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计算矩阵全1矩阵的个数

思路如下: 利用i, j 将二维数组的所有节点遍历一遍 利用m, n将以[i][j]为左上顶点的矩阵遍历一遍 判断i, j, m, n四个变量确定的矩阵是否为全1矩阵 代码实现: int numSubmat...0; i < matSize; i++) { for (int j = 0; j < *matColSize; j++) { // 遍历当前节点为左上顶点的所有矩阵...matSize; m++) { for (int n = j; n < *matColSize; n++) { // 判断当前矩阵是否为全...在最后判断是否全1的循环中, 如果左上的数字是0, 那必然没有全1矩阵了 再如果向下找的时候, 碰到0, 那下一列的时候也没必要超过这里了, 因为矩阵至少有一个0了, 如下图: ?...0) continue; int thisMaxColSize = *matColSize; // 当前向右最大值 // 遍历当前节点为左上顶点的所有矩阵

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如何文本数据中提取列表

提取文本数据列表可以通过各种方式实现,具体取决于文本数据的结构和提取列表的条件。...我们需要将这些信息提取出来,并将其分为三个列表:名言列表、事实列表和宠物列表。我们使用了一个简单的Python脚本来读取文本文件并将其分割成多个子列表。...这导致我们得到了一个错误的列表结构。2、解决方案为了解决这个问题,我们需要在分割文本文件时,忽略换行符。我们可以使用Python的strip()方法来删除字符串的空白字符。...,并将其分为三个列表:名言列表、事实列表和宠物列表。...be narrowed down by gender.​Pet of the Day​Scottish Terrier​Land Shark​Hamster​Tse Tse Fly​END在上述得方法的选择取决于你的数据结构和提取需求

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NT_NR数据库中提取

1 首先下载NCBI的taxonomy数据库 下载完解压缩,其中names.dmp和nodes.dmp两个文件很重要,是后续提取库的基础 2 下载NCBI的TaxonKit软件,http://bioinf.shenwei.me...系统也是直接解压,即可使用 4 (选择性步骤)NCBI taxonomy数据库下还有accession2taxid库,这个库里面也有蛋白以及核酸的accession以及对应的分类id,但是经过尝试,采取这种方法提取库序列往往出乎意料的少...,很可能是该库的accession与NT/NR库的accession不一致,前者可能冗余更多,因此该方法可忽略,见仁见智吧,下面给个例子,例如: #taxonomy数据库的nucl_wgs.accession2taxid...库提取完整的nt序列,并提取库序列 blastdbcmd -db $NT -dbtype nucl -entry all -outfmt "%f" -out - | pigz -c > nt.fa.gz...这种NT库还原的nt.fa序列里面有很多重复的头文件,例如 所以使用的话,还需要写个perl把这些序列拆开,最终形成nt.anmail.fa.gz 8 如果直接想构建库,那么没必要搞序列,直接运行

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NT_NR数据库中提取

思来想去,还是NT库入手,打算把NT库所有动物的序列或者所有小鼠的序列提取出来,做成一个库,用来去除宿主污染。 百度了一下提取库的方法,大多都是人云亦云,干脆还是自己整理整理。...下面是一些步骤 1 首先下载NCBI的taxonomy数据库 下载完解压缩,其中names.dmp和nodes.dmp两个文件很重要,是后续提取库的基础 2下载NCBI的TaxonKit软件,http...,很可能是该库的accession与NT/NR库的accession不一致,前者可能冗余更多,因此该方法可忽略,见仁见智吧,下面给个例子,例如: #taxonomy数据库的nucl_wgs.accession2taxid...库提取完整的nt序列,并提取库序列 blastdbcmd -db $NT -dbtype nucl -entry all -outfmt "%f" -out - | pigz -c > nt.fa.gz...这种NT库还原的nt.fa序列里面有很多重复的头文件,例如 所以使用的话,还需要写个perl把这些序列拆开,最终形成nt.anmail.fa.gz 8 如果直接想构建库,那么没必要搞序列,直接运行

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python矩阵的转置_Python矩阵转置

Python矩阵转置 via 需求: 你需要转置一个二维数组,将行列互换....讨论: 你需要确保该数组的行列数都是相同的.比如: arr = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9], [10, 11, 12]] 列表递推式提供了一个简便的矩阵转置的方法:...Getrows方法在Python可能返回的是列值,和方法的名称不同.本节给的出的方法就是这个问题常见的解决方案,一个更清晰,一个更快速....在列表递推式版本,内层递推式表示选则什么(行),外层递推式表示选择者(列).这个过程完成后就实现了转置....在zip版本,我们使用*arr语法将一维数组传递给zip做为参数,接着,zip返回一个元组做为结果.然后我们对每一个元组使用list方法,产生了列表的列表(即矩阵).因为我们没有直接将zip的结果表示为

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python subprocess运行的进程实时获取输出

起因是这样的,c++程序开发后 功能号和指令,校验需要人工去看对照二进制代码,量大还费力, 于是打算利用python 去调用 c++程序去校验指令, 首先要做的就是用python 获取c++程序的...printf() 或cout 的输出; 环境linux python 3.8.x 以下代码实现,获取子程序输出 command='....shell指令,如果要用shell 指令如ls 要将false 变成true, 通过指定stderr=subprocess.STDOUT,将子程序的标准错误输出重定向到了标准输出,以使我们可以直接标准输出同时获取标准输出和标准错误的信息...p.poll() 返回进程的返回值,如果为None 表示 c++进程还未结束. p.stdout.readline() c++的标准输出里获取一行....参考文章1 python的subprocess.Popen()使用 参考文章 2 python subprocess运行的进程实时获取输出

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使用PythonPDF文件中提取数据

01 前言 数据是数据科学任何分析的关键,大多数分析中最常用的数据集类型是存储在逗号分隔值(csv)表的干净数据。...然而,由于可移植文档格式(pdf)文件是最常用的文件格式之一,因此每个数据科学家都应该了解如何pdf文件中提取数据,并将数据转换为诸如“csv”之类的格式,以便用于分析或构建模型。...在本文中,我们将重点讨论如何pdf文件中提取数据表。类似的分析可以用于pdf文件中提取其他类型的数据,如文本或图像。...我们将说明如何pdf文件中提取数据表,然后将其转换为适合于进一步分析和构建模型的格式。我们将给出一个实例。 ?...02 示例:使用PythonPDF文件中提取一个表格 a)将表复制到Excel并保存为table_1_raw.csv ? 数据以一维格式存储,必须进行重塑、清理和转换。

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