首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

bismark 识别甲基化位点

在bismark中,根据甲基化的C所处的上下文环境,分成以下3类; CpG CHG CHH p代表磷酸二酯键,CpG指的是甲基化的C的下游是1个G碱基。...H代表除了G碱基之外的其他碱基,即A, C, T中的任意一种,CHG代表甲基化的C下游的2个碱基是H和G, CHH表示甲基化的C下游的两个碱基都是H。 ?...默认情况下,软件会自动根据两个因素生成结果文件 甲基化的C的类型 就是前面提到的CpG, CHG, CHH 3种类型 比对情况 包括比对到四条链上OT, OB, CTOT, CTOB 4种情况 所以会生成...不同字母表示不同的甲基化C: X 代表CHG中甲基化的C x 代笔CHG中非甲基化的C H 代表CHH中甲基化的C h 代表CHH中非甲基化的C Z 代表CpG中甲基化的C z 代表CpG中非甲基化的...C U 代表其他情况的甲基化C(CN或者CHN) u 代表其他情况的非甲基化C (CN或者CHN) 对于CpG, 采用字母X的大小写来表征甲基化状态;对于CHG, 采用字母H的大小写来表征甲基化状态;

1.7K10

如何获取沪深股市历史数据并入库

利用Tushare大数据社区的数据接口: 1、注册用户,并完善资料,以获取最低的积分要求; 2、获取token,作为获取数据的唯一凭证; 3、利用python脚本采集入库。...能力要求: 1、会使用mysql数据库 2、熟悉python基础语法 一、注册用户 (1)注册的操作很简单,参考平台的说明,注册完成后可获得100积分,链接如下: https://tushare.pro...doc_id=39 三、获取数据并入库 接下来主要就是一套python代码的事了,下面以采集最近一年内日线数据为例做详细说明。...DEFAULT NULL COMMENT '收盘价', `pri_close_pre` decimal(18, 2) NULL DEFAULT NULL COMMENT '昨收价', `am_chg...` decimal(18, 2) NULL DEFAULT NULL COMMENT '涨跌额', `pct_chg` decimal(18, 2) NULL DEFAULT NULL COMMENT

76240

CDISC ADaM BDS标准下,如何选择合适的准则变量(AVALCATy CRITy MCRITy)

在ADaM BDS结构的数据集中,比如ADLB, ADVS, ADEG,经常需要对AVAL/CHG/PCHG是否满足某一个准则进行判断。IG提供了很多种变量,可以用来存放这些准则。...AVALCATy, CHGCATy, PCHGCATy 判断准则只能来源于一个变量,即AVAL/CHG/PCHG。 判断结果可以是多值 在一个PARAM下,所有的变量值必须一致。...Pinnacle 21检查:在一个PARAM内,对于要分类的变量(AVAL/CHG/PCHG)的唯一值,相应的CATy值必须也相同。...CRITy 判断准则可以来源于多个变量,如判断AVAL和CHG同时满足某准则。 判断结果只能是二元变量(Y/N)。 在一个PARAM下,所有的CRITy变量值必须一致。...MCRITy 判断准则可以来源于多个变量,如判断AVAL和CHG同时满足某准则。 判断结果可以是多值 在一个PARAM下,所有的CRITy变量值必须一致。在不同PARAM下,值可以不同。

49410
领券