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R语言实战.2

浏览器很卡顿,把我卡出去了,我没有拿到数据集 在R中,对象(object)是指可以赋值给变量的任何事物,包括常量、数据结构、函数,甚至图形。...它们在R中被特殊地存储和处理。 其他多数术语你应该比较熟悉了,它们基本都遵循统计和计算中术语的定义。 这些具体的举例可以看我上篇文章R语言实战.1最后的部分。...类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子(factor)。因子在R中非常重要,因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。 ? ? ? $是用来选取一个变量时用的符号 ?...这对于因子status是有意义的,因为“Excellent”“Improved”“Poor”的排序方式恰好逻辑顺序相一致。...请保证指定的水平数据中的真实值相匹配,因为任何在数据中出现而未在参数中列举的数据都将被设为缺失值。 数值型变量可以用levels和labels参数来编码成因子。

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挖掘GEO速成SCI文章系列教程(3)-R语言基础

前面的课程中,我们学习了GO/KEGG功能富集分析的操作步骤,并给大家演示了如果使用R语言绘制高级气泡图。...另外,最近几期有关挖掘GEO速成SCI文章的系列教程中,先是讲解了一些基本概念、数据库的构成,以及如何从GEO中快速锁定自己想要的目标数据。在获得数据之后,后续的分析过程同样也要借助R语言来实现。...通过视频讲解和实战演练,专门解答一下大家对R包和RStudio的操作疑问,同时为后续的GEO数据挖掘打下坚实基础。...视频操作 1 关于RR包是R语言中及其重要的组成部分,后面我们从三个问题出发,带领大家深入解读R包。 1、什么是R包? 2、R包存储在什么地方? 3、如何安装R包?...腾讯视频地址: https://v.qq.com/x/page/m08451mnmcq.html 2 关于RStudio RStudio是一款常用的R语言脚本编辑器,在我看来,它可以称得上最好的R语言开发环境

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R语言实战.3

由于两个原因,列表成为了R中的重要数据结构。首先,列表允许以一种简单的方式组织和重新调用不相干的信息。其次,许多R函数的运行结果都是以列表的形式返回的。需要取出其中哪些成分由分析人员决定。...R中一些头麻的地方 对象名称中的句点(.)没有特殊意义,但美元符号($)却有着和其他语言中的句点类似的含义,即指定一个数据框或列表中的某些部分。例如,A$x是指数据框A中的变量x。...❏ R中没有标量。标量以单元素向量的形式出现。 ❏ R中的下标不从0开始,而从1开始。在上述向量中,x[1]的值为8。 ❏ 变量无法被声明。它们在首次被赋值时生成。...这些是面向开发者的R语言,很多反常规的设计 也许输入数据最简单的方式就是使用键盘了。有两种常见的方式:用R内置的文本编辑器和直接在代码中嵌入数据。我们首先考虑文本编辑器。...具体步骤如下: (1) 创建一个空数据框(或矩阵),其中变量名和变量的模式需理想中的最终数据集一致; (2) 针对这个数据对象调用文本编辑器,输入你的数据,并将结果保存回此数据对象中。

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SVM的R语言实战

R中,可以使用e1071软件包所提供的各种函数来完成基于支持向量机的数据分析挖掘任务。请在使用相关函数之前,安装并正确引用e1071包。...下面的实战事例依然选用经典的鸢尾花数据(分别标记为setosa、versicolor和virginica)的花萼和花瓣数据。包括花萼的长度和宽度,以及花瓣的长度和宽度。...在正式建模之前,我们也可以通过一个图型来初步判定一下数据的分布情况,为此在R中使用如下代码来绘制(仅选择Petal.Length和Petal.Width这两个特征时)数据的划分情况。...coef0参数是指核函数中多项式内积函数sigmoid内积函数中的参数,默认值为0。 另外,参数cost就是软间隔模型中的离群点权重。...参考文献:R语言实战 机器学习实战 免责声明:本文系网络转载。版权归原作者所有。如涉及版权,请联系删除!

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SVM的R语言实战

R中,可以使用e1071软件包所提供的各种函数来完成基于支持向量机的数据分析挖掘任务。请在使用相关函数之前,安装并正确引用e1071包。...下面的实战事例依然选用经典的鸢尾花数据(分别标记为setosa、versicolor和virginica)的花萼和花瓣数据。包括花萼的长度和宽度,以及花瓣的长度和宽度。...其中,高斯核函数多项式核函数被认为是性能最好、也最常用的核函数。 核函数有两种主要类型:局部性核函数和全局性核函数,高斯核函数是一个典型的局部性核函数,而多项式核函数则是一个典型的全局性核函数。...coef0参数是指核函数中多项式内积函数sigmoid内积函数中的参数,默认值为0。 另外,参数cost就是软间隔模型中的离群点权重。...降维方法(一):PCA原理 22.SVM的R语言实战 参考文献:R语言实战 机器学习实战 免责声明:本文系网络转载。版权归原作者所有。如涉及版权,请联系删除!

