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    全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) (3)-- SQANTI3 v5.2

    Functional IsoTranscriptomics (FIT) 是美国弗罗里达大学(University of Florida)Ana Conesa 教授团队(Genomics of Gene Expression Lab, ConesaLab)开发的在转录本isoform水平上进行生物信息学分析的流程,旨在提供一个全长转录组end-to-end的解决方案 (图1)。SQANTI 3 构成了FIT流程的第一个模块,其设计目的是使长读序列定义的转录组的质量控制和过滤成为可能,这些转录本通常含有artifacts和假阳性。因此,对全长转录组进行校正是进行FIT分析的前提,且对产生可靠的、在生物学上合理的结论/假设至关重要。SQANTI 3 是SQANTI 工具(发布)的最新版本,该版本合并 SQANT 1 和 SQANTI 2 中的功能并加入了新的功能 ,更好的对全长转录本进行深度表征 。

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