前面宏基因组与R语言的笔记还未结束，又开始新坑啦，都是要继续的啦！ 1、跑分 直接是代码了。...# Debian系 sudo apt-cache r-cran-* sudo apt install r-cran-rgdal # Windows installr::install.rtools()...# 更新R update.packages(ask=FALSE) # 可以将以下放在Rprofile文件的.Last函数，方便使用： utils::update.packages(ask=FALSE)...3、R的启动参数 这些启动参数可以添加到R启动命令中, 可以加快R的加载。...R --vanilla 扫描二维码 获取更多精彩 公众号
软件配置 benchmarkme包 高效硬件的5个技巧 1、使用benchmarkme包评估下CPU，看是否值得硬件升级 2、如有可能，增加更多RAM（虽然现在芯片慌，说这个有点不合时宜） 粗略经验，RAM...应该是所分析数据集的3倍benchmarkme::get_ram() #查看你有多少RAM，当然我的电脑--属性也行Ps.我的windows系统中没有结果NA B 3、确认你用的是64位的R 32位系统至多能用...4、云计算也是一个成本低的获得强大算力的一个选择 5、固态硬盘通常对代码执行影响不大，但是可以提升整体工作效率 R语言跑个分玩玩 library(benchmarkme) res=benchmark_std...1,600 x 1,600 random matrix: 2.75 (sec). plot(res) # You are ranked 310 out of 749 machines. # AMD R7
高效的基础R 改善性能的标准方式和替代方法 if与ifelse函数 marks <- runif(n=10e6, min=30, max=99) system.time({ result1 <- ifelse...is.na与anyNA 想了解一具向量是否包含任何缺失值，anyNA()更高效。 矩阵 数据框中提取行比矩阵中慢约150倍。...Rcpp C++是一个现代、快速并具有较强支持度的语言，包含各种库。Rcpp提供了一个友好的API，编写高性能代码，C++中瓶颈的典型是地址循环与递归函数。...cppFunction()可以转换成R代码。...add_r <- function(x, y) x * y # R语言版 # C++版 library(Rcpp) cppFunction( double add_cpp(double x, double
R语言运行几个长列比运行一些短列快，所以一般认为宽数据（不整洁），长数据（整洁）。...使用变量名非标准化求值更高效，见R语言 dplyr传递参数_自由 平等~忠诚 奉献-CSDN博客[2]。只是函数名多了个下划线那么简单吗？...使用dplyr高效处理数据 这个包名的意思是数据框钳，相比基础R的优点是运行更快、与整洁数据和数据库配合好。函数名的部分灵感来自SQL。 ?...与基本R中类似函数不同，变量无需使用 $ 操作符就可直接使用，设计与magrittr包的%>%管道操作符一起使用，以允许每个数据阶段写成新的一行。其是一个大型包，本身可以看成一门语言。...参考资料 [1] bit.ly: http://bit.ly/broomvignette [2] R语言 dplyr传递参数_自由 平等~忠诚 奉献-CSDN博客: https://blog.csdn.net
出版社送了一本书（R语言）给我，就是这个《R语言实战》第三版，它已经是R语言领域的“老兵”了，几乎是人手一本。 新鲜出炉的第三版，更新也很大，全面拥抱了ggplot体系。...高效编程 在R里面为什么尽量使用向量化编程 在R语言中，向量化编程是一种高效的编程方式，它可以提高代码的执行速度和可读性。这是因为R是一种基于向量的语言，其内部函数和操作都是为向量运算设计的。...以下是一些使用向量化编程的优点： 效率：向量化操作通常比循环更快，因为R的内部函数是用C和Fortran编写的，这些语言在处理向量运算时比R更快。...这是因为R的内部函数（在这个例子中是乘法操作符）是用C和Fortran编写的，这些语言在处理向量运算时比R更快。当然了，这只是一个简单的例子，但是向量化编程的优势在处理更复杂的问题时会更加明显。...R语言里面为什么要避免反复调整对象大小 在R语言中，每次你增加或减少一个对象的大小时，R实际上是创建一个新的对象，然后复制旧对象的内容到新对象中。
