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生信学习-Day6-学习R包

: test <- irisc(1:2,51:52,101:102), 在R语言中,这行代码是对数据集 iris 进行子集选择的操作。...逗号之后的空位表示选择这些行的所有列(即所有的特征和标签)。 test 的子集保存到一个新的变量 test 中。...综上所述,这行代码的作用是创建一个新的数据框 test,它包含了 iris 数据集中的第1、2、51、52、101、102行. 4 五个基础函数 1.新增列:mutate() 2.选择列(按列筛选) 列号...在 iris 数据集中,Petal.Length 和 Petal.Width 分别代表花瓣的长度和宽度。 因此,当你使用 vars 变量时,你实际上是在引用那些具有这些名称的列。...group_by(Species):这一步将数据按照Species列的不同值进行分组,即将数据集分成多个子集,每个子集包含相同Species值的数据。

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Python编程作业四:文件操作

编程素材下载地址: 链接:https://pan.quark.cn/s/86265d8aafc1 提取码:sDpr 一、程序填空1 下面的程序是根据用户输入的星座名称,输出此星座的出生日期范围及对应的星座符号...chr() 函数可以由表1第3列的 Unicode 编码得到对应的字符;而另一个相反的函数是 ord() 函数,它可以根据一个字符得到对应的 Unicode 编码。...运行结果: 二、程序填空2 下面的程序是统计并输出传感器采集数据中光照部分的最大值、最小值和平均值,所有值保留小数点后2位。...minv = val #minv中是光照的最小值 #以2位小数格式显示最大值、最小值、平均值 print("最大值、最小值、平均值分别是:{:.2f},{:.2f},{:.2f}...然后,通过 input() 函数分别获取用户输入的诗的标题和作者,并将它们存储在 poem 列表中。 接下来,通过一个循环,让用户输入该诗的四句诗句,并将它们追加到 poem 列表中。

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    R语言 数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

    数据框数据框的创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame),由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作),读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数..."s",善用Tab可以防止错误rownames(df1)colnames(df1)数据框取子集"$"取子集df1$gene为对数据框df1列名的向量取子集*输入df1$后按tab键可以输出待选的列名mean...(df1$score) #对取出的向量可以进行运算坐标取子集df1[2,2] #取出(行数,列数)的单元格df1[2,] #取出第二行的所有内容df1[,2] #取出第二列的所有内容,同df1$df1[...c(1,3),1:2] #取出第1、3行的1、2列数据,取多列的时候需要组织成合适的向量df1[,-ncol(df1)] #删去最后一列,"-"意义同向量列名或行名取子集df1[,"gene"] #取出列名为...,再次加载需要row.name# 5.保存为Rdata,再加载它save(cs,file = "cs.Rdata")# 6.加载y.Rdata(已保存在工作目录),求gene1列的平均值load(file

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    GPT4做数据分析时间序列预测之四相当棒2023.5.25

    另一种方法) 根据您的需求,我将这些方法的代码合并,并将预测结果保存到Excel文件的不同列中。...移动平均'] = 数据子集['销售金额'].rolling(window=36).mean() 预测_移动平均 = [数据子集['移动平均'].iloc[-1]] # 使用最后一个移动平均值作为预测值...移动平均'] = 数据子集['销售金额'].rolling(window=36).mean() 预测_移动平均 = [数据子集['移动平均'].iloc[-1]] # 使用最后一个移动平均值作为预测值...Plotnine - 与R语言的ggplot2类似,基于Grammar of Graphics理念,也适用于静态图表绘制。 7....移动平均'] = 数据子集['销售金额'].rolling(window=36).mean() 预测_移动平均 = [数据子集['移动平均'].iloc[-1]] # 使用最后一个移动平均值作为预测值

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    疫情这么严重,还不待家里学Numpy和Pandas?

    2的元素a[0,2] a[0,2] #获取第一行,0前面要加逗号,不然打印类型出来 a[:,0] #获取第一列,0后面加逗号 a[0,:] #按轴计算:axis=1 计算每一行的平均值 a.mean...定义一个有序字典 salesOrderDict=OrderedDict(salesDict) #定义数据框,传入字典,列名 salesDf=pd.DataFrame(salesOrderDict) #按照每列求平均值...[:,0] #根据行号和列名称来查询值 salesDf.loc[0,'商品编码'] #获取第一行 salesDf.loc[0,:] #获取‘商品名称’这一列 salesDf.loc[:,'商品名称...'] salesDf['商品名称'] #通过列表来选择某几列的数据 salesDf[['商品名称','销售数量']] #通过切片功能,获取指定范围的列 salesDf.loc[:,'购药时间':'销售数量...salesDf.dtypes 2.数据清洗 1)选择子集(本案例不需要选择子集) subSalesDf=salesDf.loc[0:4,'购药时间':'销售数量'] 2)列名重命名 colNameDict

