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基于条件生成模型的分层功能从头蛋白质设计

本论文主要针对于使用有条件的生成的对抗网络蛋白质来解决蛋白质设计问题。由于缺少了在该域中评估了生成模型的规范方式,生成模型难以评估,因为没有可以将每个生成的样本与之进行比较的基本事实。...公式 1 其中R和G是实际和生成的样本集合。 用 MRR 评估条件一致性:对于有条件的生成,我们需要评估模型的能力,以生成与某些目标标签一致的序列。...我们通过计算MMD度量来计算每个标签的序列子集之间的MMD。...公式 2 评估生成序列的多样性:提出使用特征维度上的平均熵以及序列之间的平均成对 RKHS 距离评估生成序列和真实序列分布的两种启发式多样性估计。...通过用它们最接近的同源物的标签替换生成序列的标签计算Homolog MRR,论文惊讶地发现简单的one-hot编码和没有附加特征的原始序列显示出最好的结果。

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【TS 演化史 -- 17】各文件的JSX工厂 、有条件类型和映射类型修饰符

有条件类型 TypeScript 2.8 引入了有条件类型,这是类型系统的强大而令人兴奋的补充。 有条件类型使咱们可以表达非均匀类型映射,即,根据条件而不同的类型转换。...never类型是 TypeScript 的底层类型,表示从未出现的值的类型。 分布式有条件类型 那么,为什么e 条件类型和never类型的组合是有用的呢?它有效地允许咱们从联合类型中删除组成类型。...有条件类型中的类型推断 有条件类型支持的另一个有用特性是使用新的infer关键字推断类型变量。...在有条件类型的extends子句中,可以使用新的infer关键字来推断类型变量,从而有效地执行类型上的模式匹配 type First = T extends [infer U, ...unknown...ReturnType -- 获取函数返回值类型。 InstanceType -- 获取构造函数类型的实例类型。

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    学会Mysql第三天

    不重复查询 select distinct 字段 from 表名; 模糊查询 模糊查询,使用like关键字,基本语法: select 字段 from 表名 where 字段 like 值; 这里的值是模糊的...avg() 求平均值 sum() 求和 max() 求最大值 min() 求最小值 统计公司所有员工的工资(sal),以及最高和最低工资 select sum(sal),max(sal),min(sal...my_student where stu_name ='小猪'); 行子查询 得到的结果是一行多列 行元素:字段元素是指一个字段对应的值,行元素对应的是多个字段:多个字段合起来作为一个元素参与运算,称之为行元素...); any 任意一个: =any(列子查询):条件在查询结果中有任意一个匹配即可,等价于in any (列子查询):条件在查询结果中不等于任意一个。...基本语法: 表1[inner] join 表2 on 匹配条件 1、如果内连接没有条件(允许),那么就是交叉连接 2.使用匹配条件进行匹配 3、因为表的设计通常容易产生同名字段,尤其是ID,为了避免重名出现错误

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    mysql学习总结04 — SQL数据操作

    主键冲突替换: 基本语法:replace into () values(值列表>); mysql> replace into tbTest values('stu0001','sun...更新数据 更新数据时通常跟随where条件,如果没有条件,是全表更新数据,可以使用 limit 限制更新的数量 基本语法:update set = 值> where <判断条件...删除数据 删除数据时通常跟随where条件,如果没有条件,是删除全表数据,可以使用 limit 限制删除的数量 delete 删除数据时无法重置 auto_increment truncate Truncate...= 在sql2000中语法错误,兼容性不如 安全比较运算符,用来做 NULL 值的关系运算,因为 mysql 的 NULL 值的特性,NULL进行任何运算结果均为NULL,1 NULL...列子查询:子查询结果是一列数据(一列多行) 基本语法: where in (列子查询结果>); 举例: 获取有学生的班级名 查询学生表中所有班级id,得到一列数据(一列多行)

