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表达矩阵的归一化和标准化,去除极端,异常值

归一化:将每个样本的特征(在转录组中,特征就是表达量)转换到同一量纲下,把表达量映射到特定的区间内,区间的上下限由表达量的极值决定,这种区间缩放法是归一化的常用方法。...有时当表达量为0时,取log会出现错误,可以log(counts+1)来取log。当x=1时,所有的log系列函数值都为0。这样原本表达量为0的,取log后仍为0。...转换后表达量符合正态分布分布,Z-score只是一个临界,是标准化的结果,本身没有意义,有意义的在于在标准正态分布模型中它代表的概率。...如果表达量较为稳定,不存在极端最大最小,使用归一化。 如果表达量离散程度很大,存在异常值和较多噪音,用标准化可以避免异常值和极端的影响。...机器学习的算法(SVM、KNN、神经网络等)要求归一化/标准化 剔除异常值 大家看群主代码绘制热图,里面经常看到z-score以及去除极端的: ?

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极端场景下jraft的验证

对于一个陌生的组件的极端场景的考虑,一般分2个阶段。 第一阶段,不了解组件的原理,当成黑盒处理,模拟常规极端场景。...例如在心跳时间的边界上模拟极端场景,内部各种超时时间的边界上模拟极端场景 列出较为完善的极端场景后,剩下就需要考虑实现极端场景模拟手段。...采用场景2中对写入注入延时3s, 接着kill -9 leader的java进程, 观察wrk的报错,以及插入的id, 6s内启动leader java 进程, 继续压测,观察最终构造的数据和集群中的数据的一致性...采用场景2中对写入注入延时3s, 接着kill -9 leader的java进程, 观察wrk的报错,以及插入的id, 10s后启动leader java 进程, 解析压测,观察最终构造的数据和集群中的数据的一致性...接着手工插入一个序列(插入成功的序列的+1)到jraft集群,观察客户端读jraft集群中最大序列是多少。

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独家 | 在Python中使用广义极端学生化偏差(GESD)进行异常检测(附链接)

作者:Shaleen Swarup 翻译:欧阳锦校对:王可汗 本文约1700字,建议阅读5分钟本文从理论和实践角度介绍了使用广义极端学生化偏差(GESD)进行异常检测的方法,展示了Python代码示例和相关源码...在本文中,我们将重点关注GESD(广义极端学生化偏差)并在Python中实现一个简单的示例以更好地了解它的原理。...机器学习和统计教程 https://www.youtube.com/channel/UC8ofcOdHNINiPrBA9D59Vaw 什么是广义极端学生化偏差(Generalized Extreme Studentized...在GESD中,我们删去使得 | xi - x_bar | 最大化的观测。然后,用n-1个观察重新计算上述统计量。我们重复这个过程,直到r个观测被移除。...现在再巩固一下理论部分,在Python中实现GESD以了解它的实际工作原理吧。 首先,模拟我们的数据。这里我们创建了0到1之间的100个随机。数据的散点图如下所示。 ? ?

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