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🤩 scRNA-seq | 吐血整理单细胞入门教程(Normalization影响因素)(十一)

而在实际分析,scRNAseq影响因素可能不仅仅是library大小问题,还包括由于试剂、分离方法、实验者不同而引起batch effects。...logcounts(umi.qc),batch = umi.qc$detected) 5mnnCorrect (batchelor) MNN,(mutual nearest neighbor),主要思想找到不同批次相同细胞类型...,然后计算同种细胞类型gene表达差异,然后去除批次效应。...,其实际等同于表达数据标准化前余弦距离; 3️⃣ 这个时候我们就得到了一个不同批次间细胞互相配对数据; 4️⃣ 计算细胞间基因表达差值,即表达差异向量,也称为配对特异批次效应校正向量(pair-specific...在应用到有replicatesdataset时,需要分别应用到每个生物学分组,所以在这里,我们提取individual。

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🤩 scRNA-seq | 吐血整理单细胞入门教程(Normalization影响因素)(十一)

而在实际分析,scRNAseq影响因素可能不仅仅是library大小问题,还包括由于试剂、分离方法、实验者不同而引起batch effects。...logcounts(umi.qc),batch = umi.qc$detected) 5. mnnCorrect (batchelor) MNN,(mutual nearest neighbor),主要思想找到不同批次相同细胞类型...,然后计算同种细胞类型gene表达差异,然后去除批次效应。...,其实际等同于表达数据标准化前余弦距离; 3️⃣ 这个时候我们就得到了一个不同批次间细胞互相配对数据; 4️⃣ 计算细胞间基因表达差值,即表达差异向量,也称为配对特异批次效应校正向量...在应用到有replicatesdataset时,需要分别应用到每个生物学分组,所以在这里,我们提取individual。

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Parquet与ORC:高性能列式存储 | 青训营笔记

OLAP OLTP:行式存储格式(行存) 每行数据在文件上连续存储,读取整行数据效率高,单次IO顺序读即可。...定义、支持可选和重复字段、支持嵌套类型(嵌套类型只保存叶子节点数据) 数据布局 RowGroup:每一个行组包含一定数量或者固定大小集合 ColumnChunk:RowGroup按照列切分成多个...Meta) 编码Encoding Plain直接存储原始数据 Run Length Encoding(RLE)适用于列基数不大,重复值较多场景,例如:枚举、Boolean、固定选项等。...-向量化读 向量化读基于parquetFileFormat类实现 向量化读开关spark.sql.parquet.ebableVectorizeReader 向量化读主流大数据分析引擎标准实践,...因此,这个差异对业务效果影响,取决于实际业务场景 列存演进 数仓列存 clickhousemergeTree引擎也是基于列存构建 默认情况下列按照column拆分 支持更加丰富索引 湖仓一体大趋势

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R语言快速入门上手

导言:     较早之前就听说R一门便捷数据分析工具,但由于课程设计原因,一直没有空出足够时间来进行学习。...最近自从决定本科毕业出来找工作之后,渐渐开始接触大数据行业技术,现在觉得时候把R拿下了;用了3天时间,除了对R先有一个大概认识之外,也着手敲指令。...由于计算机专业底子还不错,而且先后接触过不下10种编程语言,感觉R语言入门上手还是挺简单。下面自己汇总一些简单入门代码供大家参考,感兴趣朋友也可逐行敲打测试。 1....介绍向量、数组、列表、数据框、日期时间等数据结构基础知识,以及生成这些结构方法 1 #向量 2 x0 <- c(1,2,3,4,5);print(x0) 3 x1 <-1:10;print(x1...介绍R提供了极其灵活方式,访问、修改、向量、列表、数据框等数据结构,以及R很多重要、常用数据分析函数 1 #3-1访问向量元素 2 3 x <- 1:10;print(x) 4 print

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常见图片格式详解系列(二)----BMP

剩下便是存储每一个像素点对应R,G,B值。 ? BITMAPFILEHEADER WORD bfType:表示文件类型,该值必须0x424D,即字符‘BM’,否则便不是BMP图片。...如需要添加列表可继续从左边点击添加 WORD bfReserved1:保留,必须设为0 WORD bfReserved2:保留,必须设为0 DWORD bfOffbits:表示从文件头开始到实际像素之间偏移...DWORD biCompression:表示像素压缩类型,一般情况下都为不压缩类型,即BI_RGB,还有可选项为BI_RLE4,BI_RLE8,BI_JPEG,BI_BITFIELDS,再此就不赘述喽...DWORD biSizeImage:说明图像大小,以字节为单位,如果BI_RGB类型,可设为0。 LONG biXPelsPerMeter:水平分辨率,单位像素/米。...DWORD biClrUsed:说明位图实际使用彩色表索引颜色数(设为0的话,则说民使用所有调色板项)。

