❝最近由于研究需要,复习下 Docker,找到了本教程,分两次推送,感兴趣的可以跟着学习。...原英文网址:http://ropenscilabs.github.io/r-docker-tutorial ❞ ? 这是专门为具有 R 和 RStudio 知识的朋友设计的 Docker 教程。...想象一下,你正在 R 中进行分析,然后将代码发送给朋友。你的朋友在完全相同的数据集上运行此代码,但结果略有不同。这可能有多种原因,例如操作系统不同,R 软件包的版本不同等。...RStudio 学习目标 在 Docker 中启动 RStudio 将磁盘与 Docker 镜像链接 载入容器 安装 首先参考 install Docker[4] 进行安装,没有必要完成链接中所有的教程...第三课:安装 R 包 在 RStudio 内安装 R 包 这跟我们使用 RStudio 桌面版没什么区别,试试运行: # install package install.packages('gapminder
❝接「R」R Docker 教程❞ 第五课:Dockerfile 前面我们学习了一个可以在 Docker 中运行 RStudio 的基础镜像,学习如何使用 docker commit 修改镜像的内容。...接下来,让我们基于该基础镜像添加一层,让 gapminder 提取安装好可以直接使用: RUN R -e "install.packages('gapminder', repos = 'http://cran.us.r-project.org...保存你的 Dockerfile,返回终端,现在我们可以利用下面的命令构建一个自定义镜像: docker build -t my-r-image ....-t my-r-image 指定镜像名字(要小写),. 指定构建镜像所需要的资源来源,这里指当前目录。...这一次我们使用指定的 R 版本,通过这里[1]查看所有可获取的镜像列表。版本标签在可重复性分析中非常有用。
基于 https://shiny.rstudio.com/tutorial/ 视频而非文字教程写的笔记。 p1:初识 UI 和 Server UI 主要目的是创建展示界面。...p4:分享 Shiny 将所有脚本和材料保存到一个目录,目录下代码通常以以下 2 种方式之一存储: app.R ui.R & server.R ? ? ?...isolate() 创建一个非响应对象(看作 R 常规值)。 它和 reactive() 是对应的。 ? ? ? ? (注意这里虽然图更新了,但绘图数据并没有更新) ?
R包概述 R包是什么 R包,类似C、Python中库的概念,指包含特定领域的函数、数据、文档等的集合。通过调用包,可以直接使用包中现成的数据、函数等,使开发方便快捷高效。...R包的结构 创建R包后,在包的根目录下,一般包含以下几个部分(粗体表示必需): R/: R函数目录,包含包中定义的函数。 DESCRIPTION:包的描述,包括包名、作者、依赖等。...R包的工作流程 为了有效利用R包,一般遵循以下的工作流程: 指定名字,创建R包,并编写DESCRIPTION文件,对R包进行简单的描述。 如有必要,在data/中添加数据文件。...在R/中编写对应功能的R文件 编写好R文件后,生成R文档。 在tests/中编写R文件的测试文件。 在vignettes/中编写项目的说明文档。 生成R包与发布。...R文档 对于每个R函数,需要编写R文档,包含R函数的功能、调用、使用方法等。
一、R的下载和安装 1.首先我们去下载一个R,可以直接点击下面的超链接:R下载地址,然后选择与你的操作系统匹配的版本 在这里我们用windows系统来举例,点击图片中箭头所指的链接进行下载...2.下载完成以后我们就开始进行安装,双击R安装包(R-3.6.0-win.exe)进行安装 根据自己的需要选择语言,点击确定 点击Next 安装位置尽量选择D...根据你的需要选择要下载的版本,接下来我们以Windows系统为例 下载完成以后,双击双击RStudio安装包(RStudio-1.2.1335.exe) 点击下一步 这里安装位置的选择最好与你的R在一个目录下
行内代码 `r sin(pi/2)` 有趣的案例: 1)自动更新日期 date: "`r Sys.Date()`" date: "`r format(Sys.time(), '%d %B, %Y')`...R代码块一般通过{R}来插入,插入代码段的快捷键:win[Ctrl+Alt+I] / mac[option + cmd + I]。...这里小编给出一些常用的选项,文字版本较难理解的话,请配合我的b站视频教程[1]。 eval和include选项 加选项eval=FALSE, 可以使得代码仅显示而不实际运行。...图片尺寸更改与插入R代码生成的图形的情况相同。...row_spec(x_html,0, color = "white", background = "#696969" ) kable_styling(x_html,"striped") 参考资料 [1] b站视频教程