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    嵌入式:LoadStore之单寄存器的存取指令

    Load/Store指令分类 ARM指令集中有三种基本的数据存取指令: 单寄存器的存取指令(LDR,STR):提供寄存器和存储器之间最灵活的单数据项传送方式,传送的数据可以是8位字节、16位半字或32位字...;(有条件地)R1←[R5+960],R5 ←R5+960 STR R2,[R9,#consta-struc] ;consta-struc是常量表达式,范围为-4095~4095 STRB R0,[R3...R0中,R0的高24位被设置为0 LDR R1,[R0,-R2,LSL #2] ;将R0-R2*4地址处的数据读出,保存到R1中,R0,R2的值保持不变。...所有半字传送应使用半字对齐的地址。 举例: LDREQSH R11,[R6];(有条件地) R11←[R6],加载16位半字,有符号扩展到32位 LDRH R1,[R0,#20]!...STRNEH R0,[R2,#960] ;(有条件地)将R0的内容送到(R2+960)的内存中,R2=R2+960 参考文献: 孟祥莲.嵌入式系统原理及应用教程(第2版)[M].北京:清华大学出版社

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    Apache URL重写规则

    规则集中规则的顺序是很重要的,因为重写引擎是按一种特殊的顺序处理的:逐个遍历每个规则(RewriteRule指令),如果出现一个匹配条件的规则,则可能回头遍历已有的规则条件(RewriteCond指令)...如果匹配成功,mod_rewrite将寻找相应的规则条件,如果一个条件都没有,则简单地用Substitution构造的新值来替换URL,然后继续处理其他规则;但是如果条件存在,则开始一个内部循环按其列出的顺序逐个处理...如果匹配失败,则整个条件集和对应的规则失败;如果匹配成功,则执行下一个规则直到所有条件执行完毕。如果所有条件得以匹配,则以Substitution替换URL,并且继续处理。...使用这个标记,可以链接若干RewriteConds以有条件地阻塞某些URL。...使用这个标记,可以标明页面已经被废弃而不存在了. proxy|P (强制为代理 proxy)   此标记使替换成分被内部地强制为代理请求,并立即(即, 重写规则处理立即中断)把处理移交给代理模块。

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    【机器学习】八、规则学习

    分类过程总结 通过规则集对未见示例进行分类的时候,我们每条逻辑规则都可以看做是一个子模型,规则集就是这些子模型的集合,将规则集与未见实例进行匹配,若匹配成功(满足规则体中的所有条件)则实例被预测为正例,...通过属性的信息增益不断地添加规则。   2. 通过剪枝对规则进行裁剪。 不同点:             1....将r’覆盖的样例去除, 在更新后的样例集上重复上述过程。 IREP* 1994年提出 IREP*:修改规则性能度量指标,替换IREP的准确率评估方法(增加了对反例的评估指标)。...对于规则集中每条规则r,RIPPER为它生成两个变体(替换规则与修订规则):   a. 基于每条规则r覆盖的样例,用IREP*重新生成一条规则,作为替换规则。   b....对每条规则r增加文字进行特化,再用IREP*剪枝生成一条规则,成为修订规则。 2. 原规则集、替换规则集、修订规则集,选择最优的规则集保留下来。

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    . | 基于非线性机械展开响应的端到端新蛋白生成使用语言扩散模型

    在机械展开响应方面,生成蛋白质的测量拉力向量与输入条件之间的R^2值和相对L2误差在案例中显示出单峰分布,中位数分别为0.56和0.36(图5,A和B)。...这些分布表明,在许多案例中,设计的蛋白质在整个机械展开过程中的趋势和值方面相当好地遵循输入条件。然而,如图4中的个别案例所示,在每个展开步骤精确遵循输入拉力值仍然是一个挑战。...同时,作者的模型生成的蛋白质在实现和有条件的机械属性之间仍然表现出合理的一致性,包括韧性(图5D)和强度(图5E)。...以拉力的最大值定义的强度显示出R^2值为0.41(图5E),略小于拉力分量的R^2值(如图5C中列出的0.54)。同时,韧性的R^2值为0.93,远高于拉力分量的R^2值(图5C)。...R^2值的这种差异表明,当考虑整个展开过程时,分量级误差倾向于相互抵消,设计的蛋白质在韧性方面更敏感地遵循输入条件。

