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shiny资源汇总

在造汽车之前,造辆自行车玩玩 有成就感的入门,为接下来枯燥无味的进阶积累一点点动力 快速上手 The written Shiny tutorial https://shiny.rstudio.com/tutorial...准备开始造汽车了 趁着入门刚做完有一种啥都能轻而易举掌握的自信,乘胜追击 Rstudio的shiny文档 层次分明,步骤清晰 https://shiny.rstudio.com/articles/ ?...纸上得来终觉浅,绝知此事要躬行 一些文章和书 他们也许因为软件版本的迭代,在操作环节有一点点过时 在亚马逊服务器上部署 DS4B 202A-R: Expert Shiny Developer with...开发者视频讲座 Shiny Developer Series 一个shiny例子集合 dreamRs shiny gallery js在shiny中的运用 JavaScript 4 Shiny - Field...Notes 没有shinyshiny Shiny without Shiny: RTutor in RStudio’s new Visual Markdown Mode | R-bloggers 出色的

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把你的shiny网页工具部署在云服务器

但是课题组后面很多的项目都基于这份核心种质资源,实验室成员常常需要检索分析某些基因的特定SNP,所以我在自学了一段时间的Shiny之后就尝试着搭建了一个Shiny app并利用Shiny-server部署在课题组的服务器上...,但是由于我开发的这个Shiny app本来就打开比较慢,加上很多时候服务器负荷运行,导致Shiny app打开速度就更慢了,有的时候甚至加载时间过长直接打不开。...恰巧我紧跟生信技能树推文更新,了解到可以搞个云服务器来部署Shiny应用。...购买服务器 一开始@思考问题的熊建议我利用RStudio的Shinyapp.io部署Shiny应用,看名字就知道这是RStudio专门开发的用于部署Shiny应用的一个服务器,有免费版也有企业版的,对于我来说免费版的就足够了...配置服务器 有了云服务器就能各种折腾了,我已经折腾过好几台服务器了,所以比较顺利就安装配置好了部署环境,新手的话参考生信技能树的帖子:如果有一个新的服务器你会做什么?,基本能顺利地走通。

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「R」Shiny 教程笔记

整理之前在知识星球打卡汇总的 Shiny 笔记,作为速学、速查使用和分享。 基于 https://shiny.rstudio.com/tutorial/ 视频而非文字教程写的笔记。...安装方式:install.packages("rsconnect") 文档:Shiny - Shinyapps.io - Getting started p6:Shiny Server Shiny server...: 在自己的 linux 服务器上管理和部署 shiny 的软件 Download Shiny Server - RStudio更多 shiny 内容:Shiny最后就是复习,第一部分总的下来是非常简单的...值得注意的是,虽然我们在编写 Shiny 程序时还是按照顺序的流程编写,但实际上不同的表达式对于 Shiny 本身而言是没有顺序的。 ? ? ?...p16:处理 HTML 页面 HTML 构建了 Shiny 的展示界面,所有的 Shiny 前端函数结果其实都被转换为 HTML。 ? ? ?

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「R」Rmarkdown与Shiny

一个shiny应用程序基本由两个重要部分组成:一个是Web浏览器交互的HTTP服务器,另一个是HTTP服务器交互的R会话。...下面我们写一个最小的shiny应用程序,写一个R脚本定义它的用户界面和服务器逻辑,用户界面是一个boostrapPage,它包含一个numericInput用于接收一个整数表示样本容量,一个textOutput...服务器背后的逻辑是根据输入input的样本容量n生成随机数,计算随机样本的均值,并将结果放在output中。...我们可以根据想展示给用户的参数来定义shiny应用程序的用户界面,shiny提供了丰富的输入控件: shiny_vars = ls(getNamespace("shiny")) shiny_vars[...mainPanel( plotOutput("plot", width = "100%", height = "600px") ) ) ) 接下来我们实现服务器逻辑

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手把手教你使用shiny创建一个网页工具(基于Windows

没曾想到我用Windows电脑演示,竟是一个非常困难的过程。...下载Shiny代码 GitHub地址为: https://github.com/jmzeng1314/TF_map, 选择ZIP进行下载解压缩。 ?...在shiny的应用文件夹创建一个文件夹db,然后将下面文件下载到该文件夹中。(选择一个较小的作为演示) ?...启动Shiny 在上述的准备之后,就可以在本地运行该Shiny应用。但是呢,这里还有一个坑,就是在作者的ui.R里面,作者居然还在里面给我藏了一个有趣的bug。...写在后面 目前只是基于Windows平台演示了一波一个网页工具是如何从无到有一步步建立起来的,如果是其它操作系统,大家可以自行点击阅读原文前往项目主页跟着readme自行摸索。 功成身退!

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(数据科学学习手札66)在ubuntu服务器上部署shiny

一、简介   shiny是R中专门用于开发轻量级web应用的框架,在本地写一个shiny应用并调用非常方便,但如果你希望你的shiny应用能够以远程的方式提供给更多人来使用,就需要将写好的shiny应用部署到服务器上...,主要有两种方式,第一种是将shiny应用发布在shinyapps上,第二种是将你的shiny应用部署到自己租用的服务器上,前者比较方便但遇到一些R包环境或中文显示等问题时几乎是无解的,而后者虽然麻烦,...但更为自由,且从0开始自己动手的过程又何尝不是一种极大的乐趣呢,本文就将针对在ubuntu 16.04服务器上部署shiny server的流程进行详细的说明; 二、环境配置 2.1 服务器配置说明   ...2.4 安装shinyshiny server   接下来到了最重要的地方,我们来安装shinyshiny server,首先我们在服务器上的R环境中安装shiny包: ?   ...执行下列命令来安装shiny server: sudo gdebi shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb   安装完成后访问 http://服务器公网IP:3838,这是shiny

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在我们的shiny服务器再部署个芯片下游分析网页工具

前面我们提到了在我们的shiny服务器部署一个RNA-seq下游分析网页工具,虽然说因为时间关系没办法给它写一步步教程,而且也的确类似的工具太多, 写教程的时间付出并不经济。...那我们再介绍一个shinyGEO吧,跟前面的Shiny-Seq名字很相似,应该是主攻芯片数据分析,一个是主动测序数据处理,都是基于表达矩阵的。...但是它并不提供芯片探针的ID注释,当然,缺陷实在是有点多,只能说是一个好的学习shiny网页工具制作的例子,并不算是完善的工具。...因为我是安装在自己的Ubuntu服务器里面,所以其实还蛮难的,各种报错,斗智斗勇的解决掉了。如果你不会shiny,就不用管它的部署问题。...下载源代码,一步步安装即可,log目录是 /var/log/shiny-server 只有同属于shiny组的用户才能访问,只有在需要调试代码的时候才需要去查看默认程序存放在:/srv/shiny-server

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