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R进阶之路

R应用有这么一个过程:数据导入。对于大多数人来说,利用R分析或者数据处理,都得先导入数据。那么,好了,我们需要掌握的数据导入方式:a. read.csv()。 这个函数来源于R包“xlsx。这个函数可以用来读入EXCL的表格,并进行运算。其中的主要参数sheetIndex=i就是选择哪张子表。具体不再演示。数据的运算a. 运算框架:for循环,if判断b. 综上所述即为R应用的主要流程。虽然里面没有对函数进行细化其内部的函数参数,但是R本身整合了查看函数的方式。那就是在要运行的函数前加“??”。 如图:? 掌握以上所有的函数,恭喜你不再是,并且可以成为团队的一份子,快点行动起来吧。

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R绘制热图

之前的文章已经给大家讲过怎么安装R了,这里就不多赘述了。 pheatmap) #加载pheatmap包library(RColorBrewer) #加载RColorBrewer包这里稍微给大家介绍一下RColorBrewer包:RColorBrewer is an R 第二步读取数据: 首先我们来看一下数据的格式,第一行为样品名称,第一列为因名称。? fitness

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    R_

    setwd(“c:myproject”) ls() #列出当前工作空间中的对象rm(list=ls())dir() #列出当前目录dir.create(“c:myproject”)options() #查看R软件默认选项的设置 delimiter,row.names=name,stringsAsFactors=FALSE)#一个例子sink(myout.txt,split=TRUE)pdf(myout.pdf)source(s1.R) lengthdimstrclassmodenamesc(obj1,obj2)cbind(obj1,obj2)rbind(obj1,obj2)headtaills()rm(obj1,obj2) #批处理R 利用抽样技术随机获取子集index = sample(2,nrow(Insurance),replace=TRUE,prob=c(0.8,0.2))InsuranceInsurance #利用抽样技术对数据进行分区管理 #R本画图 plot()函数#par()对R图形进行修饰dose

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    R概要

    于学习总结和网上收集!汇总供以后查看学习!运算符数学运算:+,-,*,,^,%%。(加,减,乘,除,乘方,求余。) sort(x)根据因子f对向量x分类执行函数g tapply(x,f,g)向量x按因子f分类split(x,f)返回向量x的差分向量 diff(x)返回向量x的累加向量 cumsum(x)与矩阵有关的本操作生成 若Y是数值型的向量,R会自动判断其为行向量还是列向量。 b)对矩阵M的行(dimcode=1)或列(dimcode=2)依次进行函数f操作,f的变量(arguments)方正fargs里> apply(M, dimcode, f, fargs)与列表有关的本操作建立列表 功能与lapply类似,区别在于函数结果的类型不是列表(list)> sapply(...)与数据框有关的本操作数据框是一种特殊的列表,所以对列表适用的函数往往对数据框也适用。

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    R操作①指令

    指令 程序辅助性操作: 运行q()——退出R程序 tab——自动补全 ctrl+L——清空console ESC——中断当前计算 调试查错browser() 和 debug()——设置断点进行,运行到此可以进行浏览查看 solve——检索所有与solve相关的信息 help(“[[“) 对于特殊含义字符,加上双引号或者单引号变成字符串,也适用于有法涵义的关键字 if,for 和 function help(package R帮助页面中的关键词或短(互联网)RSiteSearch(‘neural networks’) 准备 文件目录设置setwd()——设置工作文件目录 getwd()——获取当前工作文件目录 list.files ()——查看当前文件目录中的文件 加载资源search()——通过search()函数,可以查看到R启动时默认加载7个核心包。 函数:数学计算函数,统计计算函数,日期函数,包加载函数,数据处理函数,函数操作函数,图形设备函数setRepositpries()——选择软件库(CRAN,Bioconductor,R-Forge)

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    2-5 R factor

    #因子:分类数据 #有序和无序 #整数向量+标签label #Male/Female #常用于lm(),glm()

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    R系列】概率R

    R是统计,概率又是统计的,所以可以想到,R必然要从底层API上提供完整、方便、易用的概率计算的函数。让R帮我们学好概率的课。1. 随机变量· 什么是随机变量? 相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度。 R:假设投硬币,正面概率是0.5,投4次时,计算得到2次正面的概率?根据大数定律,如果投是10000次,计算5000次正面的概率? R:中心极限定理模拟,从指数分布到正态分布if (! 掌握R,就可以快速的把概率的知识,用R进行现实,非常有利于帮助我们解决生活中遇到的问题。

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    【学习】R画图

    1.plot函数  plot(x,y,xlim=c(0,100),ylim=c(0.4,1), type="o",lwd=2,col=2,pch=24,...

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    2-2 R 向量

    > x <- vector("character",length=10) > x1 <- 1:4 > x2 <- c(1,2,3,4) > x3 <- c(TR...

