---- 目录 1.R简介 2.Python简介 3.R&Python相遇 1. R简介 R（又称R语言）是一款开源的跨平台的数值统计和数值图形化展现工具。...和R类似，Python也有包，pypi是一个Python包的仓库，里面有很多别人写好的Python库。 Python也是一个大社区，但它是一个有点比较分散，因为它是一个通用的语言。...整体来说，对于对R使用和编程有一定深入理解的人来说，我不认为R做数据分析的速度会比python差。但是对于简单粗暴的编程方式，python的确更胜一筹。...而在以下领域中，R比Python更有优势： ◆ 统计分析选项：尽管Python的SciPy和 Pandas以及 statsmodels的组合提供了很大的一套统计分析工具，而R是专门围绕着统计分析应用等创建的...d).R和Python：数据科学行业的表现： ★ 如果你看一下最近的民意调查，在数据分析的编程语言方面，R是明显的赢家。 ★ 有越来越多的人从研发转向Python。
Python 的模块一旦加载就会常驻内存，直到程序结束。再碰到 import 语句式只是修改名字空间，而不需要重新加载。这种机制是出于运行时的效率考虑，每遇到 import 的时候重新加载显然很低效。...它也不会检查源文件的修改时间以确定是否重新加载，Python 有那么多的模块，每次调用时都检查一遍时间也是不行的。...比如用 mod_python 做 web 开发，Apache 会启动多个守护进程来应答客户请求，里面有 python 的解释引擎和加载的模块，若要让修改后的代码生效只能重起 apache，这会影响到其它服务的正常运行...mod_python 有一个PythonAutoReload 参数，它只是针对 PythonHandler 而言的，能够对设定的 PythonHandler 实现自动重新加载，而该 Handler 中所用到的模块却不能自动...另外，由于mod_python 能够实现指定的 Handler 的自动重新加载，将这段代码放在该 Handler 中，可以方便地改变所关心的模块列表，也不需重起 apache。
安装PIL的时候，不能再注册表中识别出来python2.7 在网上找了方法，仅作笔记，供下次使用 方法： 新建一个register.py 文件，把一下代码贴进去 import sys from...# tweak as necessary version = sys.version[:3] installpath = sys.prefix regpath = "SOFTWARE\\Python...return print "--- Python", version, "is now registered!"...print "*** You probably have another Python installation!"...if __name__ == "__main__": RegisterPy() 然后命令行切换到脚本目录运行：python register.py 显示：--- Python 2.7 is
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com.../s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101...经过这几期的R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ?...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
函数的属性 R中包含了一系列的函数用于提取函数类型对象的信息。 args函数可以用来查看函数包含了哪些参数，args返回一个函数类型的对象，函数体为NULL。...NULL 如果我们想要在R代码中对函数的参数列表进行操作，formals函数是一个很好的工具，它会返回一个配对列表对象（对应参数名和设定的默认参数值）。...注意，formals函数仅能运行在R写的函数上（类型为closure的对象），而不能在内嵌函数（bulti-in function）上运行。...例如： > f.formals$y <- 3 > formals(f) <- f.formals > args(f) function (x, y = 3, z = 2) NULL R提供了一个非常方便的函数...加入解释器在到达全局环境时依然没有找到var，那么R会在全局环境中指定var的值为value。
原英文网址：http://ropenscilabs.github.io/r-docker-tutorial ❞ ? 这是专门为具有 R 和 RStudio 知识的朋友设计的 Docker 教程。...想象一下，你正在 R 中进行分析，然后将代码发送给朋友。你的朋友在完全相同的数据集上运行此代码，但结果略有不同。这可能有多种原因，例如操作系统不同，R 软件包的版本不同等。...docker run --rm -p 8787:8787 -v /Users/tiffanytimbers/Documents/DC/r-docker-tutorial:/home/rstudio/r-docker-tutorial...第三课：安装 R 包 在 RStudio 内安装 R 包 这跟我们使用 RStudio 桌面版没什么区别，试试运行： # install package install.packages('gapminder...安装 R 系统外部依赖 许多 R 包有外部依赖，如 GSL, GDAL, JAGS，为了安装它们，你需要进行如下的操作： docker ps # find the ID of the running container
:star: what is an r project include in r studio?...:star: compare r with python :stars: r Here is a simple R demo code that creates a vector of numbers,...:stars: python Here is a simple Python code that creates a list of numbers, calculates the sum and mean...There are a few differences between the R code and the Python code that I gave you....In Python, the square brackets [] are used to create lists.