安装 假设你已经安装了R[1](R Core Team 2020)和RStudio IDE[2]。 不需要RStudio,但建议使用RStudio,因为它可使普通用户更轻松地使用R Markdown。...对于从未安装过LaTeX的R Markdown用户,建议安装TinyTeX[3]: install.packages('tinytex') tinytex::install_tinytex() # install...R配套软件包tinytex可以帮助你在将LaTeX或R Markdown文档编译为PDF时自动安装缺少的LaTeX软件包,并确保将LaTeX文档编译正确的次数以解决所有交叉引用。...Rmd文件中除了R代码段以外, 还可以插入Rcpp、Python、Julia、SQL等许多编程语言的代码段, 常用编程语言还可以与R代码段进行信息交换。 这三个部分会在以后做详细介绍。 3....演示的Rstudio版本为4.0.3 参考资料 [1] R: https://www.r-project.org [2] RStudio IDE: https://www.rstudio.com [
R Markdown 格式,简称为 Rmd 格式, 相应的源文件扩展名为.Rmd。输出格式可以是 HTML、docx、pdf、beamer 等。 前面介绍参考:李东风老师的《R 语言教程》[6]。...markdown 的教程以及对应的编辑器介绍可见:R沟通|markdown编辑器—Typora 这一期主要介绍 Rmarkdown。...当然,官网也有一套 Rmarkdown 的入门教程,欢迎大家前去学习,官网截图如下: ?...官网截图 其他参考资料可见这一期推文:R分享|Rmarkdown参考资料分享和自制视频教程预告 knitr 的详细文档参见网站knitr 文档[2]。...R语言和数据科学!
建议安装Tinytex,具体安装教程见前面。 ? 编译后得到的结果,这是他模板原始的样子,如果想调整页面行间距,字体颜色等,请见下次推文(公众号:庄闪闪的R语言手册),我将会把这些小细节进行汇总。...方法一 --- title: "Rmarkdown入门教程" author: "庄闪闪的R语言手册" date: "2/18/2021" output: rmdformats::readthedown...3 prettydoc包 --- title: "Rmarkdown入门教程" author: "庄闪闪的R语言手册" date: "2/18/2021" output: prettydoc::html_pretty...4 tufte包 --- title: "Rmarkdown入门教程" author: "庄闪闪的R语言手册" date: "2/18/2021" output: tufte::tufte_html...5 cerulean包 --- title: "Rmarkdown入门教程" author: "庄闪闪的R语言手册" date: "2/18/2021" output: html_document:
R语言的特点 R作为一种统计分析软件,是集统计分析与图形显示于一体的。...R是基于S语言的一个GNU项目,所以也可以当作S语言的一种实现,通常用S语言编写的代码都可以不作修改的在R环境下运行。R的语法是来自Scheme。...与其说R是一种统计软件,还不如说R是一种数学计算的环境,因为R并不是仅仅提供若干统计程序、使用者只需指定数据库和若干参数便可进行一个统计分析。...R语言环境 R是一套由数据操作、计算和图形展示功能整合而成的套件。...尽管R试图成为一种真正的编程语言,但是不要认为一个由R编写的程序可以长命百岁。 R与统计 在我们对R语言环境的介绍中并没有提到统计,不过很多人都把R作为一个统计系统来使用。
从本周开始会每周推送1~2次高质量R可视化内容,本系列内容来自github上面超级火爆的R语言可视化项目:tidyTuesday。...tidyTuesday每周更新数据,大佬们会使用这些数据集自由创作出各种高质量的R语言可视化作品,是学习R语言数据分析和可视化极好的素材。...Tidy Tuesday: A weekly data project aimed at the R ecosystem. https://github.com/rfordatascience/tidytuesday...设置工作路径 wkdir <- '/home/user/R_workdir/TidyTuesday/2018/2018-04-02_US_Tuition_Costs/src-a' setwd(wkdir...加载 R 包 library(scales) library(tidyverse) library(extrafont) library(gghighlight) library(showtext)
在R基础——数据的导入与导出(下)中,介绍了使用RODBC包连接SQL server数据库,在这篇文章中,根据我工作内容,介绍该包的基本操作,同时,根据我使用该包时出现的问题,介绍解决问题的方法。...读取数据 场景:读取数据库的表中数据至R中。 #读取数据#整表读取df 可以看出来,该函数的使用较为简单,像其他where语句,group by语句等等复杂的查询都无法实现。...导出至数据库 场景:当在R中跑了模型或者处理完数据,需要保存至数据库重复利用时。