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    mysql子查询

    子查询的结果传递给调用它的表表达式继续处理。 子查询分类 按返回结果集分类 子查询按返回结果集的不同分为4种:表子查询,行子查询,列子查询和标量子查询。...行子查询可以用于福查询的FROM子句和WHERE子句中。 列子查询:返回的结果集是一个行的集合,N行一列(N>=1)。 标量子查询:返回的结果集是一个标量集合,一行一列,也就是一个标量值。...可以指定一个标量表达式的任何地方,都可以用一个标量子查询。 从定义上讲,每个标量子查询也是一个行子查询和一个列子查询,反之则不是;每个行子查询和列子查询也是一个表子查询,反之也不是。...  由于列子查询返回的结果集是 N 行一列,因此不能直接使用 =   >   =   这些比较标量结果的操作符。...使用EXISTS关键字时,内层查询语句不返回查询的记录,而是返回一个真假值,如果内层查询语句查询到满足条件的记录,只要子查询中至少返回一个值,则EXISTS语句的值就为True。

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    apache rewritecond_hfile数据格式中的data字段用于

    如果匹配成功,mod_rewrite将寻找相应的规则条件,如果一个条件都没有,则简单地用Substitution构造的新值来替换URL,然后继续处理其他规则;但是如果条件存在,则开始一个内部循环按其列出的顺序逐个处理...如果匹配失败,则整个条件集和对应的规则失败;如果匹配成功,则执行下一个规则直到所有条件执行完毕。如果所有条件得以匹配,则以Substitution替换URL,并且继续处理。...这里的“当前”是指该规则生效时的URL的值。 2) Substitution是,当原始URL与Pattern相匹配时,用以替代(或替换)的字符串。...使用这个标记,可以链接若干RewriteConds以有条件地阻塞某些URL。...proxy|P (强制为代理 proxy) 此标记使替换成分被内部地强制为代理请求,并立即(即, 重写规则处理立即中断)把处理移交给代理模块。

    4.5K10

    Altdns:运用置换扫描技术的子域发现工具

    Altdns是一款运用置换扫描技术的子域发现工具,它可以帮助我们查找与某些排列或替换匹配的子域。AltDNS接受可能存在于域下的子域中的单词(例如测试,开发,分期),以及获取你知道的子域列表。...或者,你也可以使用-r命令,将生成的这些子域(多线程)直接解析后输出保存到文件当中。...dev,qa)- 单词以行分隔 -r命令解析每个生成的已排列的子域 -s命令用于指定altdns在哪保存已解析的排列子域结果。...results_output.txt将包含被发现有效的且具有DNS记录的排列后子域的最终列表。...-t命令用于指定解析器同时使用的线程数 -d 1.2.3.4将覆盖系统默认的DNS解析器,并使用指定的IP地址作为解析服务器。将其设置为目标域的授权DNS服务器,可能会提高解析的性能 截图 ? ?

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    用线性回归解释和R语言估计GARCH实例

    您可以在图像中清楚地看到这一点。此时,f(x)的微分为0。所以在这里,我们正在做的是找到图形的最小值。 现在让我们回到梯度下降。...所以现在,如果你看到这个等式,就可以理解它是如何工作的。对于任何θ,它将首先计算斜率,然后将这个斜率乘以学习率,使其变为比较小的值,然后从原始θ中减去该值并将θ替换为我们得到的值。...梯度下降的类型 有 3 种类型: 批次梯度下降 它计算训练集中每个示例的误差。评估完所有参数后,它会更新模型参数。...但由于我们的向量不能被认为是高斯分布的,使用最小二乘法也许不是最好的策略。实际上,如果我们的序列不是高斯分布的,它仍然是有条件的高斯分布的,因为我们假设 是高斯(强)白噪声。...观察一下,这些值更接近于用来生成我们的时间序列的值。 如果我们使用R函数来估计这些参数,我们会得到 > summary(garch(epsilon,c(0,1))) ...

