下载地址为:https://cran.r-project.org 进入链接,如下图所示,在页面顶部提供了三个下载链接,分别对应三种操作系统:Windows、Mac和Linux。请选择自己操作系统对应的链接。
我们知道R语言在作图统计方面很是实用,但是在其他游戏开发、网页制作、人工智能等很多方面相对于python是很局限。今天我们来以weblogo为例展示如何在R语言中调用python。
因为最近自己购置了一个全新的Windows电脑,所以就系统性的配置了全部的生物信息学相关软件,当然是也包括cytoscape啦。但是遇到了报错,如下:
R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境;Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。
安装R和Rstuido软件 R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境;Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。
现如今,R语言是统计领域广泛使用的工具,是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,是用于统计计算和统计绘图的优秀工具。而RStudio是R的集成开发环境,用它进行R编程的学习和实践会更加轻松和方便。下面就教大家如何下载并安装R和RStudio,比较简单。R的维护工作由一个国际化的开发者团队负责。R软件的官方下载页面叫作The Comprehensive R Archive Network,即CRAN。
编译|王婧 校对|丁一 前言 云计算正逐步成为适用于超出笔记本或台式机处理能力的问题或数据的一种自然延伸。然而,对于完全没有基础的初学者来说,学习使用云计算平台会显得比实际更难。 在本文中,我们用信息图的方式向大家介绍云计算的概念,它的重要性以及使用R语言和R studio的基本设置等几部分内容。由于本文只是一篇快速学习攻略,你可能会遗漏一些概念方面的详细解释。但是不用担心,你还可以参考另外一篇完整版攻略“如何在云端进行R语言编程?”(http://www.analyticsvidhya.com/blog/
现如今,R语言是统计领域广泛使用的工具,是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,是用于统计计算和统计绘图的优秀工具。而RStudio是R的集成开发环境,用它进行R编程的学习和实践会更加轻松和方便。下面就教大家如何下载并安装R和RStudio,比较简单。R的维护工作由一个国际化的开发者团队负责。R软件的官方下载页面叫作The Comprehensive R Archive Network,即CRAN。 一、官网下载R安装包 下载地址为:https://cran.r-project.org
RStudio是一款功能强大的自由和开源编程语言和环境,提供了大量的图形和统计方法统计计算和图形。RStudio支持多系统MOX OS X,Linux和Windows系统,软件可以对代码进行整理,方便您的观看。
R 语言是为数学研究工作者设计的一种数学编程语言,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。
我们知道Python的英文表达是蟒蛇,有意思的是anaconda也是蟒蛇的意思,准确是是水莽,莽中之王,更大、更重、更长。
The Comprehensive R Archive Networkcran.r-project.org
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。
写在前面: 在如何通过Google来使用ggplot2可视化这篇文章中,我们曾经介绍过R语言在生物信息学中的重要性。 这篇文章也激发了很多小伙伴学习的热情。学习R语言必然会安装各种各样的包,很多人在这一步就遇到了困难, 刚开始学习R语言的时候我们经常会遇到各种包安装错误,比如 package ‘airway’ is not available(for R version 3.1.0)等等, 这篇文章我们就来系统性地整理一些新手可能遇到的问题以及解决方案。 当然,你不一定现在就会遇到,但是如果你遇到了,请记住
好吧,我承认,最近都没好好学习了,事情比较多,好几天晚上我都会写下标题,然后就没有然后了,今天再不能忍了,决定来一发。但是,我觉得还是推文的质量要比数量更加重要,不然一个是浪费自己的时间,也是浪费大家的时间。所以虽然很忙,但是我还是会尽力做到解释的完美一点~.~。 今天要给大家讲讲R语言,主要是入门基础及简单的统计分析入门。 R语言其实算是我正式接触编程语言的第一门语言,大学学的C++,matlab简直是水到家了。所以刚开始学R语言的时候,我很痛苦,你知道吗。大约经历了1个月的磨合期,逐渐对R有了点认识,知
首先要下载所需要的示例数据,下载地址:https://storage.googleapis.com/linnarsson-lab-www-blobs/blobs/cortex/expression_mRNA_17-Aug-2014.txt
你是否有过这样的困扰:想使用一个R包,但由于没有root权限而感到束手束脚? 别慌……你只需要用自己的账户重新安装一款R软件,进入到自己目录下的R就可以自由安装R包啦!