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    2-4 R 列表

    > l1 <- list("a",2,10L,3+4i,TRUE) #每个元素没有名字 > l1 [[1]] [1] "a"

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    R命令与安装

    R的安装过程1.1.首先附上清华线路的下载链接Windows版3.3.11.2. 选择安装路径?1.3. 注意根据自己的计算机位数选择,如我的是64位,便选择64位安装。?1.4. 命令学习2.1 本的矢量计算加减乘除不在话下,遵循数学法则。 2.3 R脚本与函数file-新建程序脚本或者快捷键Ctr+n注释方法:“#”常见函数: length(x)返回向量x中元素个数sum(x)返回向量x中各元素之和prod(x)返回向量x中各元素之积cumsum

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    R图形交互

    从今天开始我们开启R的交互图形设计征程,今天主要是初识shiny这个交互的R包。首先我们看下其官网(http:shiny.rstudio.com):? 在R中shiny的安装就不多讲了其已在CRAN上发布。我们今天主要介绍一下其最主要的两个函数:1. fluidPage 创建页面,并添加对应的属性。 与此同时在R窗口会出现当前的监视端口:?当我们要再运行新的程序时需要再从新开启进程或者关闭当前的端口。接下来,我们看下server是如何和ui联合发挥作用的。示例代码如下:ui

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    2-6 R 缺失值

    > is.na(x) [1] FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE

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    2-7 R 数据框

    > df <- data.frame(id=c(1,2,3,4),name=c("a","b","c","d"),gender=c(TRUE,TRUE,FALS...

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    R绘图001-参数

    )调整图中字符的相对位置;取值:长度为2的数值向量,分别表示字符边界矩形框的左下角相对坐标点(x, y)位置的调整,向量的两个数值一般都在范围中(有些图形设备中也可以超出此范围),表示字符串以左下角为准 取负值时对齐位置在文本左边的地方;如果给出两个值(例如c(0, 0)),第二个只控制关于文字线的垂直调整axes 是否画坐标轴;注意只会影响到是否画出坐标轴线和刻度,不会影响坐标轴标题asp 图形纵横比 需要注意一些绘图函数如plot.default等也有一个相同名字的参数,但是此时表示在函数par()的参数cex的上再放大多少倍,此外还有函数points等接受一个数值向量为参数。 lab 设置坐标轴刻度数目(R会尽量自动“取整”2);取值形式c(x, y,len):x和y分别设置两轴的刻度数目,len目前在R中尚未生效,因此设置任意值都不会有影响(但用到lab参数时必须写上这个参数 以后也会对“如何设定颜色”这一问题进行整理,并且接下来关于R的博文也会重点关注于可视化方面,包括如何绘制散点图、条形图、热点图、地图等。ylab y轴标题

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    R与入门实践

    熟练使用R软件实践1:最初几步x=1:100#把1,2,...,100个整数向量赋值到x(x=1:100) #同上, 只不过显示出来sample(x,20) #从1,...,100中随机不放回地抽取20 *”来看本算术运算方法, pi是圆周率*(pi, ^(10,2)) #和上面一样, 有些繁琐, 是吧! pi * 10^2xprint(x) #和上面一样(x=pi *10^2) #赋值带打印pi^(1:5) #指数也可以是向量print(x, digits = 12)#输出x的12位数字实践3:关于R对象的类型等这里写代码片 x=pi*10^2class(x) #x的classtypeof(x) #x的typeclass(cars)#cars是一个R中自带的数据typeof(cars) #cars的typenames(cars

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    R教程——第1章:初识R

    最初S的实现版本主要是S-PLUS。S-PLUS是一个商业软件,它于S,并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善。 R可以看作贝尔实验室(AT&T BellLaboratories)的RickBecker,JohnChambers和AllanWilks开发的S的一种实现。当然,S也是S-Plus的。 在另外版安装文件中,已经包含的程序包有:base一R模块、mle一极大似然估计模块、ts一时间序列分析模块、mva一多元统计分析模块、survival一生存分析模块等等. 可以和全球一流的统计计算方面的专家讨论各种问题,可以说是全世界最大、最前沿的统计学家思维的聚集地.R于S的一个GNU项目,所以也可以当作S的一种实现,通常用S编写的代码都可以不作修改的在 在R的安装程序中只包含了8个模块,其他外在模块可以通过CRAN获得。

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    知识 | R绘图之柱形图

    R绘图之简单柱形图 在视觉性吸引方面,人类绝对是动物界的另类。当一张一张数据分析的统计表摆在眼前时,人们并不能快速的洞察其中的关系。 然而,当一张张精心绘制图形展现散数据时,往往会让人兴致盎然,阔然开朗,并能够快速的从视觉角度呈现洞察关系,作出非常有意义的比较。 01创建数据框 #mydata数据框的创建,创建方式见往期文章知识 | R数据管理之变量创建。 #此处直接从mydata中提取子集,提取方式详见往期文章知识 | R数据管理之数据集取子集。newdata

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    R教程——第四章:if

    在任何一种编程中都有if句,在生物信息学分析中,经常会筛选满足一定条件的数据,if句就很有用。 在R中创建if..else句的法是 :if(boolean_expression) { statement(s) will execute if the boolean expression 如果布尔表达式求值为真(true),那么将执行if句中的代码块,否则将执行else句中的代码块。x

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    玩转C单链表

    链表的本操作对链表的主要操作有以下几种:1. 建立链表;2. 结构的查找与输出;3. 插入一个结点;4. 删除一个结点;建立一个三个结点的链表,存放学生数据。

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