在一篇论文中,最引人注目的除了标题和摘要,便是嵌于文中的各种图表了。而图形凭借其更为直观的表达效果一直备受学术界青睐,可以说如何用更为美观的图形更恰当、更全面、更精准地展现研究结果,是所有研究者一直在探索的课题。
首先,在这里先跟大家说声对不起,技术团队最近一直在做课程开发,本着宁缺毋滥的原则,我们的微信文章一再搁置,在编辑部催了无数遍之后,终于可以把课程放出来给大家了。
今天给大家介绍一款在开源世界里集万千宠爱于一身的软件——R语言。 有多受宠呢?简单说,你能想到的地方都有它的身影。 做学术?看看R在各大语言排名系统的表现 O' reilly media在过去几年中
(1)作图:只需要知道图的名字,用的什么R包即可自行作图。进阶版可以将别人的代码套在自己的数据上,但这需要一定的R语言功底和解决报错的能力。
今天学习的内容主要是R语言基础以及RStudio,其实之前稍微接触过一些R语言,R语言也是早就安装好的软件,这次学习就不从安装R语言开始学习了。然后主要对之前没有学习过的知识点做了笔记。
上次分享了小提琴曲线(violin plot)的作图方法,今天小仙同学给大家介绍一下如何用R画出漂亮的密度图(density plot)。
原创:黄小仙 今天给大家分享的是Lollipop chart(棒棒糖图)的画法。棒棒糖图的用途跟条形图的用法类似,只是看起来更加美观一些,图表形式更加丰富(数据不够、拿图来凑,啥也不能阻止我优秀 )
RStudio 是R语言的开源集成开发环境(IDE),含脚本编辑器,console/ terminal ,environment /history, file /plot/ package 四个模块。
目前FreeScript已完成对JScript、VBScript、C#、VB.NET、PowerShell、javascript、python、R语言的支持,可以借助FreeScript,在Excel/WPS环境下使上上述编程语言无限扩展电子表格的使用边界,能力无上限,只差你的想象力让它腾飞起舞。
plot(rnorm(999,0,1))随机生成正态分布的999个数,mean为0,sd为1plot(runif(999,0,5))随机生成999个数,最小值为0,最大值为5图片
R语言是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的[S语言]的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。而S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和作图的[解释型语言]。最初S语言的实现版本主要是S-PLUS。S-PLUS是一个[商业软件],它基于S语言,并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善。后来新西兰奥克兰大学的Robert Gentleman和Ross Ihaka及其他志愿人员开发了一个R系统。由“R开发核心团队”负责开发。R可以看作贝尔实验室(AT&T BellLaboratories)的RickBecker,JohnChambers和AllanWilks开发的S语言的一种实现。当然,S语言也是S-Plus的基础。所以,两者在程序语法上可以说是几乎一样的,可能只是在函数方面有细微差别,程序十分容易地就能移植到一程序中,而很多一的程序只要稍加修改也能运用于R。
今日学习任务:1、安装R和Rstudio;2、认识R和Rstudio;3、学会外观设置和基本操作;4、完成第一个R做的图
今天分享R语言中的柱形图,所有图表语法都基于ggplot2包中的ggplot函数完成 。 其实R语言本身就带有各种作图函数,比如plot、bar、pie等,而且语法非常简单明了,为什么还要用ggplot2这种语法独立性很强、自成体系的作图包来作图呢? 一个例子就能感受到: plot(mpg$cty,mpg$hwy)#R语言内置散点图函数(无需加载任何辅助工具包) ggplot(mpg,aes(cty, hwy)) + geom_point(colour="steelblue")+labs(x = "City
从RStudio官网下载MacOS版本RStudio安装包。对于MacOS,安装选择默认路径即可。
此乃旧文,题目改一下,有点系统性,JSA助攻第一波:可以通过Application.Run接口,借助FreeScript插件,让WPS的JSA环境,用上外部主流编程语言及其生态库资源,只需要安装FreeScript,就能让WPS拥有此能力。
比如李东风的这本:23 用bookdown制作图书 | R语言教程 (pku.edu.cn)[3]