大家可能有一部分人对ArrayExpress数据库是比较熟悉的,当然也有人可能没怎么听说过。今天我么主要介绍一个可以获取ArrayExpress数据库数据的R包的安装以及使用。
写在前面: 谨以此文献给那些“奋斗”在转发送别人资源,为了博人眼球,而践踏别人的辛勤的劳动成果的公众号们。 当然了,R包本来就是免费的,你只是不会下载而已,所以重新发下这篇优秀的文章,教大家如何解决R包安装问题。如果你使用了别人的R包,一定要在写文章的时候引用,尊重别人的劳动。 刚开始学习R语言的时候我们经常会遇到各种包安装错误,比如 package ‘airway’ is not available(for R version 3.1.0)等等, 这篇文章我们就来系统性地整理一些新手可能遇到的问题以及解决
Golang简介 编程语言已经非常多,偏性能敏感的编译型语言有 C、C++、Java、C#、Delphi和Objective-C 等,偏快速业务开发的动态解析型语言有PHP、Python、Perl、R
1找到并打开打开R语言官网 2点击主页面上的download R 3在跳转的镜像界面,下拉选择中国的镜像,这里选择第一个清华大学地址。 4根据自己的操作系
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上一讲讲了R语言与Pyhton中的异常捕获与错误处理基本知识,今天以一个小案例来进行实战演练,让你的程序遇水搭桥,畅通无阻。 本案例目标网址,今日头条的头条指数行业报告,全都是pdf格式的,需要先抓包获取PDF文件地址,之后我会随机抽取其中5个地址(因为PDF下载要看网速的,特别慢),然后将其中两个地址设置为不存在地址。 这种错误非常常见,当然实际应用中错误类型多种多样,需要你仔细甄别,但解决的基本思路都是这样的。当遇到一个错误地址导致程序遇阻时,使用异常函数先捕获错误异常,然后使用next命令进行绕过即可
下面提供两种下载地址,官网地址一般为最新的,网盘地址会定期更新,但是不保证一定是最新的
STAR 天下武功唯快不破,STAR就是这样一个神器,人家mapping几个小时,STAR只要15分钟~~~~ 干货的流程 安装 如果你按照下面的教程已经获得了一台云服务器,那么按照如下操作进行。10元转录组分析:这次真的是干货了~灰常干 cd ~/binhttps://github.com/alexdobin/STAR/archive/2.5.3a.tar.gztar -xzf 2.5.3a.tar.gzcd STAR-2.5.3aln -s ~/bin/STAR-2.5.3a/bin/Linux_x8
最近很多新入门的同学问我到底怎么入门,今天先给大家推荐一些有用的书籍和简单的入门。希望可以给有需要的朋友一些帮助,谢谢! 最近新出一本学习书籍,是我们学校焦李成老师的新作——《深度学习、优化与识别》
R语言和plink软件都是常用的软件,随着对软件的熟悉,就不用自己写代码了,直接改代码了,既然改代码,就在一个环境下运行就行了,不想来回切换R和Bash。问题来了:如何在R语言中运行plink软件。
从网站上下载的原始表格,没有单位信息。但根据我们可以根据上面的DOI和Title去pubmed上搜索获取单位信息,126篇一个个搜索复制粘贴,这样简单繁琐的事情计算机来做是最好的。在这里我想用三次内容讲一下我是如何一步一步Get内容。
这个就是从网站上下载的原始表格,没有单位信息。但根据我们可以根据上面的DOI和Title去pubmed上搜索获取单位信息,126篇一个个搜索复制粘贴,这样简单繁琐的事情计算机来做是最好的。在这里我想用三次内容讲一下我是如何一步一步爬取的内容。
一直对linux有种莫名的恐惧感,或许是对于这种不能直接眼见为实的的操作有种害怕的感觉吧。但实际操作起来后,发现和R语言的操作非常类似,并且操作中积极暗示自己这种不可怕,很简单,居然出乎意料的好用。至少,今日的操作中相比很久前自学Linux的感觉截然不同,不得不说,一定要学会Tab键,可以改变心态!