这是《高效R语言编程》的学习笔记，前面的笔记在这里： 高效R编程 《高效R语言编程》笔记 这是《高效R语言编程》的学习笔记，前面的笔记在这里： 我们将实践、习惯、提升生产力的系统环境定义为工作流。...高效工作流的5条高级技巧 类型 1、编码前头脑清晰，保证目标，可以用纸笔 2、制定计划 3、尽早选择要用的包 4、记录每个阶段的工作 5、尽可能使流程可复制，knitr可以帮助实现 项目规划类型 数据分析...使用R包可以避免重复造轮子，提高效率。...查找R包 首先是百度谷歌一下，其次，是R文档网站rdocumentation.org，也可以R命令搜索：RSiteSearch('ggplot') #会自动用浏览器打开网页 ?...R包的基本元素区别于其他R项目，下面是三条高效建议： 1、DESCRIPTION 包含了包的依赖信息，需要安装的其他包，例如Imports: 2、R/ 文件夹，包的所有R代码，模块化 3、data/ 文件夹包含示例代码
软件配置 几个包： install.packages(c("rio","readr","data.table","feather","WDI")) 关于数据I/O的高级技巧 R语言自己的文件格式是.Rds...，可以使用readRDS()与saveRDS()函数导入与导出，是一种速度与空间存储都什么高效的格式。...对于高效导入大文本文件，使用readr或data.table与read.table()相当。 使用file.size()与object.size()跟踪文件与R对象的大小，以便在过大之前提前预防。...使用rio的通用数据导入 多功能包，名副其实，提供简单易用和计算高效的函数，其目标是简化数据导入导出过程。R的数据导入导出手册中有些函数已经过时了，比如WriteXLS包，且很难学习。...feather文件格式 这是为了R语言与Python程序员协作而设计的格式，速度快，轻量、保存数据框是与语言无关。
这是《高效R语言编程》的学习笔记，前面的笔记在这里：https://blog.csdn.net/zd200572/article/details/115349366 https://www.jianshu.com.../p/71392ef45d01 很多R语言用户并不认为自己是程序员，我也是:)，精通专业知识，理解R语言的标准数据结构，但是缺乏正规编程训练，你是这样的吗？...这是《高效R语言编程》的学习笔记，前面的笔记在这里：https://blog.csdn.net/zd200572/article/details/115349366https://www.jianshu.com.../p/71392ef45d01很多R语言用户并不认为自己是程序员，我也是:)，精通专业知识，理解R语言的标准数据结构，但是缺乏正规编程训练，你是这样的吗？...高效编程的5个技巧 1、小心，尽量不要增大向量的大小 2、尽可能向量化代码 3、适当时机下使用因子 4、通过缓存变量避免不必要的计算 5、字节编译包可使性能轻而易举大幅提升 一般性建议 底层语言如C，需要你自己进行内存管理
高效协作的5条高级技巧： 保持统一的编码风格 仔细思考你的注释并随时更新 尽可能使用版本控制 信息化提交消息 不要害怕来自同事的反馈 编码风格 编码风格要前后一致，没有唯一，几个多数程序员都赞成的风格：...模块化代码 注释你的代码 不要重复自己的代码 代码简洁、清晰、一致 比如在R语言里用<- 代替=，符合自动化原则，改善代码最简单的是，使用Rstudio自动完成代码改善。...2、能否再改善 3、代码是否符合已有编程风格 4、有自动测试吗？是否充分？...第十章 高效学习 软件配置 swirl包 install.packages("swirl") library(swirl) # | Hi!...Warning message: 程辑包‘swirl’是用R版本4.0.5 来建造的 高效学习的5个高级技巧 1、使用R内部帮助 针对主题探索R help.search("optim")# 或者??
今天给大家推荐一本R语言的书籍。R 语言在近10 年来已经发生了日新月异的变化，不仅在内容上更加丰富多彩，而且在计算效率上也有了大幅的提升。...尽管R语言能够实现丰富多样的实际功能和框架，但是其本质是面向数据的，因此数据处理是R语言核心中的核心。如果能够掌握高效的数据操作技术，就能够在各类数据分析任务中如鱼得水。...而《R语言数据高效处理指南》这本书定位即为“R语言数据处理101”，希望R语言的使用者能够在较早的阶段就习得基本而有效的数据处理基本技术。 R语言的书籍那么多为什么推荐这一本呢？...《R语言数据高效处理指南》读者群体包括在校的大学生、数据分析从业人员和致力于更加高效地处理数据的所有的R语言使用者。...尽管对数据科学、计算机编程、统计学有一定基础会帮助理解本书的内容，但这不是必需的，来自包括初学者在内的各个层次的读者群体都能从本书中有所收获。
