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R语言绘制中国地图：着色省份、标注名称

本次绘图是对《R语言绘制中国地图：着色省份、标注省份名称地图》中基础地图数据缺失（链接失效）的更新，基础地图数据来源《R语言地图数据更新（来自高德阿里云）》声明：仅供于交流学习，不得用于商业和学术期刊中...感觉大地图能让大家更充分认识海洋，特别是南海） library(ggplot2) library(sf) library(geojsonsf) library(RColorBrewer) ## 通过阿里云获得中国地图

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R语言 | ggplot2绘制标准中国地图

由于基础图表绘制系列推文还在加紧准备中，所以这期推文还是对一些感兴趣的图表进行绘制，这期涉及空间图表绘制，主要涉及知识点如下： ggplot2 + sf 中国标准地图绘制 cowplot 包实现地图子图插入...ggplot2 + sf 中国标准地图绘制本期的绘图我们是按照如下图表进行绘制的(该图来自朋友公号)：其实我很早就想试着用R进行此类图表的绘制了，但由于强大的Arcgis和绘图进度等原因，导致迟迟没有进行...，这期就进行此类图表的绘制。...地图读取和散点标注这里的中国地图格式为 geojson 格式，还是使用sf包进行灵活读取，具体代码如下： china_shp <- "中国省级地图GS（2019）1719号.geojson" nine...气象绘图教程合集用ggpubr包制图 R-ggdist - 分布和不确定性可视化

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R语言绘制中国地图：着色省份、标注省份名称

今天分享一个可以直接使用的中国地图，相较于其他R语言绘制的地图，有以下优点： 1、包含十段线 http://xzqh.mca.gov.cn/map 2、标注省份名称缺点：南海岛礁未绘制小地图重点说明...st_centroid和省会坐标以及部分调整值，github：slyang-cn/data/province.csv （个人认为这是一份非常有价值的坐标数据，值得学习一下） 01 — 效果图包含十段线和省名标注的中国地图...::left_join(China,zhuose_data,by= "QUHUADAIMA") ###----全国地图完整（无右下角小地图）----------### ggplot()+ # 绘制主图...1000","1000+"), labels = c("0~200","200~400","400~600","600~1000","1000+"))+ # 绘制国境线及十...y=dili_Wd,label=省市), position = "identity",size=3,check_overlap = TRUE) + labs(title="中国地图

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【科研猫·绘图】献礼国庆70年，R语言绘制中国地图

建国70周年大庆即将到来，各行各业都在积极筹备迎接祖国的生日，在这个举国欢腾的时刻，我们决定以一种特殊方式来表达自己对祖国母亲的祝福:一副用R语言绘制的中国地图。 ?...R软件集统计分析与高级绘图于大成，是最适合做这项工作了。关于R语言绘制地图，可能大家还心存疑问，感觉R语言是无法完成这些工作的，下面我们逐一看来。...LEVEL 1 绘制地图之前，需要获取地图的数据，包括世界地图、中国地图或者各省市地图都一样。...在这里，我们把中国地图的GIS文件分享给大家（详情见文末客服：胖雨小姐姐）。绘制地图非常简单，只要加载几个常用的R包即可。然后读取gis文件就能直接作图。 ?...作为数据分析师，没有什么比自己动手绘制一幅涵盖祖国大好河山的地图更有意义了，于是乎，我们纯用R语言（没有用到任何后期制图软件哦），通过不同的绘图函数，给祖国的生日献上一幅漂亮的中国地图。 ?

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R语言绘制中国地图，并展示流行病学数据

R软件集统计分析与高级绘图于大成，是最适合做这项工作了。关于地图的绘制过程，谢益辉、邱怡轩和陈丽云等人都早有文章讲述，开R地图中文教程之先河。由于目前指导毕业论文用到，因此研究了一下。...1 地图GIS数据的来源与R绘制软件包 中国地图GIS数据的官方数据可以在国家基础地理信息中心的网站（http://nfgis.nsdi.gov.cn）里面可以免费下载。...但是老版数据中，市级数据中缺少绘制区域的多边形数据，让市级分布图的绘制稍麻烦一些，新版中也许会有改进。用R绘制地图比较简单。...在这一点上，R的ggplot2包提供了专门的coord_map()函数。所以推荐R的ggplot2包来绘制地图。...解决方案有两个：一个是另辟蹊径，从非官方的www.gadm.org下载一份shp格式的中国地图来绘制；另一个解决方案是从官方发布的县级地图入手，根据ADCODE99编码适当合并

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R语言绘制双标图

今天跟大家介绍下此图在R语言中的绘制。首先我们看下在R语言中实现双标图的绘制所需要的包ggbiplot和GGEBiplotGUI。...两个包各自有各自的优势，GGEBiplotGUI绘制的图形界面比较简化，但是包含多种绘制形式；ggbiplot借用了ggplot2的优势可以使得图像更加美化，但是呢，绘制形式比较单一。 ?...接下来我们看下如何绘制双标图：首先看下GGEBiplotGUI这个包的，我们直接看实例，因为就只有一个命令： data(Ontario) GGEBiplot(Data = Ontario) ?...从上面的例子我们也可以看出，虽然此包包含了的很多样式的绘制，但是最为可以拿得出手的科研图来说，还是有点太过简单了，接下来我们看下一个更加美观的双标图的绘制包ggbiplot。...此包包含的功能也是很单一，就三个函数绘制双标图（ggbiplot），绘制碎石图（ggscreeplot），及一个数据集（wine）。那么我们就直接入主题，来看下函数ggbiplot： ?