学习Python已有两月有余,是时候检验下学习效果了,之前练习了不少R语言数据爬取,Python的爬虫模块还没有来得及认真入门,乱拼乱凑就匆忙的开始了,今天就尝试着使用R+Python来进行图片爬取,
R语言是比较常用的统计分析和绘图语言,拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库,是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一,支持纯R
安装SRA tools Linux环境下按照以下步骤怎样获得一个自己的服务器请看以下教程“站长,没钱买高配置电脑咋做转录组分析?” 下载SRA toolswget "ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz"解压tar -xzf sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz添加环境变量export PATH=$PATH:~/downlo
大家应该很熟悉windows下的R语言,并且也知道如何安装R包。但是呢,如果对于我们这种Linux小白很好奇那些只有在Linux下才能用的包怎么能让我们在windows下体验下呢。那么,作为神一样的R语言简直无所不能,他们开发了Rtool,这个工具不仅是为创建R包用的,同时也可以让那些以gz结尾的R包可以安装在windows环境下。今天我们就来介绍下R语言与Rtool结合后是如何玩转R包的。
曾老师曾经有一篇推文《批量运行多个R脚本》,介绍了批量运行R脚本的思路,同时也提出了一些问题,今天就这个学徒作业,我们来探究一下。
从打开网址开始教你一步一步的下载TCGA的数据,图文并茂,真的是详细的不能再详细了!
毫无疑问,处理数据的首要条件是理解数据从产生,对应到我们这个系列,也就是了解三维基因组的背景知识,如下:
本文旨在介绍如何使用PyCharm创建高效的R语言开发环境。目前,大多数人仍然使用RStudio进行R语言开发。与RStudio相比,PyCharm具有更多的优势,可以提高开发效率。
这个时候,你无需理会你的服务器的R语言版本或者R包啦,因为你每次都会 conda activate r 激活你自己的R语言环境哦。我们在这个环境里面安装了 bioconductor的 singlecelltk和singlecellsignalr,因为它们本身就会依赖大量的其它R语言包,所以理论上这个时候你的这个 conda activate r 小环境,已经是比较好的可以用来做单细胞转录组数据分析的啦!
此乃旧文,题目改一下,有点系统性,JSA助攻第一波:可以通过Application.Run接口,借助FreeScript插件,让WPS的JSA环境,用上外部主流编程语言及其生态库资源,只需要安装FreeScript,就能让WPS拥有此能力。
作者 | Ajay Ohri 翻译 | 丁雪 校对 | ValaWong 如今,几乎所有领域或业务活动正在通过SMAC进行数据转换。SMAC指的是社交(Socia)、移动(Mobile)、分析(Analytics)和云服务(Cloud)。这个改变的影响已经涉及到包括组织、人员与产品在内的范围。在本文中,我们将通过使用云计算让你提高数据分析能力。 我们已经使用R语言和RStudio由浅入深地解释了云计算的相关概念(请参考大数据文章2015年9月21日发布的文章《如何在云计算平台使用R语言编程的快速入门指南
每一个微生物学组的研究者在分析数据的时候都会遇上各种数据的问题:做16S分析发现数据库定制格式不会,做宏基因组有参分析发现依赖数据无法下载,宏基因组注释分析时用的NT,NR数据库从NCBI下载太慢了,建软件索引时计算资源不足,甚至要担心有一天国际数据库切断了,我们该从哪里下载数据?
什么是R语言? R语言,一种自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。R本来是由来自新西兰奥克兰大学的罗斯·伊哈卡和罗伯特·杰特曼开发(也因此称为R),现在由“R开发核心团队”负责开发。R基于S语言的一个GNU计划项目,所以也可以当作S语言的一种实现,通常用S语言编写的代码都可以不作修改的在R环境下运行。R的语法是来自Scheme。 R的源代码可自由下载使用,亦有已编译的可执行文件版本可以下载,可在多种平台下运行,包括UNIX(也包括FreeBSD和Linux)、Windows和MacO
肠型,Enterotype,是2011年在这篇文章中提出的,即将过去的2018年又有20多们肠道微生物的大佬对肠型的概念进行了回顾和确认。一直比较好奇怎样来用代码分析肠型,今天找到了这个教程,放在这:
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