R 是一种开源编程语言，被广泛用作统计软件和数据分析工具。R 通常带有命令行界面。R 可在 Windows、Linux 和 macOS 等广泛使用的平台上使用。此外，R 编程语言是最新的尖端工具。...为什么选择 R 编程语言？ R 编程被用作机器学习、统计和数据分析的主要工具。R 可以轻松地创建对象、函数和包。 它是一种独立于平台的语言。这意味着它可以应用于所有操作系统。...R 编程语言拥有庞大的用户社区，并且每天都在增长。 R 目前是数据科学就业市场上最受欢迎的编程语言之一，这使其成为当今最热门的趋势。...分布式计算：分布式计算是一种模型，其中软件系统的组件在多台计算机之间共享以提高效率和性能。用于 R 中分布式编程的两个新包ddR 和 multidplyr于 2015 年 11 月发布。...R 编程语言比 Python 和 MATLAB 等其他编程语言慢得多。 R 的应用 我们将 R 用于数据科学。它为我们提供了大量与统计相关的库。它还为统计计算和设计提供了环境。
出版社送了一本书（R语言）给我，就是这个《R语言实战》第三版，它已经是R语言领域的“老兵”了，几乎是人手一本。 新鲜出炉的第三版，更新也很大，全面拥抱了ggplot体系。...高效开发R包 什么情况下我们需要开发R包呢 开发R包（也称为R库）是一种有效的方法，可以用来组织、共享和重用你的R代码。...总的来说，任何时候你觉得将你的代码、数据或文档组织成一个易于安装、使用和共享的单元时，都可以考虑创建R包。 R包的基础结构呢 创建一个R包并不像看起来那么复杂。...R目录：这个目录包含了包的R代码。每个函数通常都会有自己的R文件。 man目录：这个目录包含了包的帮助文件，这些文件是用Rd格式写的，每个函数或数据集都应该有一个对应的帮助文件。...创建一个R包的过程可以通过R的devtools包来简化。devtools包提供了一系列函数，可以帮助你创建和测试R包。
（RinaNutshell） R语言数据科学（R for data science） 高级R语言编程指南（ Advanced R） 这些书每看完一本，都会对R的特性有进一步的理解。...《R语言编程艺术》这本书是买的比较早的了，之前也泛泛地翻过，主要是对R的特点有个相对系统的理解。...《R语言数据科学》这本书像是哈德利·威克汉姆用自己定义的R语言在讲述这些知识点（哈德利·威克汉姆重新定义了很多），R语言核心技术手册又显得太厚了，让人像面对 R语言实战 一样，望而却步。...我觉得第七章是这本书的核心，这也许和目前我的水平有关：开始关注函数的实现与组织。这一章探讨了编程中的控制结构以及函数的实现，环境作用域等，函数编程的基本概念。...在这一章中，我们可以体会到用R语言和会编程其实是两件事。 像编程这样的书籍，读一遍是远不够的，因为我们系要理解的不是人类语言的部分，而是非人的代码部分，不仅要理解更是要能运用。
学习编程语言是一种技巧：做好了，你会感受到掌握新事物之后的快感（dopamine：多巴胺）；做不好，就会接二连三的沮丧，甚至放弃。...下面这些学习编程语言的最佳技巧是我从多年的著书写作，演讲和培训中总结出来的。这里头很多技巧来源于对高效学习前沿研究做了解释的书籍。...确认你正在处理语言的哪个方面 个人观点，我觉得记住这些是有用的——当学习一门编程语言的时候，你实际上正在学四件事情。...这个道理适用于语言本身以及语言库。 工具的外部模型就是它呈现出来的接口以及它想让你思考问题解决的方式。...如果你想保持专注和高效的学习，就要足够的睡眠和练习，而不是（原文：beats the pants off）狂饮咖啡因和能量饮料。 更多小贴士 如果你还有其它有用的技巧，请不吝评论！
学习编程语言是一种技巧：做好了，你会感受到掌握新事物之后的快感（dopamine：多巴胺）；做不好，就会接二连三的沮丧，甚至放弃。...下面这些学习编程语言的最佳技巧是我从多年的 著书 写作 ， 演讲 和 培训 中总结出来的。这里头很多技巧来源于对高效学习前沿研究做了解释的书籍。...确认你正在处理语言的哪个方面 个人观点，我觉得记住这些是有用的——当学习一门编程语言的时候，你实际上正在学四件事情。...这个道理适用于语言本身以及语言库。 工具的外部模型就是它呈现出来的接口以及它想让你思考问题解决的方式。...如果你想保持专注和高效的学习，就要足够的睡眠和练习，而不是（原文：beats the pants off）狂饮咖啡因和能量饮料。
