 关于现有语
导语 | 云函数 SCF 是腾讯云为企业和开发者们提供的无服务器执行环境,帮助大家在无需购买和管理服务器的情况下运行代码。但是 SCF 在使用过程中经常会受到开发语言方面的限制,造成拓展性和成本上的问题。本文就将为大家介绍使用 Custom Runtime 来解锁 SCF 语言限制,希望与大家一同交流。文章作者:臧琳,腾讯云Serverless 研发工程师。 一、背景 SCF 作为腾讯云 FaaS 核心产品,支持 javascript、python、php、java、go等多语言函数。但是,在用户实际
昨晚,将逐飞科技RT1021开源库下载后,试着把里面的一个工程编译了一下,结果出现了一个错误:.\scf\RT1021_nor_zf_ram.scf(11): error: L6236E: No section matches selector - no section to be FIRST/LAST.
Linux du命令也是查看使用空间的,但是与df命令不同的是Linux du命令是对文件和目录磁盘使用的空间的查看,还是和df命令有一些区别的.
nginx 动态修改upstream不reload nginx模块,ngx_http_dyups_module分析。
登录腾讯云Serverless 控制台,单击左侧导航栏的函数服务可以创建云函数,也可以单机左侧导航栏的Serverless 应用来新建应用
比如常用的可以用json文件,XML文件,或INI文件,YAML文件,properties文件等存储配置信息。
执行 scf --version 命令进行验证 => scf CLI, version 0.0.1
1).UE向MME发起附着请求Attach Request。Attach Request消息中与VoLTE相关的关键信元
SharedPreferences是Android平台上一个轻量级的存储类,用来保存应用的一些常用配置,好用且强大,但是某些情况下不是很好用。
使用name选项 文件名选项是find 最常用的选项,要么单独使用该选项,要么和其他选项一起使用。 可以使用某种文件名模式来匹配文件,记住要用引号将文件名模式引起来。不管当前路径是什么,如果想要在自己的根目录$HOME中查找文件名符合*.log的文件,使用~作为 'pathname'参数,波浪号~代 表了你的$HOME目录。
当前Serverless热度越来越高,越来越多的开发者们开始抛弃传统开发模式基于Serverless来搭建自己的产品服务。在享受腾讯云Serverless产品SCF的免运维、低成本优势的同时,也要适应SCF与传统开发模式的差异。其中DevOps便是很重要的一环,因为SCF特有的runtime,使得开发者无法复用现有DevOps平台完成CI/CD流程。
云厂商(腾讯云、Azure等)提供了Serverless服务,借助于Serverless,开发人员可以更加专注于代码的开发,减少运维的成本。腾讯云的函数计算提供了很多运行库,对.NET的支持需要通过custom runtime 来支持,可以支持任何版本的.NET Core,也就是需要自定义runtime,需要使用到函数计算的custom runtime功能,具体参见https://cloud.tencent.com/document/product/583/47274。 本文主要介绍一下使用ASP.NET CORE 3.1部署在腾讯云Serverless(函数计算)的内容。
在云函数(Serverless Cloud Function,SCF)已支持的开发语言及版本的标准运行环境外,为了满足更多个性化开发语言及版本的函数实现,SCF 提供了 Custom Runtime 服务,即可定制化运行环境。通过开放实现自定义函数运行时,支持根据需求使用任意开发语言的任意版本来编写函数,并实现函数调用中的全局操作,如扩展程序的加载,安全插件,监控 agent 等。SCF 与 Custom Runtime 通过 HTTP 协议通信完成事件的响应处理。
导语 为了满足用户日益增长的日志存储大小,不影响用户的写入和查询性能。满足不同用户写入流量。同时用户日志长期保存,日志存储比较占用空间和成本。ES集群规格配置高,消耗资源和成本。我们基于Go语言设计了一个多用户多ES集群,日志备份到cos节省成本的方案。本篇实践基于Go语言编程。 索引设计 为了防止单个索引不断增加。影响ES集群查询写入性能,ES 集群的索引设计主要采取如下方式: 1. 租户分离:将索引按照租户进行分离,避免不同租户之间的数据混淆,提高 ES 集群的数据安全性和隔离性。 2. 按月分割:将索
LTE用户通过LTE网络发起呼叫,被叫域选为LTE网络的呼叫过程可以分为如下几个阶段:
SCF CLI 是腾讯云云函数(Serverless Cloud Function,SCF)产品的命令行工具,想必很多小伙伴已经有所了解,或者试用过了。作为一个可以提高开发者效率的工具,腾讯云 Serverless 团队一直在对 SCF CLI 进行优化工作,本文将给大家介绍新版 SCF CLI 增加的有趣功能! ---- 介绍 一、Deploy 功能优化 1:部署可以选择默认 COS 只需要在设置的时候,设置 using-cos 就可以,当然也可以 scf configure set --using-c
一、背景 腾讯 KonaJDK 团队最近对外开源了KonaJDK11, 该版本 JDK 是经过内部超大规模生产环境验证的定制 JDK,该版本在启动性能、峰值性能以及事物处理能力方面,相对于前一版本 Kona JDK8 都有了综合性提升,沉淀了腾讯云与大数据团队在大数据/机器学习、云原生场景下的深度优化,并且通过了 JCK 验证,确保充分的 Java SE 标准兼容。通过工业标准 Benchmark 表明,Kona JDK11 对比 Kona JDK8 大多数场景在峰值性能上具有非常明显的提升,个别性能提升
腾讯云无服务器云函数(Serverless Cloud Function,SCF)是腾讯云为企业和开发者们提供的无服务器执行环境。
Android中虽然提供了SharedPreference类方便的对配置文件进行操作。但是好用吗?
数字时代,云计算正在以中枢神经的角色成为企业数字化转型的胎生力量,而云原生技术作为云计算中枢神经整体实现的关键技术内核正在对数字经济基础设施底座的粘性、韧性、弹性发挥决定作用,利用云原生技术、架构、理念构建数字化新底座正在成为各行各业数字化转型的实践重点。
认证链接 腾讯云CloudLite认证 腾讯云 Serverless 基础认证 目录 在线学习 Serverless基础认证课程介绍 Serverless 概念介绍 Serverless 的价值 腾讯云 SCF 产品概述 腾讯云 SCF 使用场景 动手实践 SCF 控制台的基本操作 SCF 控制台的基本操作实验手册 证书展示 [证书] 知识点摘记 serverless是下一代计算服务 serverless降低服务器开销、降低服务器运维成本 基于serverless的应用运维方式 可用性:托管至云端,自动进行
Github Actions是Github近来推出的新功能,能够自动化构建,部署我们的github项目。
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