一、 选择适合自己的linux发行版 谈到linux的发行版本,太多了,可能谁也不能给出一个准确的数字,但是有一点是可以肯定的,linux正在变得越来越流行, 面对这么多的Linux 发行版,打算从其他系统转到linux系统来的初学者可能会感到困惑,即便是忠实的 Linux 用户也没有时间和精力去挨个尝试,因此初学者在学习linux的之前,需要有一个明确的方向,选择一个适合自己的系统开始学习linux至关重要!下面我 们就分类介绍。 1.1 初学者入门首选-redhat系列 在学习redhat系列l
一直对linux有种莫名的恐惧感,或许是对于这种不能直接眼见为实的的操作有种害怕的感觉吧。但实际操作起来后,发现和R语言的操作非常类似,并且操作中积极暗示自己这种不可怕,很简单,居然出乎意料的好用。至少,今日的操作中相比很久前自学Linux的感觉截然不同,不得不说,一定要学会Tab键,可以改变心态!
AiTechYun 编辑:nanan 如果现成的Linux发行版不会让你满意,那么为什么不自己创建呢? 从Ubuntu(一种Linux操作系统)开始之后,微软已经在Windows子系统Linux版(W
大家好,我是邓飞,数据分析离不开Linux系统,所以,如何在Linux系统中安装R语言,可以有效的避免入门数据分析,劝退力量很大。如果还有没有劝退,那就在Linux系统中安装R语言包……
如果想体验Linux环境下开发.NET Core应用,我们有多种选择。一种就是在一台物理机上安装原生的Linux,我们可以根据自身的喜好选择某种Linux Distribution,目前来说像RHEL、Ubuntu、Debian、Fedora、CentOS和SUSE这些主流的Distribution都是支持的。如果读者朋友们觉得这种方式比较麻烦,我们也可以采用虚拟机的形式安装相应的Linux Distribution,比如我经常使用的都是安装在VirtualBox上的Ubuntu。对于X64 Windows 10的用户来说,我们有了第三种更为方便快捷的选择,那就是使用Windows 10提供的Linux子系统(WSL:Windows Subsystem for Linux),目前最新版本为WSL 2。
安装Oracle可能有些人认为是一件很简单的事情,但其实是在安装的过程中蕴含着丰富的知识点,尤其安装在Linux平台,可能会碰到这样或那样各种诡异的问题,透过问题看到本质,这才是从深处理解Oracle的精髓,至少我是这样认为的,欢迎拍砖。。。
这个时候,你无需理会你的服务器的R语言版本或者R包啦,因为你每次都会 conda activate r 激活你自己的R语言环境哦。我们在这个环境里面安装了 bioconductor的 singlecelltk和singlecellsignalr,因为它们本身就会依赖大量的其它R语言包,所以理论上这个时候你的这个 conda activate r 小环境,已经是比较好的可以用来做单细胞转录组数据分析的啦!
在R语言中可以使用png()等函数生成图片,例如: png(“aa.png”)可以生成图片。
R语言在数据处理方面很是强大,然而也面临着很多的局限性。比如图像的分析处理,大数据的运算效率问题。今天我们介绍R语言和高效语言结合的一种方法:
R语言和plink软件都是常用的软件,随着对软件的熟悉,就不用自己写代码了,直接改代码了,既然改代码,就在一个环境下运行就行了,不想来回切换R和Bash。问题来了:如何在R语言中运行plink软件。
大家应该很熟悉windows下的R语言,并且也知道如何安装R包。但是呢,如果对于我们这种Linux小白很好奇那些只有在Linux下才能用的包怎么能让我们在windows下体验下呢。那么,作为神一样的R语言简直无所不能,他们开发了Rtool,这个工具不仅是为创建R包用的,同时也可以让那些以gz结尾的R包可以安装在windows环境下。今天我们就来介绍下R语言与Rtool结合后是如何玩转R包的。
R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境。 R语言由Ross Ihaka和Robert Gentleman在新西兰奥克兰大学创建,目前由R语言开发核心团队开发。
毫无疑问,处理数据的首要条件是理解数据从产生,对应到我们这个系列,也就是了解三维基因组的背景知识,如下:
这两天看到有朋友咨询 SUSE 15 SP3 安装 Oracle 19C RAC 遇到点问题,趁着周末有时间,抱着学习的心态,研究了一下如何安装,接下来就分享一下从零开始部署的流程!
