UCSC基因组浏览器在大规模高通量数据的可视化和比较分析研究中发挥着重要的作用。 本文详细介绍了如何一步步在本地安装、配置、高级使用UCSC浏览器。 安装UCSC浏览器 1. 安装mysql+apache #For Ubuntu user sudo apt-get install tasksel sudo apt-get install lamp-server #For readhat or centos user yum install httpd mariadb-server mariadb 2. 新
Rsync是一款开源的、快速的、多功能的、可实现全量及增量(全量备份是指全部备份,增量备份是在上一次备份的基础上只备份更新的内容)的本地货远程数据同步备份的优秀工具。Rsync软件适用于unix/linux/windows等多种操作系统平台。
背景:NBU的catalog日志在/drfile路径下,该日志很重要,记录了每天备份的详细行为,极端情况下,可以通过该日志将NBU恢复到对应某天状态,然后在进行数据恢复(前提是虚拟带库或者物理带库没有被复写)。现将该日志备份至某台Centos7.6。
Rsync 是一个开源的快速备份工具,是Linux和UNIX操作系统默认安装的组件之一,可在不同主机间镜像同步整个目录,并支持增量备份文件传输,保持链接和权限,采用优化的同步算法,传输前执行压缩,适用于异地备份,镜像服务器等应用。
rsync是一个功能非常强大的工具,Rsync的命令格式可以为以下六种: rsync [OPTION]... SRC DEST rsync [OPTION]... SRC [USER@]HOST:DEST rsync [OPTION]... [USER@]HOST:SRC DEST rsync [OPTION]... [USER@]HOST::SRC DEST rsync [OPTION]... SRC [USER@]HOST::DEST rsync [OPTION]... rsync://[USER@]HOST[:PORT]/SRC [DEST] 对应于以上六种命令格式,rsync有六种不同的工作模式: 1)拷贝本地文件。当SRC和DES路径信息都不包含有单个冒号":"分隔符时就启动这种工作模式。如:rsync -a /data /backup 2)使用一个远程shell程序(如rsh、ssh)来实现将本地机器的内容拷贝到远程机器。当DST路径地址包含单个冒号":"分隔符时启动该模式。如:rsync -avz *.c foo:src 3)使用一个远程shell程序(如rsh、ssh)来实现将远程机器的内容拷贝到本地机器。当SRC地址路径包含单个冒号":"分隔符时启动该模式。如:rsync -avz foo:src/bar /data 4)从远程rsync服务器中拷贝文件到本地机。当SRC路径信息包含"::"分隔符时启动该模式。如:rsync -av root@172.17.5.13::www /databack 5)从本地机器拷贝文件到远程rsync服务器中。当DST路径信息包含"::"分隔符时启动该模式。如:rsync -av /databack root@172.17.5.13::www 6)列远程机的文件列表。这类似于rsync传输,不过只要在命令中省略掉本地机信息即可。如:rsync -v rsync://172.17.5.13/www rsync参数的具体解释如下: -v, --verbose 详细模式输出 -q, --quiet 精简输出模式 -c, --checksum 打开校验开关,强制对文件传输进行校验 -a, --archive 归档模式,表示以递归方式传输文件,并保持所有文件属性,等于-rlptgoD -r, --recursive 对子目录以递归模式处理 -R, --relative 使用相对路径信息 -b, --backup 创建备份,也就是对于目的已经存在有同样的文件名时,将老的文件重新命名为~filename。可以使用--suffix选项来指定不同的备份文件前缀。 --backup-dir 将备份文件(如~filename)存放在在目录下。 -suffix=SUFFIX 定义备份文件前缀 -u, --update 仅仅进行更新,也就是跳过所有已经存在于DST,并且文件时间晚于要备份的文件。