    2.6K41

    机器学习系列--数据预处理

    等宽分箱:每个”桶”的区间宽度相同 等深分箱:每个”桶”的样本个数相同 用户自定义区间分箱 数据平滑 按平均值平滑:对同一箱中数据求平均值,用平均值代替该箱子中的所有数据。...按边界值平滑:用距离较小的边界值替代箱中所有数据。 按中位数平滑:取箱子的中位数,用来替代箱子中所有数据。 回归: 也可用一个函数拟合数据来光滑数据。...用A和B描述的数据元组可以用一个相依表显示,其中A的c个值构成列,B的r个值构成行。令(Ai,Bi)表示属性A取值ai、属性B取值bj的联合事件,即(A=ai,B=bj)。...检验基于显著水平,具有自由度(r-1)*(c-1)。...这样,原数据投影到一个小的多的空间上,导致维归约。与属性子集选择通过保留原属性集的一个子集来减少属性集的大小不同,PCA通过创建一个替换、较小的变量集“组合“属性的基本要素。

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    如何在 Pandas 中创建一个空的数据帧并向其附加行和列?

    它类似于电子表格或SQL表或R中的data.frame。最常用的熊猫对象是数据帧。大多数情况下,数据是从其他数据源(如csv,excel,SQL等)导入到pandas数据帧中的。...ignore_index参数设置为 True 以在追加行后重置数据帧的索引。 然后,我们将 2 列 [“薪水”、“城市”] 附加到数据帧。“薪水”列值作为系列传递。序列的索引设置为数据帧的索引。...然后,通过将列名称 ['Batsman', 'Runs', 'Balls', '5s', '4s'] 传递给 DataFrame 构造函数的 columns 参数,我们在数据帧中创建了 6 列。...然后,我们在数据帧后附加了 2 列 [“罢工率”、“平均值”]。 “罢工率”列的列值作为系列传递。“平均值”列的列值作为列表传递。列表的索引是列表的默认索引。...Pandas 库创建一个空数据帧以及如何向其追加行和列。

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    R语言-03数据框、矩阵和列表

    2)由已有数据转换或处理得到 (3)读取表格文件 (4)R语言内置数据(没有赋值就可以直接使用的数据,例如iris) 2.新建数据框* 读取文件 df2<-read.csv("gene.csv") df2...#读取"gene.csv"文件,赋值df2 3.数据框属性 4.数据框取子集 df1$gene #"$"前是数据框名称 后是列名;提取该列的向量 #按名字取子集 df1 行,列 图片 5.数据框修改...取子集,赋值 #改行名和列名 rownames(df1) r1","r2","r3","r4") #修改全部行名 #只修改某一行/列的名 colnames(df1){2} <- "CHANGE..." #修改一个列名 6.两个数据框的连接 按照共同的列名取交集,后连接 两个数据框列中有交集时既可以使用,自动连接 矩阵新建和取子集 矩阵画热图 pheatmap::pheatmap(m) #热图结果默认聚类...“名字”-names() 后置的难点 数据框按照逻辑值取子集 #将逻辑值赋值给k,按逻辑值在df1中取子集**实战中会经常遇到 删除变量 数据结构总结 以上来源,生信技能树

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    【Java 进阶篇】深入理解SQL查询语言(DQL)

    SQL查询语言(DQL)是SQL语言的一个子集,用于从数据库中查询(检索)数据。它允许您指定条件,并从一个或多个表中检索数据的子集。查询的结果通常以表格的形式返回,这些表格称为“结果集”。...; 在这个查询中,我们从名为employees的表中选择first_name和last_name列,仅选择department等于’HR’的行,然后按last_name列对结果进行排序。...您可以使用*通配符选择所有列,或者明确指定列的名称。...计算数据 - 使用聚合函数 聚合函数允许您对数据进行计算,如求和、平均值、最大值和最小值等。以下是一些常见的聚合函数: COUNT():计算行数。 SUM():计算列的总和。...AVG():计算列的平均值。 MAX():找到列的最大值。 MIN():找到列的最小值。

