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end motifs分析:血浆DNA End-Motif Profiling as a Fragmentomic Marker

., preferred fragment end motifs。...即人类血浆中cfDNA的end motifs是否代表了一种独特类型的血浆DNA片段特征,血浆cfDNA的end motifs是否可以作为癌症诊断的一种指标。...end motifs定义如下: 3端突出的片段进行消化,5端突出的片段进行延长补齐,文库构建时不进行片段大小选择,保证了最后测序得到的数据保留了原始的5端序列特征。...通过WGS并计算end motifs的频率,得到一个类似表达谱的矩阵,总共包括4^4,即256个motif的谱: 随后,针对这个end motifs profile进行各种分析,比如 某个end motifs...血浆DNA end motifs的Classification性能 为了进一步探索是否可以利用血浆DNA end motifs 建立一个分类器来检测癌症患者,我们基于256个血浆DNA end motifs

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