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    HBase的region管理

    region 热点 唯一可以缓解这种现象的途径就是手动地将热点region 按特定的边界拆分出一个或多个新region,然后将子region 负载分布到多个region 服务器上。 用户可以为region 指定一个拆分行键,即region 被拆分为两部分的位置。用户可以指定region 中任意的行键,这样用户也可以生成大小完全不同的两个region。 表热点 大部分region分布并不均匀,即大多数region位于同一个region 服务器上,对于拥有很多region 的表来说。 一旦均衡器启动,它将会尝试均匀分配region 到所有region 服务器。启动均衡器时,均衡器首先会确定一个region 分配计划, 该计划用于描述region 如何移动。 合并region 当用户向相应的表中插入数据时,region 自动拆分的情况是很常见的。当然在某些特殊 情况下,用户有可能需要合并region

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    HBase Region 自动拆分策略

    HBase-2.x支持7种Region自动拆分Region的策略,类图如下: ? 的拆分 } 拆分效果 经过这种策略的拆分后,Region的大小是均匀的,例如一个10G的Region,拆分为两个Region后,这两个新的Region的大小是相差不大的,理想状态是每个都是5G 所谓热点问题就是数据库中的Region被访问的频率并不一样,某些Region在短时间内被访问的很频繁,承载了很大的压力,这些Region就是热点Region。 > 10min,则判断该Region为Busy RegionRegion被判定为Busy Region,就会被拆分。 它会通过拆分热点Region来缓解热点Region的压力,但是根据热点来拆分Region也会带来很多不确定性因素,因为你也不知道下一个被拆分的Region是哪个。 7.

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    浅谈HBase region的单点问题

    对于正常情况而言,region本质上是单点服务的,当RS宕机时,这个RS上的region无法提供服务,直到他们在另外的RS上重新上线为止。 region单点导致的问题 从正常和异常两个方面对region单点可能导致的问题进行分析。 因为region只在一台RS上assign,那这台RS直接决定了这个region的服务质量,RS发生的任何问题或多或少都会对region产生影响。 ,可能会把RS打爆,从而这个RS上所有的region都被影响了 人为因素(可预期的) balance:手工move/split/merge region,会导致短暂的服务停止 扩容/缩容:会产生大量的region 比如修改压缩或者ttl之类的,此时master会对表的所有region进行批量reopen。同时有十几到几十个region在做reopen是非常正常的。

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    ANNOVAR region-based annotation-上篇

    gene-based annotation 可以得到变异位点与基因之间的关系,除了与基因的关系之外,变异位点在基因组上某些特征区域的分布(比如转录因子结合区域,启动子区,增强子区等)更引人关注,这一功能通过region-based Done with 5163775 regions NOTICE: Finished region-based annotation on 21 genetic variants 输出文件的后缀为hg19 Done with 5797266 regions NOTICE: Finished region-based annotation on 21 genetic variants 输出文件的后缀为hg19 Done with 54199 regions NOTICE: Finished region-based annotation on 21 genetic variants 输出文件的后缀为hg19_ 在region-based annotation中,相关的数据库非常多,本篇只介绍上述几个数据库,剩余的数据库在后续文章中在进行介绍。

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