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    一篇9分的miRNA文章了解一下!

    大约70%的多囊卵巢综合征 (PCOS) 妇女存在与体质量相关的高于或超过体质量的内在胰岛素抵抗 (IR),包括脂肪组织 (AT) 的糖代谢功能失调。在AT中,对 IRS/pi3k/AKT 通路信号成分的分析发现,仅 GLUT4 在 PCOS 患者和 IR 对照受试者中的表达显著降低。我们检测了 miRNAs 的作用,特别是在调节 GLUT4(胰岛素敏感葡萄糖转运蛋白)在 PCOS 和匹配对照组的 AT 中的作用。PCOS AT 被确定为有差异表达的 miRNA 谱,包括上调的miR-93、-133 和-223。GLUT4是miR-93的高度预测靶点,而miR-133和miR-223已被证实可调节心肌细胞中GLUT4的表达。miR-93的表达揭示了体内IR稳态模型评估值与人 AT 中 GLUT4和miR-93表达之间的强相关性,而非 miR-133和miR-223表达。过表达miR-93 通过直接靶向GLUT4 39UTR 导致脂肪细胞中GLUT4基因表达下调,同时抑制 miR-93 活性导致GLUT4表达增加。这些结果指出了一种通过miR-93调节胰岛素刺激的葡萄糖摄取的新机制,并证明在所有PCOS和非 PCOS 妇女 IR中miR-93表达上调,可能解释了该综合征的 IR。相反,miR-133 和 miR-223 在 PCOS 的 IR 中可能有不同的作用,尽管尚未明确。

    03

    单细胞转录组基本概念(一)

    普通转录组的思路也可以应用到单细胞转录组。普通转录组相当于把一群细胞或一个器官混合到一起去提取RNA,获得的是每个细胞中RNA表达量的平均值。单细胞是把每个细胞单独分出来去提取RNA,然后建库测序,获得是是单个细胞的表达值。在每个细胞里面基因的表达具有随机性,且存在异质性。而且这些细胞群中会存在不同类型的细胞,尤其是当我们对整个组织或者器官进行测序时,它们本身就是由不同类型的细胞组成的,而我们用普通转录组来测序,相当于掩盖住了这些不同的细胞类型的差异,展示的是整个组织的平均的状态,所以说单细胞从这个来看跟普通转录组就不同在是用一个细胞测,不是用一堆细胞测。

    04

    RNA m6A检测方法

    最近几年来m6A研究迅速发展,正是得益于meRIP-seq技术的开发及应用。meRIP-seq高通量测序技术的出现,能够高效精确检测全转录组不同的RNA 甲基化,是成功发现RNA 甲基化机理及功能的关键技术。MeRIP-seq 技术将甲基化DNA 免疫共沉淀(methylated DNA immunoprecipitation, MeDIP) 技术、RNA 结合蛋白免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)技术和RNA 测序(RNA sequencing,RNA-seq) 技术组合起来,高精度地检测全基因组(或全转录组)范围内的RNA 甲基化。MeRIP-seq 技术采用免疫共沉淀方法,即甲基化RNA 特异性抗体与被随机打断的RNA 片段进行孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序(IP),同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本用于消除抓取带有甲基化片段过程中的背景。然后将免疫共沉淀(IP)样本和对照样本中的序列片段对比(或定位)到参考基因组/ 转录组上,检测RNA 甲基化位点。对照样本测量对应RNA 的表达量,本质上是RNA-seq 数据。

    01

    你所不知道的 qPCR应用

    荧光定量PCR技术于1996年由美国Applied Biosystems公司推出,由于该技术不仅实现了PCR从定性到定量的飞跃,而且与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点,目前已得到广泛应用。荧光定量PCR技术是通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时监控反应过程。随着PCR 反应的进行,反应产物不断累积,荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环,收集一次荧光强度信号,这样就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,结合相应的软件对产物进行分析,可以得到荧光扩增曲线,计算待测样品初始模版的量。实时荧光定量PCR技术是一次由定性技术向定量技术的飞跃,运用该项技术,可以对DNA、RNA样品进行相对定量、绝对定量和定性分析。

    03

    用开源硬件打一场冠状病毒歼灭战

    由于在短时间内还无法研发出冠状病毒特效药或疫苗,所以就全靠人类自身的免疫力(抗体细胞)来对抗冠状病毒。不过这些抗体细胞需要外部助力才行。因此,现在对抗冠状病毒的主要手段(不包括口罩,口罩不算设备)就是检测和辅助呼吸。对抗冠状病毒的第一步需要尽可能多,尽可能快地找出被感染的人,这就需要大量的检测设备,如果已经确诊,就需要考病人自己的免疫力来对抗冠状病毒了,不过在对抗冠状病毒的过程中,由于肺部细胞被冠状病毒攻击,病人可能在一定时间内部分或全部丧失呼吸能力,所以就需要辅助呼吸设备,也就是我们常说的呼吸机。因此,现在世界各国争夺的也就这两类设备:冠状病毒检测设备和呼吸机。所以本文将就这两类设备给出一些开源的解决方案,也许这些解决方案会成为那些医疗资源不足的机构和国家的新大陆。

    02
    领券