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实时湖仓一体规模化实践:腾讯广告日志平台

2.3 湖仓一体方案优势 原子性保证 之前采用Spark批量写入数据,如果需要修改数据(如补录数据)原子无法保证,也就是说如果有多个Job同时Overwrite一个分区,我们无法保证最终结果正确性...B、表Schema中有很多字段嵌套类型,但是在Spark 2.X版本对嵌套类型谓词下推和列剪枝支持不是很好,在实际查询中发现读了很多不必要数据。...复杂类型向量化读 Iceberg中支持非复杂类型(除了Struct,Map,List这些复杂类型向量化读,或者称之为Batch读。...,所以如果在查询列中有复杂类型字段时就自动转换为非向量化读了。...对于日志平台这种很复杂表结构,大部分字段都是复杂类型。而在Spark 3.3版本开始支持了Parquet复杂类型向量化读,为此我们在内部Spark 3.1.2版本上移植了该特性。

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BMP格式

biCompression 444 压缩类型——BI_RGB=0,BI_RLE8=1,BI_RLE4=2,BI_BITFIELDS=3 biSizeImage 444 图像大小——如果没有压缩则该值为...对于 32 位 BMP 图像来说,每个掩码字段连续 10 比特(必须连续且相互无交叉)用来表明每个分量使用到比特位置。...所以必须使用 bfOffBits 字段来明确 Pixel Data 起始偏移。像素行由底向上排列在 Pixel Data ,即 Pixel Data 第一行为图像最底行,以此类推。...在其他大多数图像格式,这三个分量顺序往往反过来,即 Red、Green、Blue。...(注意: ​ 必须为 2倍数,否则会在最后填充字节) 3.2 RLE8 在 RLE8 压缩算法,压缩数据被切分称 2Bytes 数值对,第二个字节为像素值,第一个字节则给出了像素值连续出现数目

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曾因「抢车位」出圈儿,神奇Mask R-CNN了解一下?

语义分割 上图一幅标注得很精确语义分割图片,不仅不同类别之间边界清晰,而且分类准确。...COCO数据集像素级标注 Mask R-CNN训练在COCO数据集上进行。...在COCO数据集目标检测任务,检测结果保存格式有两种:一种使用一个2D边界框来定位图像不同目标(在对定位精度要求较高应用显得有些粗糙);另一种逐像素对目标进行分割(相应地,图像每个像素都会被标注出来...encoding,RLE)机制。...RLE一种简单、高效二进制掩码储存格式。RLE首先将向量(或者向量图像)划分为一系列分段连续区域,对每个区域储存其长度。

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python numpy基本方法总结可以类推tensorflow

a向量而b矩阵,a列数必须等于b列数,a与每个行向量对应元素相乘得到行向量。...(PS:总之就是,向量很特殊,在运算可以自由转置而不会出错,运算返回值如果维度为1,也一律用行向量[]表示) 读取数组元素:如a[0],a[0,0] 数组变形:如b=a.reshape(2,3,4...算术平方根,a为浮点数类型:np.sqrt(a) 对数:np.log(a) 修剪数组,将数组中小于x数均换为x,大于y数均换为y:a.clip(x,y) 所有数组元素乘积:a.prod()...判断两数组是否相等: np.array_equal(a,b) 判断数组元素是否为实数: np.isreal(a) 去除数组首尾为0元素:np.trim_zeros(a) 对浮点数取整,但不改变浮点数类型...np.cov(x),np.cov(x,y) 计算矩阵迹(对角线元素和):a.trace() 相关系数:np.corrcoef(x,y) 给出对角线元素:a.diagonal() 四、线性代数 估计线性模型系数

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python numpy基本方法总结可以类推tensorflow

() 创建数组:np.zeros((2,3)),或者np.ones((2,3)),参数一个元组分别表示行数和列数 对应元素相乘,a * b,得到一个新矩阵,形状要一致;但是允许a向量而b矩阵...,a列数必须等于b列数,a与每个行向量对应元素相乘得到行向量。...(PS:总之就是,向量很特殊,在运算可以自由转置而不会出错,运算返回值如果维度为1,也一律用行向量[]表示) 读取数组元素:如a[0],a[0,0] 数组变形:如b=a.reshape(2,3,4...算术平方根,a为浮点数类型:np.sqrt(a) 对数:np.log(a) 修剪数组,将数组中小于x数均换为x,大于y数均换为y:a.clip(x,y) 所有数组元素乘积:a.prod()...np.cov(x),np.cov(x,y) 计算矩阵迹(对角线元素和):a.trace() 相关系数:np.corrcoef(x,y) 给出对角线元素:a.diagonal() 四、线性代数 估计线性模型系数

