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基于随机森林方法缺失填充

本文中主要是利用sklearn中自带波士顿房价数据,通过不同缺失填充方式,包含均值填充、0填充、随机森林填充,来比较各种填充方法效果 ?...有些时候会直接将含有缺失样本删除drop 但是有的时候,利用0、中值、其他常用或者随机森林填充缺失效果更好 sklearn中使用sklearn.impute.SimpleImputer类填充缺失...填充缺失 先让原始数据中产生缺失,然后采用3种不同方式来填充缺失 均值填充 0填充 随机森林方式填充 波士顿房价数据 各种包和库 import numpy as np import pandas...,被选出来要填充特征非空对应记录 Xtest = df_0[ytest.index, :] # 空对应记录 # 随机森林填充缺失 rfc = RandomForestRegressor...均方误差本身是种误差loss,通过负数表示 R^2:回归树score返回真实R平方,不是MSE R^2=1-\frac{u}{v} u=\sumN_{i=1}(f_i-y_i)2 v=\sum^

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实践|随机森林中缺失处理方法

除了在网上找到一些过度清理数据集之外,缺失无处不在。事实上,数据集越复杂、越大,出现缺失可能性就越大。缺失是统计研究一个令人着迷领域,但在实践中它们往往很麻烦。...特别是,不需要以任何方式插补、删除或预测缺失,而是可以像完全观察到数据一样运行预测。 我将快速解释该方法本身是如何工作,然后提供一个示例以及此处解释分布式随机森林 (DRF)。...因此X_1丢失概率取决于X_2,这就是所谓随机丢失”。这已经是一个复杂情况,通过查看缺失模式可以获得信息。也就是说,缺失不是“随机完全缺失(MCAR)”,因为X_1缺失取决于X_2。...由于真相被给出为 NA 估计甚至稍微更准确(当然这可能只是随机性)。同样,(方差)估计量方差估计随着缺失增加而增加,从 0.15(无缺失)增加到 0.23。...结论 在本文[1]中,我们讨论了 MIA,它是随机森林中分裂方法一种改进,用于处理缺失。由于它是在 GRF 和 DRF 中实现,因此它可以被广泛使用,我们看到小例子表明它工作得非常好。

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R语言中特殊缺失NA处理方法

R语言中存在一些null-able values,当我们进行数据分析时,理解这些是非常重要。...通常来说,R语言中存在: NA NULL NaN Inf/-Inf 这四种数据类型在R中都有相应函数用以判断。 NA NA即Not available,是一个长度为1逻辑常数,通常代表缺失。...缺失NA处理 理解完四种类型数值以后,我们来看看该采取什么方法来处理最常见缺失NA。 小白学统计在推文《有缺失怎么办?系列之二:如何处理缺失》里说“处理缺失最好方式是什么?...4 回归填补法 假定有身高和体重两个变量,要填补体重缺失,我们可以把体重作为因变量,建立体重对身高回归方程,然后根据身高缺失,预测体重缺失。..., Inf》 https://www.r-bloggers.com/2018/07/r-null-values-null-na-nan-inf/ 小白学统计《有缺失怎么办?

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R语言缺失处理结果可视化

缺失发现和处理在我们进行临床数据分析时候是非常重要环节。今天给大家介绍一个包mice主要用来进行缺失发现与填充。同时结合VIM包进行缺失变量可视化展示。...##查看数据缺失模式md.pattern(nhanes) ? 还有另外一种描述展示: fluxplot(nhanes) ? 从上图我可以看出变量越往左上代表确实越少,越往右下代表缺失越严重。...接下来就是我们如何填充呢,缺失填充函数mice中包含了很多填充方法: ?...图中蓝色为原始数据,红色为推算结果。可以看出基本分布式是一致,,当然也存在一定差异。 我们也可以直接看全部变量情况: stripplot(imp) ?...图中橘黄色代表填充点数据。当然还有一个impute包专门用来进行缺失填充,大家可以根据自己需要进行选择,我是觉得有图有真相。