(不覆盖更新的文件) -l, --links 保留软链结 -L, --copy-links 想对待常规文件一样处理软链结 --copy-unsafe-links 仅仅拷贝指向SRC路径目录树以外的链结 --safe-links 忽略指向SRC路径目录树以外的链结 -H, --hard-links 保留硬链结 -p, --perms 保持文件权限 -o, --owner 保持文件属主信息 -g, --group 保持文件属组信息 -D, --devices 保持设备文件信息 -t, --times 保持文件时间信息 -S, --sparse 对稀疏文件进行特殊处理以节省DST的空间 -n, --dry-run现实哪些文件将被传输 -W, --whole-file 拷贝文件,不进行增量检测 -x, --one-file-system 不要跨越文件系统边界 -B, --block-size=SIZE 检验算法使用的块尺寸,默认是700字节 -e, --rsh=COMMAND 指定使用rsh、ssh方式进行数据同步 --rsync-path=PATH 指定远程服务器上的rsync命令所在路径信息 -C, --cvs-exclude 使用和CVS一样的方法自动忽略文件,用来排除那些不希望传输的文件 --existing 仅仅更新那些已经存在于DST的文件,而不备份那些新创建的文件 --delete 删除那些DST中SRC没有的文件 --delete-excluded 同样删除接收端那些被该选项指定排除的文件 --delete-after 传输结束以后再删除 --ignore-errors 及时出现IO错误也进行删除 --max-delete=NUM 最多删除NUM个文件 --partial 保留那些因故没有完全传输的文件,以是加快随后的再次传输 --force 强制删除目
rsync是Linux下进行文件同步到一个命令,可以同步两台计算机到文件与目录,利用查找文件中到不同块以减少数据传输。也可以在一台电脑到不同目录间同步,比如可以写个简单到脚本,将系统中你到一些配置文件备份到一个 dotfiles 文件夹,上传到 GitHub 以便以后新的电脑或系统再利用 rsync 回复这些配置文件,这是很方便自动化的(我就是这么干的 dotfiles)。 rsync的基本用法 $ rsync [options] src dest 1、目的端和源端文件内容不同,触发同步 2、rsync不
本文介绍了如何使用Rsync进行文件同步,并基于CentOS 7服务器进行了实例演示。首先介绍了Rsync的命令行参数和配置文件选项,然后通过配置文件指定了同步目录。接着,演示了如何通过Rsync进行增量备份和排除备份目录。最后,总结了Rsync的权限配置问题和常见错误。
3、 可以做到保持源文件或目录的权限、时间、软硬连接、属主、组等所有属性均不改变-p
rsync error: error starting client-server protocol (code 5) at main.c(1648) sender=3.1.2
rsync 是 linux 系统下的数据同步、备份工具。可实现数据全量备份、增量备份、远端数据同步以及本地数据同步。
本次部署流程中,需要一台服务端服务器和一台客户端服务器(backup服务器充当服务端服务器,nfs存储服务器充当客户端服务器)
rsync是linux系统下的数据镜像备份工具。使用快速增量备份工具Remote Sync可以远程同步,支持本地复制,或者与其他SSH、rsync主机同步。
-比如,拷贝到对方机器root用户下 - 然后在root后加IP,并用 : 冒号分开,再跟文件的根路径
rsync介绍 rsync是一款开源的、快速的、多功能的、可实现全量及增量的本地或远程数据同步备份工具 在常驻模式(daemon mode)下,rsync默认监听TCP端口873,以原生rsync传输协议或者通过远程shell如RSH或者SSH提供文件。SSH模式下,rsync客户端运行程序必须同时在本地和远程机器上安装。 全量与增量 全量:将全部数据进行传输覆盖 增量:只传输差异部分的数据 rsync通过独特的“quick check”算法,实现增量数据传输 rsync的功能 类似与cp命令
1、cwRsync官网https://itefix.net/国内访问不了,cwRsync Client免费,cwRsync Server收费(4.1版本免费)
原文链接:https://rumenz.com/rumenbiji/linux-rsync.html
Rsync是一个命令行实用程序,它将文件和文件夹从一个位置同步到另一个位置。可以使用rsync实现的一些工作流程是从开发计算机更新生产主机,或使用cron作业调用rsync以定期将数据备份到存储位置。您甚至可以使用rsync 将服务器从其他提供程序迁移到Linode。
由于我们经常使用rsync进行服务器文件的同步工作,但在配置过程中,会出现很多问题,下面的错误基本上都是通过客户端返回的错误进行分析 我们都是通过错误日志查看 在rsyncd.log里面或.err文件里面,大家可以用记事本打开查看。或者本页使用“ctrl+f”搜索关键字查找 注意windows下面我们需要给SvcwRsync用户,管理同步目录的所有权限,基本上这样就可以了 问题一: @ERROR: chroot failed rsync error: error starting client-ser
源服务器的密码文件不用指定用户名,用户名在使用同步命令的时候才用到,目前源服务器的准备工作已经完成了。