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实时湖仓一体规模化实践:腾讯广告日志平台

2.3 湖仓一体方案优势 原子性保证 之前采用Spark批量写入数据,如果需要修改数据(如补录数据)原子无法保证,也就是说如果有多个Job同时Overwrite一个分区,我们无法保证最终结果正确性...B、表Schema中有很多字段嵌套类型,但是在Spark 2.X版本对嵌套类型谓词下推和列剪枝支持不是很好,在实际查询中发现读了很多不必要数据。...复杂类型向量化读 Iceberg中支持非复杂类型(除了Struct,Map,List这些复杂类型向量化读,或者称之为Batch读。...,所以如果在查询列中有复杂类型字段时就自动转换为非向量化读了。...对于日志平台这种很复杂表结构,大部分字段都是复杂类型。而在Spark 3.3版本开始支持了Parquet复杂类型向量化读,为此我们在内部Spark 3.1.2版本上移植了该特性。

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数据结构概述 原

序偶由两个元素x和y按一定顺序排列而成二元组,记作,x第一元素,y第二元素。...2.分类 数据类型根据是否允许分解可分为原子类型和结构类型。 1>原子类型 原子类型指其值不可再分数据类型。例如:整形、字符型。...计算机硬件原子类型:位、字节、字 2>结构类型 结构类型指其值可以再分解为若干成分数据类型。...五、抽象数据类型 为了将顶层算法与底层算法隔开,使二者在设计时不会互相牵制、互相影响,必须对二者接口进行一次抽象。让底层只通过这个接口为顶层服务,顶层也只通过这个接口调用底层运算。...,如果按照其值不同特性,可细分为3种类型原子类型:属于原子类型变量不可再分

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从节省Redis内存空间说开去

RLE 解码器遇到符号‘ 0 ’ 时候,它表明后面的两个字节决定了需要输出哪个符号以及输出多少次。 ? 1.2 实现 RLE 可以使用很多不同方法。基本压缩库详细实现方式是非常有效一个。...音频和高动态变化图像都是这种类型数据,它们被预处理过(例如 delta 相邻采样)。...如果 rice 编码比固定开端长, T ,一个可选编码:输出 T 个‘ 1 ’位,紧跟( log2(X-T) )个‘ 1 ’和一个‘ 0 ’位,接着 X-T (最没有意义 (log2(X-T))...4.2 实现 使用 LZ77 一个问题由于算法需要字符串匹配,对于每个输入流单个字节,每个流此字节前面的哪个字节都必须被作为字符串开始从而尽可能进行字符串匹配,这意味着算法非常慢。...另一个问题是为了最优化压缩而调整字符串引用表示形式并不容易。例如,必须决定是否所有的引用和非压缩字节应该在压缩流字节边界发生。

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程序员需要了解硬核知识之压缩算法

RLE 算法一种很好压缩方法,经常用于压缩传真的图像等。...,但是 RLE 只针对特定序列数据管用,下面 RLE 算法压缩汇总 文件类型 压缩前文件大小 压缩后文件大小 压缩比率 文本文件 14862字节 29065字节 199% 图像文件 96062字节...几乎压缩前两倍!因为文本字符连续字符并不多见。 就像上面我们探讨这样,RLE 算法只针对连续字节序列压缩效果比较好,假如有一连串不相同字符该怎么压缩呢?...比如说ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ,26个英文字母所占空间应该是 26 个字节,我们用 RLE 压缩算法压缩后结果为 A1B1C1D1E1F1G1H1I1J1K1L1M1N1O1P1Q1R1S1T1U1V1W1X1Y1Z1...在了解哈夫曼算法之前,你必须舍弃半角英文数字1个字符1个字节(8位)数据。下面我们就来认识一下哈夫曼算法基本思想。 文本文件由不同类型字符组合而成,而且不同字符出现次数也是不一样

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IEEE Trans 2006 使用K-SVD构造超完备字典以进行稀疏表示(稀疏分解)