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    快速介绍Python数据分析库pandas的基础知识和代码示例

    info()函数用于按列获取标题、值的数量和数据类型等一般信息。一个类似但不太有用的函数是df.dtypes只给出列数据类型。...通常回根据一个或多个列的值对panda DataFrame进行排序,或者根据panda DataFrame的行索引值或行名称进行排序。 例如,我们希望按学生的名字按升序排序。...假设我们想按性别将值分组,并计算物理和化学列的平均值和标准差。...注意:使用len的时候需要假设数据中没有NaN值。 description()用于查看一些基本的统计细节,如数据名称或一系列数值的百分比、平均值、标准值等。...mean():返回平均值 median():返回每列的中位数 std():返回数值列的标准偏差。 corr():返回数据格式中的列之间的相关性。 count():返回每列中非空值的数量。

    8.1K20

    mysql中分组排序_oracle先分组后排序

    与带有GROUP BY子句的聚合函数一样,窗口函数也对行的子集进行操作,但它们不会减少查询返回的行数。...min 查询指定列的最小值 count 统计查询结果的行数 sum 求和,返回指定列的总和 avg 求平均值,返回指定列数据的平均值 排序函数 + over() 排序函数有row_number()、...含义: 返回窗口第一行中列column对应的值 举例: 查询部门的年薪最高者姓名追加到新的一列 SELECT `id`, `name`, `salary`, `department`, first_value...举例: 查询部门中薪水第二高的员工姓名追加到新的一列 SELECT `id`, `name`, `salary`, `department`, nth_value(name,2) over(partition...举例: 查询部门中员工薪资累积分布(即高于等于当前员工工资员工数量占员工总数的百分比)追加到新的一列 SELECT `id`, `name`, `salary`, `department`, cume_dist

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    DAY6-学习R包

    library(dplyr)dplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length*Sepal.Width)要修改的数据框的名称将创建的新变量的名称将分配给新变量的值...select()按列筛选select(test,1)#筛选test中的第一列select(test,c(1,5))#筛选test中的第一列和第五列select(test,Sepal.Length)#筛选...test中名为Sepal.Length的一列按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)选择字符向量中的列,select中不能直接使用字符向量筛选,需要使用one_of...%in% c("setosa","versicolor"))#筛选test中有"setosa","versicolor"的行arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序arrange(test...分组并汇总summarise(group_by(test,Species),mean(Sepal.Length),sd(Sepal.Length))#按照Species分组,计算每组Sepal.Length的平均值和标准差并汇总

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    Learn R 函数和R包

    ,col=iris[,5]) + } > jimmy(1) > jimmy(2) > jimmy(3) > jimmy(4) 练习4-1 # 写一个函数,参数是一个数值型向量,输出结果是该向量的平均值加...") #ls是展示出该包中的函数 R语言中的函数 ()前的是函数 [] 是取子集,一定是个数据 【】里有“,”->向量或矩阵 [[]] 前的通常是个列表 列表取子集 $ 数据框取子集 <-...否定 { } 用于容纳多行代码 #注释 " " 字符型数据 ::包::函数 #文件名必须带引号,且在能识别文件名称的函数括号里面,实际参数位置上 文件的读写 csv格式 > read.csv("ex3.../R_01/gands.Rdata") -----注意:用tab补齐文件名称 避免出错------- 文件读写部分 #1.读取ex1.txt 用read.table(" ") > ex1 <- read.table...Rdata,再加载它 > save(x,file="x.Rdata") > rm(list = ls()) > load("x.Rdata") 6.加载y.Rdata(已保存在工作目录),求gene1列的平均值

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    Learn R GEO

    图片 图片 图片 4.火山图 ·根据logFC(横坐标)和 P value(纵坐标)可以画火山图 多基因 差异分析 ·Foldchange(FC): 处理组平均值/对照组平均值 ·logFoldchange...(看图) >head(ids) #看到所需要的结果 方法2 读取GPL网页的表格文件,按列取子集 ##https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?...图片 仿制实例数据 列—两个部分(前四列是用于求PCA的值-探针/基因;最后一列为分组信息) 行—样本名称 需要对原始数据进行转换(如图a) 图片 图片 PCA代码 #仿制的前四列 dat=as.data.frame...,所以需对基因进行去重 ####方法1:随机去重 ####方法2:保留行和/行平均值最大的探针 ####方法3:取多个探针的平均值 #其他去重方式在 “zz.去重方式.R”这个文件里 deg 的相关性,提供矩阵数据,计算列于列之间的相关性,看图 pheatmap(M) 图片 # 配色R包 library(paletteer) my_color = rev(paletteer_d

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