R包 多个函数的打包存放 相应的R包可实现特定的分析功能 R包包含函数、数据、帮助文件、描述文件 安装 R包来源有CRAN、Bioconductor、GitHub install.packages(tidyr...载入包时回答提示信息尽量no* 已经安装的包，可直接调用其中的函数 pheatmap::pheatmap(volcano)#包名::函数名 library(pheatmap) pheatmap(volcano) 学习R包的使用
会按照转义字符的意义输出，如下： text="1 E:/Code/PycharmProjects/QtDemo/ToolsList\__pycache__\start.cpython-36.pyc \r\...Code/PycharmProjects/QtDemo/ToolsList__pycache__\start.cpython-36.pyc raw strings（原始字字符串） 在python...中使用r来处理常量，强制不转义。...```python text=r"1 E:/Code/PycharmProjects/QtDemo/ToolsList\__pycache__\start.cpython-36.pyc \r\n" print...n" text = text.replace("\r", r"\r").replace('\n', r'\n') # 或者 # text = text.replace("\r", "\\r").replace
接下来是把Python也加进来，操作方法与R一样， 同样的，这里在CMD命令行中输入“python”,然后回车键。如下图，说明python添加到Path成功。...模块与包的安装 上述的操作后，我们已经把Python和R成功加入到Path中，在用这两个做数据分析时，我们要安装别人已经写好的模块与包（packages）。...LEfSe主要以Python运行为主，但要调用到R的几个packages。...首先，对于python，我们需要安装“numpy”、“rpy2”与“matplotlib”三个模块，在R中需要安装好几个packages，如mvtnorm、coin等。...我们先安装Python的模块，在数据分析过程中提示未找到“packages”时，我们再用R安装对应的packages。
R语言的选项设定可以从全局范围影响当前的会话，我们调用getOption()查看选项值，使用options()修改它。...一个常用的设定选项是输出位数，在某些情况下，R默认输出的位数不满足我们的要求，需要修改，而该选项由digits选项控制。
参考图书：《Rcpp：R 与 C++ 的无缝整合》 Rcpp 的主要目的在于使得开发 R 语言的 C++ 相关拓展变得更加容易、更少出错。 我们首先从斐波那契数列问题开始探索 Rcpp。...if (x == 0) return(0); if (x == 1) return(1); return fibonacci(x - 1) + fibonacci(x - 2); } R...通过 .Call() 可以在 R 和 C++ 之间传递对象。...在写好上述两个函数后，后面的工作就是编译函数，生成所谓的“共享库”，这样 R 就可以加载和调用它。编译、链接和加载是一个纯粹的体力活，幸好，工具包 inline 可以帮助我们完成这 3 个步骤。...可以看到，通过 R 调用 c++ 简化到了仅仅添加一些必要的头文件和属性信息即可，不需要改动工作代码本身。当然，强大的 Rcpp 不仅仅如此，它还提供了诸多的与 R 交互的数据类型，后续再学习分享。
❝接「R」R Docker 教程❞ 第五课：Dockerfile 前面我们学习了一个可以在 Docker 中运行 RStudio 的基础镜像，学习如何使用 docker commit 修改镜像的内容。...接下来，让我们基于该基础镜像添加一层，让 gapminder 提取安装好可以直接使用： RUN R -e "install.packages('gapminder', repos = 'http://cran.us.r-project.org...保存你的 Dockerfile，返回终端，现在我们可以利用下面的命令构建一个自定义镜像： docker build -t my-r-image ....-t my-r-image 指定镜像名字（要小写），. 指定构建镜像所需要的资源来源，这里指当前目录。...这一次我们使用指定的 R 版本，通过这里[1]查看所有可获取的镜像列表。版本标签在可重复性分析中非常有用。