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R语言绘制Circos图

今天我们介绍在R语言中如何绘制Circos图。首先我们看下Circos的官网（http://circos.ca/），其实他们提供了自己的绘制工具包，为了更加方便绘制Circos。...我们利用了R语言中的circlizeR包进行Circos的绘制。 ? 1. Install.packages(“circlize”)#安装R包。 2. R包的载入之后的状态 ? 3....我们看下R包中可以实现的功能函数列表。...，cell也是矩形 circos.polygon 绘制多边形，或者说是阴影区域 circos.segments 绘制两点之间直线 circos.axis,circos.xaxis,circos.yaxis...circos.genomicInitialize 基因染色体分布图形绘制不带条图 circos.genomicHeatmap 绘制热图 circos.genomicDensity 基因密度图绘制 circos.genomicLabels

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R语言之heatmap绘制

今天我们介绍关于R语言绘制热图的一种方法，那就是利用pheatmap包进行热图的绘制。...通过bioconductor安装： source("http://biocoundctor.org/biocLite.R") biocLite("pheatmap") 2 R包的调用：...3 热图的绘制函数就是pheatmap函数，对其参数做以下介绍：官方的参数初始情况如下图： ? 我们看到它的参数设置和其他的heatmap绘制函数基本一致。...那么我们今天主要讲里面几个主要的参数，具体的热图绘制，调用函数的时候注意以下参数默认值即可。...毕竟绘制heatmap一个函数就可以了。 ? 欢迎大家学习交流

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R语言绘制箱图

箱线图的绘制方法是：先找出一组数据的最大值、最小值、中位数和两个四分位数；然后，连接两个四分位数画出箱子；再将最大值和最小值与箱子相连接，中位数在箱子中间。...数据使用R自带的数据代码导入数据,不想解释各行各列没什么意义，分为两类，一个单一箱图，一个并列的箱图 input1<- mtcars[,c('mpg')] input2 <- mtcars ?

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【R语言】绘制箭头（一）

今天小编就来跟大家聊一聊，R中绘专门绘制箭头的arrows函数。函数的用法和参数如下：我们结合几个具体的例子来深入的解析一下这个函数。...#绘制散点图 plot(1:5, 1:5, xlim = c(0,6), ylim = c (0,6)) #添加一个箭头，从二维空间中（1，1）到（4，4） arrows(x0 = 1, y0 = 1,...x1 = 4, y1 = 4) 效果如下我们也可以同时绘制两个箭头 #绘制散点图 plot(1:5, 1:5, xlim = c(0,6), ylim = c (0,6)) #同时绘制两个箭头

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R语言绘制森林图

在Meta分析中森林图比较常见，其主要是是以统计指标和统计分析方法为基础，用数值运算结果绘制出的图型。...接下来我们介绍其是如何在R语言中实现的。首先我们需要导入R包forestplot。具体的安装载入不再赘述。下面我们看下其主要的函数forestplot。 ?

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R语言绘制抖动散点图

今天我们给大家介绍一个绘制抖动散点图的R包ggbeeswarm，但是呢，如果真正多样化绘制还需要ggplot2的协助。...那么也就是我们需要两个包来完成我们抖动散点图的绘制：ggbeeswarm和ggplo2。具体安装我们不再赘述，ggplot2的使用可以参考我们前面的《R语言绘图之ggplot2》。...接下来我们看下是如何绘制，首先我们准备好前期工作包的载入以及数据的生成。...library(ggplot2) library(ggbeeswarm) set.seed(12345) n<-100 dat<-rnorm(n*2) 接下来我们绘制简单的抖动散点图： labs<-rep...当然抖动散点图不是所有的都会绘制出来很好看，这就需要我们自己去实践，下面是对不同个数样本的数据的绘制，到时候可以根据自己的数据选择是否适合，毕竟美观才是我们的目的。

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Python-geopandas 中国地图绘制

上一期的地图可视化推文教程R-ggplot2 标准中国地图制作中，我们详细介绍了使用R-ggplot2 包完美绘制中国标准地图，本期推文我们则试着使用Python-geopandas包绘制空间地图，主要的知识点如下...： geopandas 绘制中国地图 matplotlib add_axes()添加南海小地图绘图文件分享 geopandas 读取中国地图文件 geopandas提供了非常方便的read_file...()方法用于读取geojson文件，我们直接进行默认投影(WGS84)的绘制，代码如下： file = r"中国省级地图GS（2019）1719号.geojson" nine = r"九段线GS（2019...绘图数据操作接下来，我们将我们要绘制的数据读取、转换并绘制在地图上，数据预览如下： ?...总结本期推文使用了Python-geopandas进行了中国地图的绘制,讲解了数据标记，投影转换等内容。