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超详细 R 语言插补缺失教程来啦~

在分析数据集时,常常会碰到一些缺失,如果缺失数量相对总体来说非常小,那么直接删除缺失就是一种可行方法。但某些情况下,直接删除缺失可能会损失一些有用信息,此时就需要寻找方法来补全缺失。...今天小编给大家介绍一个用来处理缺失 R 包——MICE,本文为译文,原文链接[1]及参考文章[2]见文末。...该包为多元缺失数据创建多个输入(替换),其中每个不完全变量由一个单独模型输入。MICE 算法支持输入数据类型有:连续、二、无序分类和有序分类数据。...数据处理 本文,我们将使用 R 自带一个空气质量数据集airquality来估算缺失。为了介绍 mice 包用法,先从数据集中删除一些数据点,制造一个缺失数据集。...缺失被编码为 NA。 m:多重插补法数量,默认为 5。 method:指定数据中每一列输入方法。

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R语言缺失处理:线性回归模型插补

---- 视频 缺失处理:线性回归模型插补 ---- 我们在这里模拟数据,然后根据模型生成数据。未定义将转换为NA。一般建议是将缺失替换为-1,然后拟合未定义模型。...默认情况下,R策略是删除缺失。...现在让我们尝试以下策略:用固定数值替换缺失,并添加一个指标, B=rep(NA,m) hist(B,probability=TRUE,col=rgb(0,0,1,.4),border=...5%缺失,我们有 ​ 如果我们查看样本,尤其是未定义点,则会观察到 ​ 缺失是完全独立地随机选择, x1=runif(n) plot(x1,y,col=clr) ​ (此处缺失...这个想法是为未定义缺失预测预测。最简单方法是创建一个线性模型,并根据非缺失进行校准。然后在此新基础上估算模型。

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R 数据整理(三:缺失NA 处理方法汇总)

,比如我们想要获得缺失所在行呢?...其会返回一个矩阵,对应缺失会在对应位置返回一个TRUE,如果这时候通过which 获取,其只会返回一个坐标,这是因为数据框经过is.na 后返回一个矩阵,而矩阵坐标关系和向量又非常微妙,其本质也就是向量不同排列...我们都知道,布尔实际就是0和1,我们可以利用这个特性,获得那些经过is.na 后,行和不是0 行,那就代表其存在表示TRUE(NA)数据了: > rcmat[!...替换为指定数值: > X X1 X2 1 A 1 2 B NA 3 C 3 4 D 4 5 E 5 6 6 > replace_na(X$...非常贴心缺失替换为其所在列上一行数值: > fill(X,X1,X2) X1 X2 1 A 1 2 B 1 3 C 3 4 D 4 5 E 5 6 E 6 >

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102-R数据整理12-缺失高级处理:用mice进行多重填补

(zhihu.com)[4] 前言 其实之前我也介绍过缺失处理:[[28-R数据整理03-缺失NA处理]]。...主要分为三类: 完全随机缺失 (Missing Completely at Random, MCAR) 数据缺失是完全随机,不依赖于任何不完全变量或完全变量,不影响样本无偏性。...在前两种情况下可以根据其出现情况删除缺失数据,而在第三种情况下,删除包含缺失数据可能会导致模型出现偏差。因此我们需要对删除数据非常谨慎。而且,插补数据并不一定能提供更好结果。...3.2-填补法 简单随机填补:对于每一个缺失,从已有的该变量数据中随机抽样作为填补,填补进缺失位置。仅仅考虑到了缺失变量本身,而并没有考虑到相关变量信息。因此,信息量利用少。...简单而言:该方法认为缺失随机,它可以通过已观测到进行预测与插

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(数据科学学习手札58)在R中处理有缺失数据高级方法

,因此怎样妥当地处理缺失是一个持续活跃领域,贡献出众多巧妙方法,在不浪费信息和不破坏原始数据分布上试图寻得一个平衡点,在R中用于处理缺失包有很多,本文将对最为广泛被使用mice和VIM包中常用功能进行介绍...  缺失是否符合完全随机缺失是在对数据进行插补前要着重考虑事情,VIM中marginplot包可以同时分析两个变量交互缺失关系,依然以airquality数据为例: marginplot(data...如上图所示,通过marginplot传入二维数据框,这里选择airquality中包含缺失前两列变量,其中左侧对应变量Solar.R红色箱线图代表与Ozone缺失对应Solar.R缺失数据分布情况...,蓝色箱线图代表与Ozone未缺失对应Solar.R缺失数据分布情况,下侧箱线图同理,当同一侧红蓝箱线图较为接近时可认为其对应考察另一侧变量缺失情况比较贴近完全随机缺失,这种情况下可以放心大胆地进行之后插补...,具体用法下文示例中会详细说明 maxit: 整数,用于控制每个数据框迭代插补迭代次数,默认为5 seed: 随机数种子,控制随机数水平     在对缺失插补过程中,非常重要是为不同变量选择对应方法