当我们配置新电脑的时候,重新安装所有的 R 包往往很麻烦,特别是 R 包数量很多的时候。...这个时候我们只需要在新电脑上安装相同版本的 R 和 Rstudio,将旧电脑的 R 包文件夹覆盖新电脑的 R 包文件夹即可。...输入以下代码即可获得 R 包安装的路径(如果你有多个路径,说明你的 R 包安装在多个位置)。 .libPaths() 1Windows 在 Windows 上很好操作,通常是 ....../R-x.x.x/library 路径下。...批量运行多个R脚本并打印运行状态 基于xargs命令的多行命令并行管理
mydata) <- c("rsid","pval") # 对SNP和暴露的P值重命名 mydata <- ld_clump(dat = mydata,clump_kb = 10000, clump_r2...其它参数的含义可以参考往期内容TwoSampleMR包实战教程之去除连锁不平衡(LD)。
之前做过一个很傻的事情,输入chmod -R 777 / 输入快了,后面没有跟目录直接回车了。所有目录的权限都凌乱了,这里写一份恢复sshd登录的教程以及恢复系统文件的教程。...从另外一台相同环境系统中,备份根目录所有权限 getfacl -R / >/tmp/a.facl 通过各种方法,传到故障服务器上,我这里上传web服务器,故障服务器从网站上拉取。
R、Rstudio详细安装教程(详细图文) 1、R下载及其安装 下载 安装 2、Rstudio下载及安装 下载 安装 测试 1、R下载及其安装 下载 1、网址:https://cran.r-project.org
课程名称:R语言入门教程 第一章:认识R 1.1 认识R 【课程目的】 在大数据时代里,数据分析愈发重要,R语言适合做数据分析,R语言已成为许多数据分析工作者手中的利器,使用R语言可以较好地完成数据分析各个环节中的任务...本课程包括R简介、R数据类型、R数据导入和导出、R环境、R操作数据以及R画图内容。通过本课程的学习,能够掌握R的基本知识,并且能够使用R导入和导出数据、使用R操作数据和画图。...【课程大纲】 第一课:R简介 介绍R的历史、特征,R能够做什么,R软件获取、安装和运行,R帮助文档,R扩展包。...第二课:R数据结构 熟悉R常用数据结构即向量、矩阵、数组、列表、数据框和因子,掌握每一种数据结构的含义、构建和实际应用,能够根据不同的数据或者数据集选择和应用合适的R数据结构。...第四课:R环境 介绍R工作空间,创建和使用R脚本,保存数据和结果。 第五课:R操作数据 掌握用R基于逻辑方式操作数据。 第六课:R画图 掌握用R创建图形、编辑图形和保存图形。 视频内容
安装R和Rstuido软件 R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境;Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。...单击base,进入下面页面,点击【Download R 3.5.1 for Windows】 2、安装R 下载完R安装包(我下的按转包名称为:“R-3.3.1-win.exe”),之后双击开始安装...最大的面板是控制台窗口,这是运行R代码和查看输出结果的地方。也就是运行原生R时看到的控制台窗口。其他面板则是RStudio所独有的。...注意:有的人可能会问,有了RStudio还需要下载R吗? 即使使用RStudio,还是需要事先为计算机安装好R。RStudio只是辅助你使用R进行编辑的工具,它自身不附带R程序。...最大的面板是控制台窗口,这是运行R代码和查看输出结果的地方。也就是运行原生R时看到的控制台窗口。其他面板则是RStudio所独有的。
使用R语言中的lm()函数创建关系模型。 从创建的模型中找到系数,并使用这些创建数学方程 获得关系模型的摘要以了解预测中的平均误差。 也称为残差。...为了预测新人的体重,使用R中的predict()函数。...0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 Residual standard error: 3.253 on 8 degrees of freedom Multiple R-squared...: 0.9548, Adjusted R-squared: 0.9491 F-statistic: 168.9 on 1 and 8 DF, p-value: 1.164e-06 predict
第一步,从R语言官网,下载package: 以 ‘data.table’为例 如图。...然后在R软件选择-程序包-install package from local files,选择下载好的 ‘data.table’文件。
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