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关于分子力场中键能项和角能项的思考

而势能表达式前的系数 \frac{1}{2} 主要是为了使得力的形式符合胡克定律,更方便理解,但实际上很多力场中把这个系数融入到了参数 k_b 中,且 k_b>0 。...再计算 k_b(\textbf{r}_B-\textbf{r}_A) 再计算 k_bb(\textbf{r}_B-\textbf{r}_A) ,一共是 6P 次乘法运算。...如果我们选择用CPU上(如果选择用GPU计算,那么评估标准会有所不同)的Python来计算一个bond force的话,那么就可能有这么几种思路: 用现有的自动微分框架,只需要实现一个bond_energy...的计算函数,就可以自动求得每个原子上的力; 用for循环来实现一个bond_force函数,使得计算满足最低的复杂度要求; 用Python的向量化运算来实现一个vector_bond_force函数,可以直接调用比较成熟的...总结概要 本文介绍了在分子力场中经常有可能被使用到的键长和键角项的谐振势模型,并且分别从自动微分的Python代码实现以及解析形式的矢量化编程形式给出了初步的实现方案。

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    上知天文,下晓地理!

    既然要实现算法必然离不开代码,对于数据分析以及数据可视化做的最好的也就是 Python 了,但是仅仅使用 Python 的数据分析以及数据可视化的模块或者包远远不够,天文学的东西太多了,如果一个一个自定义根本不切实际...,于是有人想到要把这些天文学的东西封装起来,然后就出现了即将要讲解的 Python 模块——astropy。...01 上知天文 我们首先来看一下模块 astropy,astropy 是一个社区的针对天文学的 Python 库。...astropy 包包含关键的功能和用 Python 进行天文学和天体物理学研究的工具。...8.85418782e-12 F/m 电常数 g0 9.80665 m / s2 标准重力加速度 h 6.62607004e-34 J s 普朗克常数 hbar 1.0545718e-34 J s 约化普朗克常数 k_B

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    PythonPython 包 ① ( Python 包引入 | Python 包概念 | Python 包结构 | 创建 Python 包 | 导入 Python 包 )

    一、Python 包简介 1、Python 包引入 之前 介绍了 Python 模块 , 每个 Python 源码文件 , 都可以定义为一个 Python 模块 ; 如果 定义的 Python 源码模块很多..., 有几百上千个 , 则会出现管理繁琐 , 混乱的问题 ; 这里引入 新的代码结构 " Python 包 " ; 2、Python 包概念 Python 包 概念 : 包是 Python 模块 Module...的扩展 , 将若干 相关的 Module 模块 组织起来 形成一个 Python 包 , 可以更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 在 Python 包中 可以 定义 变量 / 函数 / 类..., 可以 更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 除了 自定义 Python 包之外 , Python 还提供了 Python 标准库 和 其他人编写的第三方 Python 包 来扩展 Python...包 右键点击 PyCharm 中的 Python 工程根目录 , 选择 " New / Python Package " 选项 , 输入 Python 包名称 , 然后点击回车 , 创建 Python

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    PythonPython模块基础

    1、模块的四种形式 在Python中,总共有以下四种形式的模块: 自定义模块:如果你自己写一个py文件,在文件内写入一堆函数,则它被称为自定义模块,即使用python编写的.py文件 第三方模块:已被编译为共享库或...自定义模块,将我们自己程序中用到的公共功能,写入一个python文件,然后程序的各部分组件可以通过导入的方式来引用自定义模块的功能。...\Python38\python38.zip # C:\Python\Python38\DLLs # C:\Python\Python38\lib # C:\Python\Python38 # C:\PycharmProjects...python文件总共有两种用途,一种是执行文件;另一种是被当做模块导入。 每个模块都有一个name属性,当其值是'main'时,表明该模块自身在运行,否则是被引入。...在导入一个包的时候,Python 会根据 sys.path 中的目录来寻找这个包中包含的子目录。

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    PythonPython 入门基础

    文章目录 一、Python 背景知识 1、Python 的由来 2、Python 的应用场景 3、Python 的优缺点 二、常量、表达式和语句 三、变量和类型 1、变量 1.1 变量的定义 1.2...1、算术运算符 2、关系运算符 3、逻辑运算符 4、赋值运算符 5、复合运算符 6、其他运算符 一、Python 背景知识 1、Python 的由来 吉多·范罗苏姆(Guido van Rossum)...3、Python 的优缺点 Python 的优点: 语法言简意赅, 容易上手. 功能强大, 用途广泛. 生态丰富, 具有海量的成熟第三方库....浮点型 Python 中的浮点数类型为 float,但它占用的内存空间为8字节,为双精度浮点数,所以 Python 中的 float 等价于 C/C++/java 中的 double 类型;Python...Python 同样支持变量定义时声明类型,但它是动态类型。

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