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Python-geopandas 中国地图绘制

上一期的地图可视化推文教程R-ggplot2 标准中国地图制作中，我们详细介绍了使用R-ggplot2 包完美绘制中国标准地图，本期推文我们则试着使用Python-geopandas包绘制空间地图，主要的知识点如下...： geopandas 绘制中国地图 matplotlib add_axes()添加南海小地图绘图文件分享 geopandas 读取中国地图文件 geopandas提供了非常方便的read_file...()方法用于读取geojson文件，我们直接进行默认投影(WGS84)的绘制，代码如下： file = r"中国省级地图GS（2019）1719号.geojson" nine = r"九段线GS（2019...绘图数据操作接下来，我们将我们要绘制的数据读取、转换并绘制在地图上，数据预览如下： ?...总结本期推文使用了Python-geopandas进行了中国地图的绘制,讲解了数据标记，投影转换等内容。

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R语言绘图：复杂散点图绘制

, prefix = "", cex.cor, ...) { usr <- par("usr") on.exit(par(usr)) par(usr = c(0, 1, 0, 1)) r...<- abs(cor(x, y)) txt <- format(c(r, 0.123456789), digits = digits)[1] txt <- paste0(prefix, txt)...if(missing(cex.cor)) cex.cor <- 0.8/strwidth(txt) text(0.5, 0.5, txt, cex = cex.cor * r) } pairs...reg.line # 默认值是lm，用于制定绘制回归直线的函数 ellipse # 在非对角线绘制数据密度椭圆 groups # 对数据分组 by.groups # 如果设置为TRUE，那么回归直线按照分组来拟合...； # 其他情况下，使用color参数的值来绘制点的颜色。

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R语言绘制曲线图

由于ggplot2中的geom_line()函数只能绘制折线图，需要用到ggalt提供的geom_xspline()函数绘制光滑的曲线图 geom_line 将所有点连接起来，是折线图但不平滑 geom_smooth...",color="black"), axis.text = element_text(size=10,face="plain",color="black") ) image.png 通过R自带的...spline函数获得一系列插值点后用geom_line()绘制的曲线明显光滑了 spline_int <- as.data.frame(spline(mydata$x, mydata$y)) ggplot...axis.text = element_text(size=10,face="plain",color="black") ) image.png也可以直接用geom_xspline()函数绘制填充面积的曲线图

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R语言绘制网络图

大家应该熟悉网络调控在基因关系之间的重要性，今天我们为大家展示在R语言中如何实现网络图的绘制。绘制的包有很多，我们今天不一一介绍从我个人角度推荐igrapgh。...主要看下如何绘制一个完整的网络图： 1. 前期数据的整理。...数据的前期准备就此结束，接下看如何绘制网络图。 3. plot函数绘制网络图。 ?...main绘制的网络图的标题。其他的参数类似R语言自带的plot函数。...更加美化的网络图还需要根据每个人的审美去绘制。

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R语言 | 条形图绘制

本次内容介绍条形图的绘制，包括基本条形图、簇状条形图、频数条形图、堆积条形图、百分比条形图。下次将介绍如何对条形图着色、调整条形图的宽度和间距、添加数据标签等内容。...1绘制基本条形图演示数据以gcookbook包中的pg_mean数据集为例。...ggplot(pg_mean,aes(x = group,y = weight)) + geom_col(fill="lightyellow",colour="black") 2绘制簇状条形图演示数据...x轴上的分类变量和一个绘制在y轴上的连续型变量。...输出图片 3 绘制堆积条形图演示数据同上，以gcookbook包中的cabbage_exp数据集为例，该数据集包含两个分类变量Cultivar和Date和一个连续变量Weight。

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如何试用 R 语言绘制散点图

R语言绘制基因表达基因的“对称散点图转录组分析中，计算了两组间差异表达的基因后，通常怎样表示？您可能第一时间想到可以使用火山图。...接下来通过该示例文件，展示使用R语言绘制差异基因表达“对称散点图”过程。 2 数据预处理首先对数据做一些预处理。...我们使用ggplot2的方法绘制差异基因散点图。...4 绘制差异基因散点图，颜色表示p值上图中没有将p值信息展示出。因此另一种思路是，颜色代表p值，这样就可以在图中获得一个渐变梯度。...同样使用ggplot2的方法绘制，和上述过程相比仅在颜色指定上存在区别。

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R语言绘制绘制ROC和PR曲线（总结）

本节目标：（1）总结常用的绘制ROC和PR曲线的R包（2）生存预测模型的时间依赖性ROC曲线第一部分：总结常用的绘制ROC曲线的R包：（1）ROCR - 2005 ROCR包已经存在了近14年...，是绘制ROC曲线最常用的工具，这个也是我本人最喜欢用和最常用的R语言包。...下面的代码使用包附带的合成数据集并绘制默认的ROCR ROC曲线。在本文中，我将使用相同的数据集。...#################################### #ROCR包绘制ROC曲线 #################################### library(ROCR

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