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R语言系列五:①R语言多元回归

不过模型设定和结果输出等内容前面系列讲过的关于回归分析和方差分析的内容差别不大,链接:R语言系列第四期:②R语言多组样本方差分析KW检验、R语言系列第四期:④R语言简单相关回归。...) 之前谈到简单回归一样,lm函数返回的结果有限。...另外,我们在平常使用线性模型中也经遇到一些问题,比如共线性,交互效应等问题,我们会在这个系列的番外——R语言系列5番外为大家介绍。 好了,这部分的内容就先介绍到这里,我们下期再见。 参考资料: 1....《R语言统计入门(第二版)》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2....《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.Vicky的小笔记本《blooming for you》by Vicky

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R语言系列五:②R语言逻辑回归建立

在上一篇文章里,我们给大家介绍了之前系列里提及的线性回归的扩展部分,详情点击:R语言系列五:①R语言多元回归 但医学工作者最常接触的结局预测变量多为二分类变量,比如阳性、阴性,病例、对照乃至生存、死亡这样的变量...关于逻辑回归模型,需要注意的是,他线性模型不同,没有误差项。我们是对一个事件发生的概率直接建模,而二元输出的变异性将由此概率来确定。因此,正态分布不同,这里没有方差这个参数。...我们这里按照数据的原始类型分类来讲解不同的原始数据应该怎样通过R语言建立逻辑回归模型。 ? A. 表格化数据的逻辑回归 ?...《R语言统计入门(第二版)》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2....《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.Vicky的小笔记本《blooming for you》by Vicky

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美团 R 语言数据运营实战

上述这些场合 R 语言有着独特的优势。本文将基于美团到店餐饮技术部的精细化数据运营实践,介绍 R 在数据分析可视化方面的工程能力,希望能够抛砖引玉,也欢迎业界同行给我们提供更多的建议。...数据分析挖掘:R 本身是一门由统计学家发起的面向统计分析的语言,通过自行编程实现或者第三方软件包调用,可以轻松实现线性回归、方差分析、主成分分析等分析挖掘功能。...服务化能力:例如通过 rserve 包,可以实现 R 和其他语言通信的 C/S 架构服务。 对于以数据为中心的应用来说,Python 和 R 都是不错的选择,两门语言在发展过程中也互有借鉴。...等系统语言相比,计算性能是 R 的软肋。...另外我们也在逐步沉淀 R 可视化分析组件、开发基于 R 引擎的配置化 BI 产品开发框架,以期进一步降低 R 的使用门槛、提升 R 的普及范围。

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R语言文件批量操作实战

我们在多样本创建Seurat对象的时候,在读取数据之前,需要对多个样本的文件进行移动和改名操作,样本量少的时候可以手动操作,样本量比较多的情况下,手动操作会非常麻烦,为了提高效率,我们可以使用R语言来对文件和文件夹进行操作...需要用代码完成的的操作是: 根据文件名称中样本的GSM编号创建文件夹 将每个样本的数据复制到对应的文件夹下面并修改名称 图片 三、示例代码 示例代码: # 清空R环境中的变量列表 rm(list =...ls()) # 导入必要的包,stringr用于处理字符串 library(stringr) # 查看当前工作目录(显示当前R脚本的工作路径) getwd() # 设置工作目录,将工作路径切换到指定路径下

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R语言数据挖掘实战系列(3)

R语言数据挖掘实战系列(3) 三、数据探索         通过检验数据集的数据质量、绘制图表、计算某些特征量等手段,对样本数据集的结构和规律进行分析的过程就是数据探索。...缺失值分析:使用简单的统计分析,可以得到含有缺失值的属性的个数、以及每个属性的未缺失数、缺失数缺失率等。缺失值处理,从总体上来说分为删除存在缺失值的记录、对可能值进行插补和不处理三种情况。...判定系数是相关系数的平方,用r2表示;用来衡量回归方程对y的解释程度。判定系数取值范围:0≤r2≤1。...r2越接近于1,表明xy之间的相关性越强;r2越接近于0,表明两个变量之间几乎没有线性相关关系。...R语言主要数据探索函数 统计特征函数         统计特征函数用于计算数据的均值、方差、标准差、分位数、相关系数、协方差等,这些统计特征能反映出数据的整体分布。

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R 语言入门介绍

常用算术运算符 运算符 描述 + 加法 − 减法 * 乘法 / 除法 ^或** 求幂 %% 求余 %/% 整数除法 注意,R 区分大小写。...acos(x)、atan(x) exp(x) log(x)、log2(x)、log10(x) round(x, 保留位数) ceiling(x) floor(x) trunc(x):截取 x 的整数部分 R...R 对象 在 R 语言中,“一切皆对象”。数据分析包括很多步骤,从数据整理、探索、建模到可视化,每个步骤都需要处理不同的对象,例如向量、矩阵、函数、模型等。...工作空间管理 工作空间(workspace)就是 R 的工作环境,所有创建的对象都被临时保存在工作空间(也可称为全局环境,.GlobalEnv)中。...ls() 工作目录(working directory)是 R 用来读取文件和保存结果的一个文件夹。

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机器学习R语言实战笔记(第三章)

R和统计,R语言和统计是一对兄弟,相互难以离开呀! 这里记录下这本书里我之前不了解的内容,欢迎一起交流!向量的模式作者写了个函数来干这件事,我学习下,登上巨人的肩膀。...mode <- function(x) { temp <- table(x) names(temp)[temp == max(temp)] } 3.5 在R中进行多元相关分析 为避免单个变量的负面影响...R还为用户提供了其他假设检验的方法: 1.百分比检验prop.test: 用于测试不同样本集的百分比分布是否一致。...2.Z检验(UsingT包中的simple.z.test):比较样本均值整体数据集均值以及标准偏差。...$mpg~mtcars$gear, subset = (mtcars$am==1), xlab = 'gear', ylab = 'mpg', main='manual') # 前驱齿轮*变速方式mpg

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