出版社送了一本书（R语言）给我，就是这个《R语言实战》第三版，它已经是R语言领域的“老兵”了，几乎是人手一本。 新鲜出炉的第三版，更新也很大，全面拥抱了ggplot体系。...R语言里面的某个对象不存在可能的原因有哪些呢 在R语言中，如果你试图访问一个不存在的对象，你会收到一个错误消息，比如 "object 'x' not found"。...R语言是区分大小写的，所以mydata和MyData是两个不同的对象。 对象未创建：你可能还没有创建你试图访问的对象。例如，如果你试图访问一个你还没有赋值的变量，你会收到一个错误消息。...避免使用R的保留字：R有一些保留字，如if，else，function等，这些都不能用作变量名。...更多的其实是R对象格式不匹配的报错 在R语言中，如果你尝试对不兼容的对象类型执行某些操作，你可能会遇到格式不匹配的错误。
来源：公众号(c语言与cpp编程) 在本篇文章中，我收集了很多经验和方法。应用这些经验和方法，可以帮助我们从执行速度和内存使用等方面来优化C语言代码。...应用这些经验和方法，可以帮助我们从执行速度和内存使用等方面来优化C语言代码。 尽管在C代码优化方面有很多的指南，但是关于编译和你使用的编程机器方面的优化知识却很少。...所以，我对有用的和高效的方法进行了总结收集。同时，我还修改了其中的一些方法，使他们适用于所有的编程环境，而不是局限于ARM环境。 哪里需要使用这些方法？ 没有这一点，所有的讨论都无从谈起。...{ return (p.x >= r->xmin && p.x xmax &&p.y >= r->ymin && p.y ymax);} 这里有一种更快的方法：x>min...xmax && (unsigned) (p.y - r->ymin) ymax);} 布尔表达式和零值比较 处理器的标志位在比较指令操作后被设置。
R主要面向统计计算，为数据科学家青睐，代码量一般不会很大，使用面向过程的编程方式就可以很好的完成编程任务。...而且还是有RStudio这样的交互操作集成开发环境，所以大部分的R语言用户对R语言是不是面向对象很是疑惑，虽然我们都知道在R中一切皆对象，比如Seurat对象。...在R语言的中文世界里，R语言面向对象编程的知识很少被提及，大部分的R语言书籍是偏应用的。有的话也散见于《R语言核心技术手册》《高级R语言编程指南》《R语言编程艺术》等，很少有专门来讲这一节的。...这与R语言的用户大多不是程序员不无关系，也与R语言的面向对象结构发展曲折有一定关系。在R中有四种面向对象结构。...但是正当我们苦于没有系统的R语言面向对象资料的时候，我们发现了这本在线书：R语言面向对象编程。里面有对这四种类型的详细介绍，而且还有可执行的实例代码，这无疑会加快一般用户对R语言面向对象的理解。
最近在看任坤大神的新作——《R语言编程指南》，其中对于编程语言中非常流行的面向对象编程范式（OOP）在R语言中的实现进行了非常详尽的讲解，强烈推荐各位有志于进阶R语言编程的小伙伴儿进行阅读。...R语言内目前可以实现OOP范式的一共有四套标准：S3、S4、RC、R6，其中关于S3、S4两种范式在早期的各种扩展包中使用比较多，是基于泛型函数而实现的，之前在学习Python的面向对象编程系列时曾经做过粗浅的练习...： 左手用R右手Python系列——面向对象编程基础 S3与S4之间的差异： 1.在定义S3类的时候，没有显式的定义过程，而定义S4类的时候需要调用函数setClass； 2.在初始化S3对象的时候，只是建立了一个...，在封装上非常不方便，而RC以及在RC基础上进一步发展的R6标准已经逐步开始接近主流编程语言中面向对象的实现模式。...RC 是一种具有引用语义的类系统，它更像其他面向对象编程语言中的类系统。 它将所有的类属性及对应方法都封装在一个实例生成器中，通过生成器可以生成需要的实例，进而执行对应的类方法。
list是R语言中包容性最强的数据对象，几乎可以容乃所有的其他数据类型。 但是包容性最强也也意味着他对于内部子对象的类型限制最少，甚至内部可以存在递归结构，这样给我们提取数据带来了很大的困难。...如果你对R语言的list结构非常熟悉，又熟练控制流等函数的操作，自然可以通过构建循环来完成目标数据的提取。但是在数据量大、结构及其复杂的情形下，自建循环无论是性能还是代码量上都很不经济。...在R语言环境中，我们最常遇到的list操作场景大概有以下三类（当然不含全部）： 1、统计模型的输出结果： 因为统计模型在跑完之后，通过会输出一系列各种指标，比如及置信区间、判定指标和拟合值等，这些对象因为大小和长度不等...不过这些数据结构因为用途比较特殊，都有对应包来进行结构化处理（我们无须担心），rgdal可以很好的识别sp对象，sf包可以高效处理sf对象。...如果你打算入手noSQL，那么R语言中的list就是很好地对标工具（Python中也许是dict吧）。 至于更为详细的rlist操纵技巧，请参考起官方文档或者任坤老师的主页！！！
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