往期的教程里详细为大家做了R语言安装和环境配置的课程,错过的喵咪们,课前赶紧复习一下吧。生物信息系列课程-R语言入门;挖掘GEO速成SCI文章系列教程(3)-R语言基础。古语云“字如其人”,现在讲“第一印象”,说的都是形象、气质的重要作用,在科研领域而言,规范的、高质量的图片是发表高水平文章的必备条件。有请我们科研猫特聘作图系列讲师,飞飞老师~
最近小仙同学在好几篇文献里看到了这种小提琴图,暂时就肤浅地认为这是作者为了更好地比较对照组与实验组的差别,所以将同一个基因的小提琴图各画了一半,放在一起。为了跟上可视化的潮流,小仙也来尝试画一下这个没查到正经名字的图。
最近开始学习R语言,把学习笔记和小伙伴们分享一下吧,欢迎一起交流 R 起源: R是S语言的一种实现。S语言是由 AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析、作图的解释型语言。最初S语言的实
这一节其实也没有必要细看。只需要记住一句话就可以了R语言功能很强大,基本可以满足我们日常科研任务中的数据分析和数据可视化的需求
今天跟大家分享的是数据地图系列的第七篇——使用R语言制作热力数据地图! 也许很多小伙伴儿对于R语言还很陌生,感觉很神秘。 确实,R语言的数据地图需要使用很长的代码来写。但是就像我们学习高数和微积分一样,再复杂再庞大的公式,都会有计算软件帮你代劳,而你只需要知道怎么调整参数、控制路径,并且明白每一句代码的实现功能就可以了,无需记住每一串代码的详细内涵和写法。 而且接下来要写的诸多代码,大部分都并非自己写的,而是从网上拼凑,经过整理与汇总后的。坦白的说,绝大部分自己都写不出来,语法也很费解,只是勉强知道大概可以
在数据分析和交互、探索性核算以及数据可视化等方面,Python 将不可避免地接近于其他开源和商业的领域特定编程言语/工具,如R、MATLAB、SAS、Stata等。近年来,由于 Python 有不断改良的库(主要是 pandas),使其成为数据处理使命的一大代替计划。结合其在通用编程方面的强大实力,我们完全可以只使用 Python 这一种编程语言去构建以数据为中心的应用程序。R语言是由 AT&T 贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和作图的解释型语言。 📷 数据挖掘一般是指从大量的数据中通过算法搜
列线图(Alignment Diagram),又称诺莫图(Nomogram图),它是建立在多因素回归分析的基础上,这里的回归既包括Logistic回归也包括cox回归,通过回归分析将多个预测指标进行整合,然后采用带有刻度的线段,表达预测模型中各个变量之间的相互关系。
https://seananderson.ca/2013/10/19/reshape/
本文介绍了自己在过去一年里所看的一些书,并分享了从中获得的一些感悟和思考。作者认为,读书是一种非常好的方式,可以帮助人们从已有的认知中获取新的知识和灵感。在阅读这些书籍时,作者关注了书中所介绍的一些方法和技巧,并思考如何将其应用到实际工作中。同时,作者也强调了分享和交流的重要性,认为通过分享和交流,可以扩大自己的认知边界,也可以帮助他人更好地理解某些概念和想法。总的来说,作者认为读书是一种非常有益的活动,可以帮助人们更好地理解世界和思考问题。
早期的数据小魔方用户大概都知道,我最初也是从学习Excel起步的,只是学习的深入了之后,才开开慢慢的迁移到R语言。 我往R语言转型并不代表自己开始放弃Excel或者觉得Excel不适合做可视化,只是想体验一下Excel外围的可视化世界是什么样子的,毕竟在这个大行业内,还活跃着太多可视化领域的佼佼者,譬如 PowerBI、Tableau等。 当然,这些软件各有特点,但是在要划分一个类别的话,我觉得可以划分为三类: Excel(以及寄生于Excel平台的各种辅助软件dashboard、Think-cell-ch
统计学与数据挖掘书籍推荐 1.1《 The Elements of Statistical Learning 》,神书,不解释 1.2《实用多元统计分析》,从线性代数的角度详细讲解算法,例子简单,国外课程教材 1.3《统计学习方法》,李航著,统计学习算法必备书籍 1.4《从零进阶!数据分析的统计基础》 CDA 数据分析师系列丛书 1.5《统计学:从数据到结论》 1.6《数据挖掘:概念与技术》 数据分析软件篇 SQL 书籍推荐 《 MySQL 必知必会》 SPSS 推荐书籍 《SPSS统计分析基
R是一种编程语言,他不同于C、Java、python等计算机编程语言,是一种专门针对统计分析、绘图、数据挖掘等数据研究开发出来的数学编程语言。那么在我的认识里,他就是和Excel、origin、SPSS等统计分析作图软件类似的一个工具。