下面呈上 R 关于控制结构的知识，与君共享。...false_expression 或者： if (condition) expression 表达式并非总是被执行，所以 if 函数的类型是special： > typeof(`if`) [1] "special" R...接触过其他编程的朋友肯定接触过不少类 switch 或 case 的语句，R 也存在着switch函数，所以我们可以用下面的语句实现该功能： > switcheroo.switch <- function...("f") [1] "moose" > switcheroo.switch("a") [1] "alligator" > switcheroo.switch("f") [1] "moose" 循环 R...后语 使用 R 的人是幸运的，向量化是 R 的内在特性之一，以至于我们常常忘记它的存在。 请珍惜这份开源的馈赠。
存储在 ~/.Rprofile 中的内容是一个 R 脚本，它会在 R 启动时自动运行，所以可以作为全局的配置使用。...根据我的 R 使用经验，结合 Y 叔和 Yihui 提供的一些便利函数，我构建了一个比较合适的 R 配置。推荐大家结合自己需求使用和自定义。 目前设定涉及的功能： 设置 UTF-8 编码。...设置 R 提示用英文显示，方便查看和搜索 R 代码错误信息。 设置 CRAN 下载源为同济大学；Bioconductor 下载源为清华大学。...设定自定义 R 包存储路径，这个非常有用，便于以后 R 版本涉及不影响 R 包。 设置 R 临时文件目录，这个在一些场景下也有用（比如快速查看临时文件）。 设置载入 pacman 用来管理 R 包。...R packages again and again ## It may be useful when install GitHub R packages .loop_install <- function
学习生信时，最常用的可视化软件就是R，可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio，究竟什么是R和Rstudio？ R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。...RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。...01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装...第四步 第五步 R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。...参考资料：https://m.bilibili.com/video/av25643438.html R-project管理多个R工作目录
复制-修改机制 这里介绍R的一个重要特性，以便于更安全地使用数据。...每个名称（称符号或变量）都指向一个对象，当我们查找一个符号时，如果它在当前环境中，R就会在当前环境中搜索并返回该符号指向的对象。...如果这个符号在当前环境中没有找到，R就会到它的父环境中搜索（直到找遍所有环境）。...实际上，一段R代码运行就是在一个环境中进行的。...事实上，每一次开启R线程会话，其工作环境都是全局环境。我们一般是在这个环境中创建变量和函数进行分析。
一、R语言安装 首先进入官网：https://cran.r-project.org 下载相应版本的安装包 点击base 点击Download R4.1.2 for Windows，即可开始下载
实例 大部分其他语言（比如java）的OOP概念都已经包含在R中，但R中具体的语法和结构却有所不同。我们需要通过调用函数setClass来定义一个类，并且需要调用setMethod函数来定义方法。...R语言中对象存储信息的位置称为槽（slot）。我们将该对象需要包含的槽命名为data、start、end。...R允许自定义函数用来验证特定的类。我们可以通过setValidity函数来设定。...R提供了一种叫作泛型函数的机制可以实现。当我们对某个对象调用泛型函数时，R会基于该对象的类找到正确的方法去执行。...守旧派OOP: S3 如果我们想要用R实现复杂的工程，应该使用S4的类和对象。不幸的是，我们在R中是很难避免S3对象的。比如统计包中的大部分建模工具都是用S3对象实现的。
---title: "R1~2dy"output: html_documentdate: "2023-04-06"---R Markdown#####2.1.向量生成######(1)用 c() 结合到一起
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