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    第二代测序原理的详细解析!

    第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughput sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序,而二代测序开创性的引入了可逆终止末端,从而实现边合成边测序(Sequencing by Synthesis)。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱基所携带的特殊标记(一般为荧光分子标记)来确定DNA的序列,现有的技术平台主要包括Roche的454 FLX、Illumina的Miseq/Hiseq等。由于在二代测序中,单个DNA分子必须扩增成由相同DNA组成的基因簇,然后进行同步复制,来增强荧光信号强度从而读出DNA序列;而随着读长增长,基因簇复制的协同性降低,导致碱基测序质量下降,这严格限制了二代测序的读长(不超过500bp),因此,二代测序具有通量高、读长短的特点。二代测序适合扩增子测序(例如16S、18S、ITS的可变区),而基因组、宏基因组DNA则需要使用鸟枪法(Shotgun method)打断成小片段,测序完毕后再使用生物信息学方法进行拼接。

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    如何用好21世纪最火的神兵利器——“屠龙刀”和“倚天剑”?

    看过金庸先生《倚天屠龙记》的朋友们都知道,书中有两大神兵利器分别是:屠龙刀和倚天剑,相传能同时拥有这两件兵器的人在当时就可以称霸武林。同样在科技飞速发展的现在也存在着两把重量级的神兵,也是最近这几年备受关注的两大主要技术:人工智能和区块链。那么如何进一步驾驭和结合好这两大技术,并在行业中创造出新的产品模式。本篇要给大家展示的就是两者的结合点和方式。 刀剑合璧 要想结合这两大技术,必须要清楚地了解两者各自所具有的特点,然后找到共同点,并以此作为切入点将两者结合起来,这就像和陌生人交流沟通一样,需要先找到共同话

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    MicroRNA 的结构、生物合成及功能

    大多数miRNA位于mRNA宿主基因的内含子中,并共享调控元件、初级转录物,因此具有相似的表达模式。miRNA通过RNA聚合酶II被转录为名为pri-miRNA的初级转录产物,并包含5'端帽子和polyA尾巴。pri-miRNA在细胞核经过由RNase III酶Drosha和双链RNA结合蛋白Pasha/DGCR8组成的复合物处理得到长度约为70个核苷酸的pre-miRNA,折叠成茎环结构。然后pre-miRNA通过karyopherin exportin 5(Exp5)转运蛋白输出到细胞质中。一旦进入到细胞质中,pre-miRNA经过RNAse III酶Dicer的加工产生长度约为22个核苷酸的双链RNA。Dicer同时也启动了RNA诱导沉默复合物(RISC,RNA induced silent complex)的形成。RISC会介导miRNA表达和RNA干扰而产生的基因沉默。

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