我们知道R语言在作图统计方面很是实用,但是在其他游戏开发、网页制作、人工智能等很多方面相对于python是很局限。今天我们来以weblogo为例展示如何在R语言中调用python。
源码安装:配置(configure)、编译(make)、安装(make install),所有操作中间错误可以忽略,最后段末尾统一报错。 ####1.配置 configure:生成Makefile的shell脚本 文件结构如下: <文件夹> |-configure.in |-Makefile.am |-acconfig.h |-<源码文件> |-tt.c |-qq.c |-qq.h |-Makefile.am 其中configure.in作为./configure的配置输入;makefile.am通过automake生成makefile.in再由./configure生成makefile;acconfig.h由autoheader生成config.h.in再由./configure生成config.h configure.h使用autoconf和automake命令的shell脚本,可以通过autoscan自动生成或手写 acconfig.h包含了configure.in中未定义的宏 autoscan–>autoheader–>aclocal–>automake|autoconf
day01.互联网架构/Linux/YUM 一、大型互联网架构演变历程 1. 淘宝技术这10年 1.1. 淘宝现状 高并发已经成为当前互联网企业面临的巨大挑战!例如2015年“双十一”全球狂欢节正式落下帷幕,天猫最终交易额也达到了创纪录的912.17亿元!参与交易国家和地区达到232个,双十一支付宝最高峰每秒处理的交易笔数是8.59万笔,在线人数峰值达到4500万。 2009年至2016年历史销售数据: 2016年:覆盖235个国家和地区,交易额超过1207亿元! 2015年:交易额已超91
这两天看到交流群里有朋友咨询 SUSE 15 SP3 安装 Oracle 19C RAC 遇到点问题,趁着周末有时间,抱着学习的心态,研究了一下如何安装,接下来就分享一下从零开始部署的流程!
一般来说, 假如大家有一些R包安装非常困难,或者某个数据分析的流程基于了一系列R包,我们会使用conda来安装R语言及其配套的R包,比如:singlecelltk和singlecellsignalr,很简单的几句话代码,主要是安装适合自己用户的R语言环境及相关的R包:
R语言的工作空间其实就是你当下R语言的工作环境,它包括任何你已经定义了的对象。当一个R进程结束时,用户可以将当前的工作空间保存下来,在下次启动R时就会自动加载,非常方便省事。R语言是一个交互式界面,上翻和下翻键可以用来查看历史指令。这里我建议大家使用RStudio,因为RStudio提供非常强大的R语言高度可视化操作界面,你可以在RStudio里写R代码,也可以写Python代码,同时可以使用Rmarkdown来写自己的文档。
作者:NSS 翻译:杨金鸿 术语校对:韩海畴 全文校对:林亦霖 本文约3000字,建议阅读7分钟。 本文为带大家了解R语言以及分段式的步骤教程! 人们学习R语言时普遍存在缺乏系统学习方法的问题。学习者不知道从哪开始,如何进行,选择什么学习资源。虽然网络上有许多不错的免费学习资源,然而它们多过了头,反而会让人挑花了眼。 为了构建R语言学习方法,我们在Vidhya和DataCamp中选一组综合资源,帮您从头学习R语言。这套学习方法对于数据科学或R语言的初学者会很有用;如果读者是R语言的老用户,则会由本文了解
今天是我们的系统教程《R语言从入门到精通》的第一讲,前面的背景讲解中《从今天开始,每天学点R语言~》,已经深入探讨过R语言的重要性以及学习R语言的必要性,今天我们就按照课表来讲解:如何在自己的PC中安装R语言的运行环境。还没有领取《学习R》书籍教材的同学,赶紧联系文末的客服小姐姐吧~
我们今天给大家介绍一个通过人类肿瘤的进化条件所选择的事件介绍。其只设计了Linux下的版本所以我们如果需要安装在windows下还是需要利用devtools进行编译安装。当然,其依赖的包还是需要我们自己去安装。那么我们看下其流程吧。
下载地址为:https://cran.r-project.org 进入链接,如下图所示,在页面顶部提供了三个下载链接,分别对应三种操作系统:Windows、Mac和Linux。请选择自己操作系统对应的链接。
但是最近频繁看到粉丝留言表明安装clusterProfiler包失败,这个clusterProfiler是大名鼎鼎的Y叔开发,基本上是每个做生物信息学数据分析的人都会使用它的,做超几何分布检验(富集分析),而且内置了很多数据库,好用的函数。
运行最后library代码,报错提示缺啥就安装啥,安装方法有 BiocManager::install('xx') 或 install.packages('xx'),逐一尝试,没有明显的 ERROR 关键词就不要管。
深感遗憾,我以前的教程还特意选择了他,比如下面的安装最新版R语言: sudo vi /etc/apt/sources.list# deb http://mirrors.xmu.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu/ xenial/sudo apt-get updatesudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E084DAB9sudo apt-get updatesudo apt-get in
Rstudio我的理解更像是服务器的Xshell端 可以更方便的看懂你的代码以及输出的数据运行情况等
引言: R语言是一种非常强大的分析与展示的统计科学家工具,其也提供了若干关于自然语言的分析处理工具,本文讲展示如何在Linux进行安置。 1. 自然语言处理(NLP) 对于英语体系,基于空格可以直接进行分词,而中文则不同,需要进行分词,然后进行后续处理。NLP是natural language processing的缩写,专指此类的工作。 自然语言处理包: Snowball, RWeka 文本挖掘: tm 分词工具: Rwordseg 2. 所属环境 Linux: c
引言: R语言是一种非常强大的分析与展示的统计科学家工具,其也提供了若干关于自然语言的分析处理工具,本文讲展示如何在Linux进行安置。
🎬 鸽芷咕:个人主页 🔥 个人专栏:《C语言初阶篇》 《C语言进阶篇》
我发现Linux系统在启动过程中会出现一些故障,导致系统无法正常启动,我在这里写了几个应用单用户模式、GRUB命令操作、Linux救援模式的故障修复案例帮助大家了解此类问题的解决。
R:为什么选择我?而不是其他高级语言,比如Python,Java,C,C++....那么多编程语言?