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R语言数据分析与挖掘(第一章):数据预处理(2)——缺失常用处理方法

上一篇文章(缺失处理)介绍了缺失处理判断方法,这一讲接着介绍缺失常用几种处理方法:删除法,替换法和插补法。不同方法对应不同类型缺失。...1.删除法 如果缺失比例很小,且不影响整体数据结构,即缺失类型是完全随机缺失时,可以考虑将缺失删除,该方法操作非常简单,使用函数na.omit()就可以将含有缺失行删除。...complete.cases(algae)) [1] 0 2.替换法 直接删除含有缺失行记录代价和风险较大,故我们可以考虑将缺失部分替换掉,如用均值去替换,即均值替换法,该方法根据变量不同类型选择不同替换...complete.cases(algae)) [1] 0 但是均值替换法还是存在一些问题,因为该方法适用于处理完全随机缺失数据,且会改变整体数据统计性质,比如方差变小,存在偏差等,因此在在实践中并不常用...3.插补法 实战中常用方法是插补法,随机插补思想类似,利用非缺失数据均值或者随机数来填补缺失,下面我们详细介绍多重插补。

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没有完美的数据插补法,只有最适合

在前两种情况下可以根据其出现情况删除缺失数据,而在第三种情况下,删除包含缺失数据可能会导致模型出现偏差。因此我们需要对删除数据非常谨慎。请注意,插补数据并不一定能提供更好结果。 ?...因为完全随机缺失(MCAR)假设通常很难被满足。因此本删除方法会造成有偏差参数与估计。...inplace=True) Time-Series Specific Methods 时间序列分析专属方法 前推法(LOCF,Last Observation Carried Forward,将每个缺失替换缺失之前最后一次观测...首先,因为替换是根据其他变量预测,他们倾向于“过好”地组合在一起,因此标准差会被缩小。我们还必须假设回归用到变量之间存在线性关系——而实际上他们之间可能并不存在这样关系。...在本方法中,我们根据某种距离度量选择出k个“邻居”,他们均值就被用于插补缺失数据。这个方法要求我们选择k(最近邻居数量),以及距离度量。

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机器学习基础:缺失处理技巧(附Python代码)

1、缺失查看 首先,需要查看缺失缺失数量以及比例(#数据使用kaggle平台上预测房价数据) import pandas as pd # 统计缺失数量 missing=data.isnull...df['a'] = df['a'].interpolate() # 用前面的替换, 当第一行有缺失时,该行利用向前替换可取,仍缺失 df.fillna(method='pad') # 用后面的替换...,当最后一行有缺失时,该行利用向后替换可取,仍缺失 df.fillna(method='backfill')#用后面的替换 方式4:KNN填充 利用knn算法填充,其实是把目标列当做目标标量,利用非缺失数据进行...有时候,可以根据某个字段是否缺失,进行新变量衍生,比如,"信用卡数量",若该字段缺失,代表'无信用卡',则可以根据"信用卡数量"是否缺失衍生'有无信用卡'字段,这种衍生很可能是很有效果。...4、总结 总之,处理缺失是需要研究数据规律与缺失情况来进行处理,复杂算法不一定有好效果,因此,还要具体问题具体分析,尤其是要搞明白字段含义以及缺失意义,这往往容易被忽略。

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机器学习基础:缺失处理技巧(附Python代码)

1、缺失查看 首先,需要查看缺失缺失数量以及比例(#数据使用kaggle平台上预测房价数据) import pandas as pd # 统计缺失数量 missing=data.isnull...df['a'] = df['a'].interpolate() # 用前面的替换, 当第一行有缺失时,该行利用向前替换可取,仍缺失 df.fillna(method='pad') # 用后面的替换...,当最后一行有缺失时,该行利用向后替换可取,仍缺失 df.fillna(method='backfill')#用后面的替换 方式4:KNN填充 利用knn算法填充,其实是把目标列当做目标标量,利用非缺失数据进行...有时候,可以根据某个字段是否缺失,进行新变量衍生,比如,"信用卡数量",若该字段缺失,代表'无信用卡',则可以根据"信用卡数量"是否缺失衍生'有无信用卡'字段,这种衍生很可能是很有效果。...4、总结 总之,处理缺失是需要研究数据规律与缺失情况来进行处理,复杂算法不一定有好效果,因此,还要具体问题具体分析,尤其是要搞明白字段含义以及缺失意义,这往往容易被忽略。