第二步根据得到系数矩阵和观测向量来不断更新字典。 设D∈R n×K,包含了K个信号原子向量原型{dj}j=1K,y∈R n信号可以表示成为这些原子稀疏线性结合。...第二个假设针对隐藏变量x,我们通过公式(5)来计算信号某一元素似然函数: ? 结合公式(3)我们有: ? 假定表示向量X元素零均值独立同分布,通常是柯西或者拉普拉斯分布。...据此,我们限制D必须满足单位L2范数。则重写更新公式如下: ?...B K-SVD 稀疏表示可以认为式(16)向量量化目标函数泛化形式,每个信号不再只由一个原子进行表示,在稀疏表示我们允许每个输入信号能表示成为几个代码字线性组合。...但是,这一步很有可能会出错,因为在更新dk时候,我们没有对稀疏进行约束,则我们得到XT 会是满向量,即大多素元素都为非零向量

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74款android开机动画,修改Android系统开机动画

大家好,又见面了,我你们朋友全栈君。 Android系统开机动画包括两部分: 开机显示 ANDROID 文字; ANDROID发光动画。 这篇文章说开机动画第一种,下面开始正文! 1....将raw格式转化为rle文件 需要用到android编译后rgb2565工具,在android/out/host/linux-x86/bin目录下(android为当前源码所在目录),转换命令如下:...rgb2565 -rle initlogo.rle 到目前为止,启动需要显示图像已经做好了,就是initlogo.rle,注意文件名必须这个,如果想改文件名.../ramdisk.img > list 注:list一个文本文件,里面存储了ramdisk.img文件结构,我们需要在这个文件中加入initlogo.rle这一行,修改后文件如下: data default.prop...2.1 或 2.0操作系统 2.必须修改android 根目录下面的两个文件:init.rc 和 init 功能才能实现设置开机LOGO和开机动画功能 修改init.rc 和 init 方法

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图神经网络12-分子指纹GCN:Neural FPs

典型流程将提取分子结构特征、然后哈希(Hashing)生成比特向量。 比较分子很难,比较比特串却很容易,分子之间比较必须以可量化方式进行。...索引操作Indexing:在 ECFP 算法,每一层采用索引操作目的将每个原子特征向量组合成整个分子指纹。...这种索引操作一个缺点:当分子图比较小而指纹长度很大时,最终得到指纹向量非常稀疏。然后论文使用softmax 操作视作索引操作一个可导近似。本质上这是要求将每个原子划分到一组类别的某个类别。...所有原子这些类别向量总和得到最终指纹向量。其操作也类似于卷积神经网络池化操作。 规范化Canonicalization:无论原子邻域原子顺序如何变化,圆形指纹不变。...实现这种不变性一种方式:在算法过程,根据相邻原子特征和键特征对相邻原子进行排序。论文里尝试了这种排序方案,还对局部邻域所有可能排列应用了局部特征变换。

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(49)STM32——照相机实验

图片格式 BMP 全称BitMap,Windows标准图像文件格式,后缀名为:“.bmp”。 采用位映射存储方式,除图像深度可选外,不做任何压缩。...BMP位图信息头结构体定义如下:         设置biCompression值时一般不会设置为BI_RLE84和BI_RLE8,经常设置为BI_BITFIELDS如果16位图时会直接设置为BI_BITFIELDS...颜色表          颜色表(调色板):颜色表用于说明位图中颜色,它有若干个表项,每一个表项一个RGBQUAD类型结构,定义一种颜色,如下所示: typedef __packed struct...分别代表红、绿、蓝三色掩码,一般: 0X7C00(高5位)、0X03E0(6位)、0X001F(低5位)。...这里,M0AR,M1AR所指向内存,必须内部内存,不过由于采用了双缓冲机制,我们就不必定义一个很大数组,一次性接收所有JPEG数据了,而是可以分批次接收,数组可以定义比较小。

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115-R编程17-赋值运算符

x 在函数作用域里进行声明,所以它只存在于此函数,一旦运算完成便“消失”。...ps:关于闭包参见下期[[123-R编程20-函数式编程和函数工厂]] 一般说来, <<- 多用于在顶层环境写入变量。然而需要注意,以 <<- 执行赋值时,会一直向上直至顶层进行变量查找。...若在查找过程寻找到该名称变量,就会进行赋值操作。否则,将在顶层环境创建变量并赋值。 即如果想在多层函数内部使用 <<- 改变全局环境内容的话,需要注意中间函数是否存在相同名称变量。...rapply()lapply()递归版本,每一次迭代都将函数作用到列表特定原子向量上。...logi [1:2] TRUE FALSE #> $ b.y.w: num [1:3] 2 3 4 也就是利用rapply()将一个函数递归应用到nested_list()列表上,每一次迭代,函数通过x获得一个该列表原子向量

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