如果是想通过培训掌握生物信息学,那么可以参考:彻底入门生物信息学,可能需要12天! 推文介绍的。
sudo zypper install gcc-c++ automake make libcurl-devel libxml2-devel openssl-devel pkg-config
国庆和中秋放假回来后,相信或多或少你的Linux服务器都会遇到一些问题,为了帮助大家回来后在遇到问题时找到合适的解题思路,特地给大家找到了一个Linux运维工程师发现故障和处理故障的反思,希望给到大家一些指明方向的引导。 我发现Linux系统在启动过程中会出现一些故障,导致系统无法正常启动,我在这里写了几个应用单用户模式、GRUB命令操作、Linux救援模式的故障修复案例帮助大家了解此类问题的解决。 (一)单用户模式 Linux系统提供了单用户模式(类似Windows安全模式),可以在最小环境中进行系统
见Y叔的网络在线书籍《clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study》的 Chapter 12 Visualization of Functional Enrichment Result , 自己简单搜索就可以直达这个在线书籍的链接:
rpm安装包通常为二进制包(Binary)以及源代码包(Source)两种形式。在使用源码方式安装MySQL的时候,官方网站上下载的源码包通常为scr.rpm格式,而不是直接的tar包,对此,需要先使用rpm命令先安装源码后在进行编译安装,本文是对该方式的描述。
写在前面: 在如何通过Google来使用ggplot2可视化这篇文章中,我们曾经介绍过R语言在生物信息学中的重要性。 这篇文章也激发了很多小伙伴学习的热情。学习R语言必然会安装各种各样的包,很多人在这一步就遇到了困难, 刚开始学习R语言的时候我们经常会遇到各种包安装错误,比如 package ‘airway’ is not available(for R version 3.1.0)等等, 这篇文章我们就来系统性地整理一些新手可能遇到的问题以及解决方案。 当然,你不一定现在就会遇到,但是如果你遇到了,请记住
R语言作为统计学一门语言,一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发,R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入,R语言的社区在迅速扩大成长。现在已不仅仅是统计领域,教
-bash: zip: command not found 是因为liunx服务器上没有安装zip命令,需要安装一下即可 linux安装zip命令: apt-get install zip 或yum install zip linux安装unzip命令: apt-get install unzip 或yum install unzip ——-本目录下的所有文件(含子目录)压缩为osafuzhuang.zip zip -r osafuzhuang.zip ./*
安装是可以的,但是安全的安装是值的推荐的,所谓安全的安装,就是不和系统已有的R语言和R包有冲突,不能把现有的系统搞崩了……
然后下一步,选择自定义安装,打钩核心组件,vix,默认配置,https端口443,取消启动时检查产品更新
不满意Jupyter Notebook只有Python 2环境,还打算让它支持Python 3与R?没问题,本文一步步帮助你实现这个愿望。
简单介绍 Linux 容器是一种轻量级“虚拟化”方法,用于在单个控制主机上同一时候执行多个虚拟装置(容器)。还有一个可用来描写叙述 Linux 容器所执行的操作的术语是“容器化”。 Linux 容器提供操作系统级别的虚拟化,当中的内核控制隔离的容器。容器通过内核控制组 (cgroup) 和内核命名空间进行隔离。通过 Xen 和 KVM 等其它完整虚拟化解决方式,虚拟化子系统可模拟完整的硬件环境。
最近开始学习R语言,把学习笔记和小伙伴们分享一下吧,欢迎一起交流 R 起源: R是S语言的一种实现。S语言是由 AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析、作图的解释型语言。最初S语言的实
MySQL数据库的集中化运维,可以通过在一台MySQL数据库服务器上,部署多个MySQL实例。该功能是通过mysqld_multi来实现。mysqld_multi用于管理多个mysqld的服务进程,这些mysqld服务进程程序可以用不同的socket或是监听于不同的端口,同时将数据文件分布到不同的磁盘以分散IO。mysqld_multi提供简单的命令用于启动,关闭和报告所管理的服务器的状态。从而减少生产环境的维护成本,方便后续的迁移和清理等工作,借助多实例绑定的方式提高服务器的整体资源利用率.对于多实例的配置有2种方式,一种是在my.cnf为所有实例提供配置,一种是使用每一个实例一个配置文件。本文主要描述第二种方式。 第一种多实例配置方式请参考:MySQL多实例配置(一) 有关MySQL单实例的安装请参考:Linux 下MySQL源码安装完整版
今天开始试着安装SAP S/4HANA 2020版本,也是目前SAP ERP最高的版本,总安装文件大小大概50GB,数据库版本必须是HANA2.0 SPS05以上,操作系统SUSE必须是15.1版本。
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。简单来说,R是一门统计计算语言,是一套开源的数据分析解决方案。
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