    57010

    【React】1981- React 的 8 种条件渲染的方法

    它们就像组件的捕获块。 在条件渲染中的作用:当组件子树中出现错误时,错误边界有条件地渲染后备 UI。整个应用程序不会崩溃并显示白屏,而是仅将出现错误的组件子树替换为用户定义的后备 UI。...07、高阶组件 (HOC): HOC 是包装组件的函数,允许您重用组件逻辑。他们可以根据收到的 props 有条件地渲染组件,从而提供更灵活的方式来跨组件共享逻辑。...想象一下,我们有一个功能,应该只有拥有高级帐户的用户才能看到。我们将创建一个 HOC 来检查用户的帐户类型并有条件地相应地呈现组件。...它用于在组件之间共享渲染逻辑,允许您根据状态、道具或渲染prop中包含的逻辑有条件地渲染 UI 的不同部分。...当您想要隔离并有条件地渲染特定组件子树的后备 UI 时,请考虑使用它们。即使出现错误,错误边界也有助于保持流畅的用户体验。

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    iptables防火墙,常用规则整理

    常用选项 -t:指定要操纵的表; -A:向规则链中添加条目; -D:从规则链中删除条目; -i:向规则链中插入条目; -R:替换规则链中的条目; -L:显示规则链中已有的条目; -F:清楚规则链中已有的条目...; -Z:清空规则链中的数据包计算器和字节计数器; -N:创建新的用户自定义规则链; -P:定义规则链中的默认目标; -h:显示帮助信息; -p:指定要匹配的数据包协议类型; -s:指定要匹配的数据包源...ip地址; -j:指定要跳转的目标; -i:指定数据包进入本机的网络接口; -o:指定数据包要离开本机所使用的网络接口。...依葫芦画飘,通过上面的列子,我们再来添加一个禁ping的规则就很简单了。...下面的例子丢弃所有流入的ICMP包: iptables -A INPUT -p icmp -j DROP 上面的规则都是流入(INPUT),再来一个流出的列子。

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    Python中调用sklearn决策树

    3.内部节点:非根节点和叶节点的节点,该节点包含数据集中从根节点到该节点所有条件的数据集合。根据内部节点的判断条件结果,其对应的数据集合被分到两个或多个子节点中。 4.父节点:划分出子节点的节点。...默认值best,即在特征的所有划分点中找出最优划分点,random指随机地在部分特征中找局部最优划分点。 max_depth:控制树的最大深度,若节点的深度超过最大深度则剪枝,防止过拟合。...min_impurity_split:节点划分最小不纯度,默认值None, class_weight:设置样本各类别的权重,为了防止训练集中某些类别的样本过多,导致训练的决策树过于偏向这些类别。...默认值None,自动给数据集中的所有标签相同的权重。可以自己指定各个样本的权重,如果使用“balanced”,则算法会自己计算权重,样本量少的类别所对应的样本权重会高。...step3:配置环境变量:我的电脑--属性--高级系统设置--环境变量--系统变量--path--编辑--新建--D:\graphviz\bin(需替换成你安装graphviz的bin文件路径)--确定

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    Mysql数据库-子查询

    列子查询: 返回的结果是一列(多行单列) 3. 行子查询: 返回的结果是一行(单行多列) 4....仅支持标量子查询 子查询的结果直接出现在结果集中 2. from 后面:(有用) a. 支持表子查询 3. where或having后面: (重要) a....执行: 子查询的执行的次数依赖于外部查询,外部查询每执行一行,子查询执行一次 解释: 子查询中查询条件依赖于外层查询中的某个值,所以子查询的处理不只一次,要反复求值,以供外层查询使用....子查询在 select之后 # select之后, 可以跟的子查询类型 仅支持标量子查询(一个数据),子查询的结果直接出现在结果集中 1....那么这里的 0,我们可以使用 exists() 方法来替换,如下: select * from emp where exists(select * from emp where salary > 10000

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    理解mysql执行多表联合查询

    2)left join(左连接):取得左表(table1)完全记录,右表(table2)如果有条件相符合的记录就匹配,否则为null; 3) right join(右连接): 取得右表(table2)完全记录...,左表(table1)如果有条件相符合的记录就匹配,否则为null; 我们来看一个列子: 如下是user1表和user2表中的数据如下所示: image.png 一:inner join(内连接) 基本语法如下...:如果user表中的age字段值 等于 user2表中的age字段的值的话,那么就会把所有的数据都查询出来,如果该表中的字段age值不相等的话,那么user表中的记录会全部查询出来,user2表中的所有字段为...null值。...,就是说 如果条件相等的话,就会把两张表的数据都查询出来,如果不相等的话,就会把第二张表的数据查询出来,第一张表的数据字段值为null.

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