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R语言中进行缺失填充:估算缺失

在大多数统计分析方法中,按列表删除是用于估算缺失默认方法。但是,它不那么好,因为它会导致信息丢失。 在本文中,我列出了5个R语言方法。...链式方程进行多元插补 通过链式方程进行多元插补是R用户常用。与单个插补(例如均值)相比,创建多个插补可解决缺失不确定性。...如果X1缺少,那么它将在其他变量X2到Xk上回归。然后,将X1中缺失替换为获得预测。同样,如果X2缺少,则X1,X3至Xk变量将在预测模型中用作自变量。稍后,缺失将被替换为预测。...这可以通过调整mtry和ntree参数来改善  。mtry是指在每个分割中随机采样变量数。ntree是指在森林中生长树木数量。...> impute_arg 输出显示R²作为预测缺失。该越高,预测越好。

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机器学习基础:缺失处理技巧(附Python代码)

1、缺失查看 首先,需要查看缺失缺失数量以及比例(#数据使用kaggle平台上预测房价数据) import pandas as pd # 统计缺失数量missing=data.isnull()...df['a'] = df['a'].interpolate() # 用前面的替换, 当第一行有缺失时,该行利用向前替换可取,仍缺失df.fillna(method='pad') # 用后面的替换...,当最后一行有缺失时,该行利用向后替换可取,仍缺失df.fillna(method='backfill')#用后面的替换 方式4:KNN填充 利用knn算法填充,其实是把目标列当做目标标量,利用非缺失数据进行...有时候,可以根据某个字段是否缺失,进行新变量衍生,比如,"信用卡数量",若该字段缺失,代表'无信用卡',则可以根据"信用卡数量"是否缺失衍生'有无信用卡'字段,这种衍生很可能是很有效果。...4、总结 总之,处理缺失是需要研究数据规律与缺失情况来进行处理,复杂算法不一定有好效果,因此,还要具体问题具体分析,尤其是要搞明白字段含义以及缺失意义,这往往容易被忽略。

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如何处理缺失

1、随机缺失(MAR):随机缺失意味着数据点缺失倾向与缺失数据无关,而是与一些观察到数据相关 2、完全随机缺失(MCAR):某个缺失事实与它假设以及其他变量无关 3、非随机缺失(MNAR...请注意,归集并不一定会给出更好结果。 ?...这两种方法都会在分析中引入偏差,并且在数据有明显趋势时表现不佳 线性插 该方法适用于具有一定趋势时间序列,但不适用于季节数据 ? ? 数据:Tsairgap表单库(输入),红色插数据 ?...首先,因为替换是从其他变量中预测出来,它们往往“非常吻合”,所以标准误差被缩小了。当回归方程中使用变量可能不存在线性关系时,还必须假设它们之间存在线性关系。...然后,汉明距离等于不同属性数量。 KNN算法最吸引人特性之一是它易于理解和实现。KNN非参数特性使它在某些数据可能非常“不寻常”情况下具有优势。

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机器学习基础与实践(一)——数据清洗

对于不同数据场景应该采取不同策略,首先应该判断缺失分布情况: ? 数据情况如下: ? 可以看到,第2列已经出现了缺失,现在我们来看一下缺失数量: ?...我们常用方法有以下几种: 1.直接删除----适合缺失数量较小,并且是随机出现,删除它们对整体数据影响不大情况 2.使用一个全局常量填充---譬如将缺失用“Unknown”等填充,但是效果不一定好...缺点:当缺失数据不是随机数据时会产生偏差.对于正常分布数据可以使用均值代替,如果数据是倾斜,使用中位数可能更好。...4.插补法 1)随机插补法----从总体中随机抽取某个样本代替缺失样本 2)多重插补法----通过变量之间关系对缺失数据进行预测,利用蒙特卡洛方法生成多个完整数据集,在对这些数据集进行分析,最后对分析结果进行汇总处理...用箱均值光滑:箱中每一个被箱中平均值替换。 用箱中位数平滑:箱中每一个被箱中中位数替换。 用箱边界平滑:箱中最大和最小同样被视为边界。箱中每一个被最近边界替换

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