rsync 是一款开源的、快速的、多功能的、可实现全量及增量的本地或远程数据同步备份的优秀工具。Rsync软件适用于unix/linux/windows等多种操作系统平台。
Rsync是一种很便捷的远程数据备份工具,其优点就不再赘述,大家可以百度一下;鉴于Rsync的强大的功能所以我们很有必要来学习一下,下面我们就搭建一个简单的rsync服务来说明rsync是如何同步数据的
rsync运行架构: C/S Client/Server B/S Browser/Server
导读:本文主要讲解了如何利用 rsync+inotfy/sersync 实现数据实时同步的操作过程和部分原理、参数。
前面介绍了一些关于rsync的功能与一些具体的命令格式、参数的使用意义等,今天我们来聊一聊整个实际生产过程中的实战操作过程
rsync(remote synchronize)是一个远程数据同步工具,可通过LAN/WAN快速同步多台主机间的文件。rsync使用所谓的“rsync算法”来使本地和远程两个主机之间的文件达到同步,这个算法只传送两个文件的不同部分,而不是每次都整份传送,因此速度相当快。
在生产中有一种需求是,当目录下的文件数据发生变化时,就将数据备份到备份服务器上。实现这样的需求需要做到以下两点:
Rsync简介 什么是rsync? Rsync是一款开源的、快速的、多功能的、可实现全量及增量的本地或远程数据同步备份的优秀工具。Rstync软件适用于unix/linux/windows等多种操作
根据 inotify 的相关知识,可以发现,很多动作都涉及了close事件,且大多数情况都是伴随着close_write事件的。所以,大多数情况下在定义监控事件时,其实并不真的需要监控open、modify、close事件。特别是close,只需监控它的分支事件close_write和close_nowrite即可。由于一般情况下inotify都是为了监控文件的增删改,不会监控它的访问,所以一般只需监控close_write即可。
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它可以在本地计算机与远程计算机之间,或者两个本地目录之间同步文件(但不支持两台远程计算机之间的同步)。它也可以当作文件复制工具,替代cp和mv命令。
主机角色 外网IP(NAT) 内网IP(LAN) 主机名称
rsync是Liunx下的远程数据同步工具,可快速同步多台服务器间的文件和目录,并可实现增量同步以减少数据的传输。
现有服务器A和服务器B,如果服务器A的指定目录(例如 /home/paul/rsync/ )中的内容发生变更(增删改和属性变更),实时将这些变更同步到服务器B的目标目录中(例如 /home/paul/rsync/ )。
2.rsync配置(千万注意:本人亲自入坑,下面的配置信息,请在添加到配置文件中后千万记得删除掉后面#部分的备注信息,否则同步过程会失败,不知原因,删除后即可正常同步,超级大坑...测试了一个早上才找到原因)
Rsync(remote synchronize)是一个远程数据同步工具,可通过LAN/WAN快速同步多台主机间的文件,也可以使用 Rsync 同步本地硬盘中的不同目录。
[root@backup tmp]# rsync -avz /etc/hosts -e 'ssh -p 22' root@172.16.1.5:/tmp/
前言 与传统的cp、tar备份方式相比,rsync具有安全性高、备份迅速、支持增量备份等优点, 通过rsync可以解决对实时性要求不高的数据备份需求,但随着文件数量的增大和实时同步的要求,rsync已不能满足需求,随之 rsync+inotify便应运而生。本文将讲解rsync的基础知识和如何基于rsync+inotify实现数据实时同步传输。 rsync相关介绍 rsync(remote sync)是一款快速增量备份工具(远程同步),支持本地复制,或者与其他SSH(安全传输)、rsync主机同步。
1 什么是rsync?(理论) 简而言之主要特点就是实现全量与增量,本地和远程的数据备份工具,同样适用于indows。 官网http://www.samba.org/ftp/rsync/rsync.html rsync 在本地目录之间还能实现rm删除的功能 他根据文件和修改时间大小来同步 也可以根据权限不同来备份,需指定参数 2 特点(理论) 能有排除功能 能保持源目录和文件的时间权限和软连接属主等属性 能配合ssh通道来加密 可以作为服务,让客户端来连 支持匿名和支持认证 3 工作方式(理论) 本地之间传 类似cpmingl 借助ssh 守护进程方式(重要) 4实例用途(操作) (1)客户端模式 本地环境: 传文件 rsync /etc/hosts /opt 传目录 rsync -avz /opt /mnt <==相当于 cp -ap /opt /mnt ##注意/opt后的/加和不加的区别,很重要加了/只是把下面的文件过去,不加的话连自己opt都过去了,如果记不住就自己测试下 