如果你的用户名不幸是中文的,那就必须改为英文,否则无法安装Rstudio,中文处理方法,参考
[]中括号里面的可以是逻辑值判断,可以是具体的值(即下标),可以是函数,可以是向量
小仙最近受到了一个打击,之前小仙以为自己写的教程已经比较适合入门了,初学的选手就跟着就能画出图。但是小仙却忽略了一点,粉丝们可能来自不同的行业,拥有不同的专业背景。有些同学可能在特定的情况下接触到了R语言,在下定决心要自己试试的时候,却不知如何入手。
即便小仙同学决定学习R语言来提升自己作图的“逼格”的时候,心中还有有些疑虑的(嘿嘿,我这么懒,可不愿意做无用功了?)。仔细想了想,貌似又找到了两个学习的理由。 一是R可以帮助我们避免重复劳动,实现“
这里大部分都是英文的书。国内对于R的书籍的翻译中文几乎可以忽略的说。 1.入门级读物 R的帮助文档中提供了一些入门的读物,比如《Anintroduction to R》,是R早期入门的权威读物,这本书有中文版,叫做《R导论》 。另一本早期的著名入门读物是《R for beginners》,也有中文版,译名《R入门》 。国内关于R的一本早期的经典读物是《统计建模与R软件》,写得比较全面,特别是适合做概率统计和多元统计的参考书来用。 新近的一些比较好的入门书比如《R in action》,是Manning出
方差分析是统计分析应用中最广的方法了,可是怎么用R语言进行统计分析呢?当然, 农业试验中, 一般都是随机区组, 多因素随机区组, 裂区试验, 一年多点, 多年多点, 这里我们用最简单的示例讲解一下如何使用R语言进行分析. 其它试验设计的分析方法放在以后的微信文中进行讲解.
2.服务器可以配置自己的Rstudio,供大家远程登陆,用浏览器打开后面加上:8787就可以登录,但是阿里云并没有自带,用自己电脑完全可以。
geom_label可以使用fill对颜色进行填充,fontface设置字体,geom_text不能填充颜色
上次给大家分享了蜜蜂图的画法,这篇文章是在上次文章的基础上进行了一些拓展。蜜蜂图基本的作图语句可以看这里 https://mp.weixin.qq.com/s/XgtoTiz_aUNWmobvjPRSIQ
R是一种用于分析数据的领域特定语言。为什么数据分析需要自己的领域特定语言(DSL) ? R语言擅长些什么,不擅长什么?开发人员该如何利用R语言的优势并减轻其弱点? 在GOTO Conference中,
原创 黄小仙 即便小仙同学决定学习R语言来提升自己作图的“逼格”的时候,心中还有有些疑虑的(嘿嘿,我这么懒,可不愿意做无用功了?)。仔细想了想,貌似又找到了两个学习R的理由。 一是R可以帮助我们避免
觉得基础作图的 R 代码太啰嗦,不成体系(R基础作图合集)?觉得 ggplot2 还是太复杂了不适合自己(ggplot2合集)?那有没有更简单点的?比如说,最好是躺着就能出图的那种。
在这些内容的基础上,我们在这个部分为大家介绍一些实用知识,包括描述工作区结构、图形设备以及它们的参数等问题,还有初级编程和数据输入输出。
这个是做植物基因组比对的一个工具,正好最近在看这个论文。论文中公布了部分作图代码,作图使用到的是R语言的ggplot2。跟着其中的代码学习一下。论文本地文件是e2113075119.full.pdf
建国70周年大庆即将到来,各行各业都在积极筹备迎接祖国的生日,在这个举国欢腾的时刻,我们决定以一种特殊方式来表达自己对祖国母亲的祝福:一副用R语言绘制的中国地图。
总结一下我读过的机器学习/数据挖掘/数据分析方面的书,有的适合入门,有的适合进阶,没有按照层次排列,先总结一下,等总结的差不多了再根据入门--->进阶分块写。下面列的书基本上我写的都是读完过的,不然不敢写,怕误人子弟 = = 数据分析篇 实习的时候只会Matlab,公司小,没钱买正版,所以领导要我两星期把R学会,当时看的有这些书 1.R语言实战 https://book.douban.com/subject/20382244/ 评价:很好的入门书,从安装、入门、基本的统计分析,作图命令,以及常见的分类、回
总结一下我读过的机器学习/数据挖掘/数据分析方面的书,有的适合入门,有的适合进阶,没有按照层次排列,先总结一下,等总结的差不多了再根据入门--->进阶分块写。下面列的书基本上我写的都是读完过的,不然不敢写,怕误人子弟 = =,持续更新ing~ 数据分析 实习的时候只会Matlab,公司小,没钱买正版,所以领导要我两星期把R学会,当时看的有这些书 1.R语言实战 评价:很好的入门书,从安装、入门、基本的统计分析,作图命令,以及常见的分类、回归、降维等方法都有写 推荐指数:五颗星 2.数据分析-R语言实战 评
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