远程环境: 推送(传过去):rsync -avz /etc/hosts -e “ssh -p 22000” root@64.78.172.119:~ 拉取(从远端主机传过来):rsync –avz root@64.78.172.119:~/test.txt /etc/ -e “ssh -p 22000” ##记忆命令方法:本地目录 ---》》远程 ----》通过什么方式 -e “ssh -p22000” (2)守护进程模式 配置服务端rysnc Vi /etc/rsyncd.conf里的内容 uid = rsync gid = rsync use chroot = no max connections = 200 timeout = 100 pid file = /var/run/rsyncd.pid lock file = /var/run/rsync.lock log file = /var/log/rsyncd.log [oldboy] path = /oldboy/ ignore errors read only = false list = false hosts allow = 199.101.117.0/24 hosts deny = 0.0.0.0/32 auth users = rsync_backup secrets file = /etc/rsync.password ##如果在windows下编辑或者复制的编码到linux下就最好用这个命令处理下Dos2unix /etc/rsyncd.conf mkdir /oldboy useradd rsync -s /bin/nologin –M ## 新建个账户(和配置文件的uid-gid对应,此账户属性不能登录并且没目录) chown -R rsync.rsync /oldboy ##(重要) echo “rsync_backup:oldboy”> /etc/rsync.password ##rsync_backup是虚拟账户,到时候客户端连接就用这个账户和密码oldboy。 chmod 600 /etc/rsyncd.conf ##设置成别人都不能看到,因为里面有密码 rsync --daemon #启动进程 ##以上配置结束,下面是辅助的管理rsync的操作命令 lsof -i :873 ##查看rsync服务是否起来 pkill rsync ##杀掉进程 killall rsync ##但不一定杀掉 判断杀掉否就再执行一次,提示no programs killed就说明对了 ps -ef |grep rsync ##客户端配置:只要这两步即可 echo “oldboy”>/etc/rsync.password #这个路径和服务端路径没任何关系,为了规范而已,密码必须和服务那相同 chmod 600 /etc/rsync.password ##当配
在Linux平台下我们可以利用2.6内核的inotify监控文件系统机制,通过inotify-tools来实现实时同步了。 具体操作如下: 1.安装所需软件 目前各大Linux发行版本都已经具有了rsync与inotify-tools的软件包,推荐通过RPM,yum,apt-get等方式进行安装。 RHEL: [root@server1 ~]# rpm -ivh rsync-* [root@server1 ~]# rpm -ivh inotify-tools-* CentOS: [root@server1 ~]# yum install rsync inotify-tools Ubuntu: [root@server1 ~]# apt-get install rsync inotify-tools 采用源码方式安装的步骤如下: [root@server1 ~]# wget ftp://ftp.samba.org/pub/rsync/rsync-3.0.8.tar.gz [root@server1 ~]# tar xzvf rsync-3.0.8.tar.gz [root@server1 ~]# cd rsync-3.0.8 [root@server1 ~]# ./configure [root@server1 ~]# make [root@server1 ~]# make install [root@server1 ~]# wget http://github.com/downloads/rvoicilas/inotify-tools/inotify-tools-3.14.tar.gz [root@server1 ~]# tar xzvf inotify-tools-3.14.tar.gz [root@server1 ~]# cd inotify-tools-3.14 [root@server1 ~]# ./configure [root@server1 ~]# make [root@server1 ~]# make install 2.配置ssh key信任 建议通过普通用户进行操作,理由是通过root操作本身就危险,免密码登陆的root就更危险了。 在两台服务器上创建rsync用户 [root@server1 ~]# useradd -m rsync [root@server1 ~]# passwd rsync [root@server2 ~]# useradd -m rsync [root@server2 ~]# passwd rsync [root@server1 ~]# su - rsync [rsync@server1 ~]$ ssh-keygen -t rsa 在提示保存私钥(key)和公钥(public key)的位置时,使用默认值; 在提示是否需要私钥密码(passphrase)时,直接敲回车,即不使用私钥密码。 之后,将生成一对密钥,id_rsa(私钥文件)和id_rsa.pub(公钥文件),保存在/home/rsync/.ssh/目录下。 将公钥添加到远程主机的 authorized_keys 文件中 将文件上传到远程主机(假设远程主机IP为192.168.10.4) [rsync@server1 ~]$ scp ~/.ssh/id_rsa.pub rsync@192.168.10.4:/home/rsync/ 使用rsync用户SSH到登陆到远程主机,并将公钥添加到 authorized_keys 文件中 [rsync@server2 ~]$ mkdir .ssh [rsync@server2 ~]$ chmod 700 .ssh [rsync@server2 ~]$ mv ~/id_rsa.pub ~/.ssh/authorized_keys 重启SSH服务 [root@server1 ~]# /etc/init.d/sshd restart [root@server2 ~]# /etc/init.d/sshd restart 3.创建inotify_rsync.sh脚本 [root@server1 ~]# vim inotify_rsync.sh 1 #!/bin/sh 2 SRC=/home/rsync/test 3 DST=rsync@192.168.10.4:/home/rsync/test 4 5 /bin/su - rsync 6 /usr/local/bin/inotifywait -mrq -e modify,delete,create,attrib ${SRC} | while read D E F 7 do 8 /usr/bin/rsync -ahqzt
-多年互联网运维工作经验,曾负责过大规模集群架构自动化运维管理工作。 -擅长Web集群架构与自动化运维,曾负责国内某大型金融公司运维工作。 -devops项目经理兼DBA。 -开发过一套自动化运维平台(功能如下): 1)整合了各个公有云API,自主创建云主机。 2)ELK自动化收集日志功能。 3)Saltstack自动化运维统一配置管理工具。 4)Git、Jenkins自动化代码上线及自动化测试平台。 5)堡垒机,连接Linux、Windows平台及日志审计。 6)SQL执行及审批流程。 7)慢查询日志分析web界面。
实验需求:在服务器(192.168.100.1)端搭建rsync服务,将/usr/src目录同步到客户端/rsync目录
rsync 是 linux 系统下的数据镜像备份工具。使用快速增量备份工具 Remote Sync 可以远程同步,支持本地复制,或者与其他 SSH、rsync 主机同步。
rsync是一个提供快速增量文件传输的开源工具。其基于GNU General Public License 发布,目前主要有 Wayne Davison (http://opencoder.net/)维护。
2、-z,--compress 传输是进行压缩以提高传输效率,--comperess -level = NUM可以按级别压缩
rsync 命令是一个远程数据同步工具,可通过 LAN/WAN 快速同步多台主机间的文件。rsync 使用所谓的 “rsync算法” 来使本地和远程两个主机之间的文件达到同步,这个算法只传送两个文件的不同部分,而不是每次都整份传送,因此速度相当快。rsync 是一个功能非常强大的工具,其命令也有很多功能特色选项。
1.rsync 与传统的cp、tar备份方式相比,rsync具有安全性高、备份迅速、支持增量备份的优点,通过rsync可以解决对实时性要求不高的数据备份需求,例如定期的备份文件服务器数据到远端服务器,对本地磁盘定期做数据镜像等。 随着应用系统规模不断的扩大,对数据安全性和可靠性也提出了更高的要求,rsync在高端业务中也逐渐暴露出许多不足。首先,rsync实时同步时,需要扫描所有的文件进行比对,进行差量传输。如果文件数量打到了百万甚至千万量级,扫描所有的文件是非常耗时的,而且正在发生变化的往往是其中很少一部
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