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day4 呦呦鹿鸣——R for data science阅读笔记之ggplot()

使用 ggplot2 可视化单个变量分布&两个多个变量之间关系。...)——在相似条件下进行一组测量值,包含不同变量多个表格数据:一组与相应变量和观测相关联变量:所有企鹅属性观察:单个企鹅所有属性tibbles:tidyverse特殊数据框查看数据框...fct_infreq() :按每个级别的观测数(最大在前)fct_inseq():按级别数值数值变量数值变量可以是连续,也可以是离散。...需要摸索找到最适宜geom_bar(color = "red")——边框变红geom_bar(fill = "red")——填色变红Visualizing relationships可视化两个多个变量之间关系数值变量...)平滑曲线geom_smooth()三个更多变量用不同颜色和形状代表不同观测将绘图拆分为不同 按单个变量对绘图进行分面facet_wrap() 参数1:公式?

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R基础知识及快速检阅你数据

A: #安装一个包 install.packages('ggplot2') #安装多个包 install.packages('ggplot2','tidyverse') #安装时,依赖包也会被安装...) 2.使用ggplot2绘制条形 #变量频数表,使用BOD数据,时间为x,demand为y,使用geom_col()函数 ggplot(BOD,aes(x=BOD$Time,Y=BOD$demand...))+geom_col() #将x转化为因子型向量从而使系统视其为离散 ggplot(BOD,aes(x=factor(Time),Y=BOD$demand))+geom_col() #变量频数表...#当为plot传递两个变量x,y,且x为因子变量则默认绘制箱型 head(ToothGrowth) len supp dose 1 4.2 VC 0.5 2 11.5 VC 0.5...,如下: 了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子) 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表) 文件读取和写出 简单统计可视化 无限量函数学习

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手把手教你R语言方差分析ANOVA

在R语言中,实现方差分析主要涉及到以下步骤:数据导入数据清洗ANOVA计算结果解析ANOVA评估首先,你需要一个数据集,其中包含至少一个分类变量(通常是因子类型)和一个多个数值变量。...这些数值变量是你要分析目标,而分类变量则用于将数据分成不同组。...()等函数)进行变量选择(使用子集选择dplyr包select()函数)。...这个函数需要一个公式,该公式描述了你要分析数值变量和分类变量之间关系。...函数TukeyHSD(one.way)该结果给出每个两组之间结果;diff: 两组均值之差;Lwr, upr: 95%置信区间下限和上限(默认) ;P adj: 多次比较调整后P

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基于 mlr 包逻辑回归算法介绍与实践(上)

画作类别与铜含量直线关系 x 轴表示铜含量,y 轴显示分类类别,就像是一个连续变量一样,赝品和真品分别取 0 和 1 。y = 0.5 处红色虚线表示分类阈值。...另外,随着铜含量增加,是真品概率趋近于 1,相反,随着铜含量减少,是真品概率趋近于 0。 上文所介绍内容中,只有一个预测变量——铜含量,但是如果我们有多个预测变量应该如何进行呢?...此外,线性关系意味着当我们有多个预测变量时,我们可以将它们贡献加到 log odds 中,根据所有预测变量信息,得到一幅画是真品 log odds。...: PassengerId: 每个乘客都有一个独特任意数字。...(feature selection) 2.2.1 转换为因子 (converting to factors) 每个变量都应该被视为一个因子,因为它们代表了在整个数据集中重复出现不同情况之间离散差异

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Day4:R语言课程(向量和因子取子集)

`summary()`:详细显示,包括描述性统计,频率 `head()`:将打印变量开始条目 `tail()`:将打印变量结束条目 向量和因子变量: `length()`:返回向量因子元素数...(1)向量 选择使用索引 从向量中提取一个多个,可以使用方括号[ ]语法提供一个多个索引。索引表示一个向量中元素数目(桶中隔室编号)。R索引从1开始。...向量索引 提取这个向量第五个,使用以下语法: age[5] 提取除了这个向量第五个之外所有,使用: age[-5] 如果我们想要选择多个元素,我们仍然会使用方括号语法,但不是使用单个,...仍以age向量为例: age 想知道age向量中每个元素是否大于50,可以使用: age > 50 返回是具有与age相同长度逻辑向量,其中TRUE和FALSE指示向量中每个元素是否大于...如前所述,expression因子级别按字母顺序分配整数,高= 1,低= 2,中等= 3。

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R for data science (第一章)①Chapter1 使用ggplot2进行数据可视化

它还告诉您tidyverse哪些函数与基本R(您可能已加载其他包)中函数冲突。...您可以通过向ggplot()添加一个多个图层来完成图表。函数geom_point()为绘图添加一层点,从而创建散点图。 ggplot2附带了许多geom函数,每个函数都为绘图添加了不同类型图层。...在这里,我们更改点大小,形状和颜色级别,使点变小,三角形蓝色: ? 您可以通过将绘图中aesthetic映射到数据集中变量来传达有关数据信息。...要将aesthetic映射到变量,请将aesthetic名称与aes()中变量名称相关联。 ggplot2将自动为变量每个唯一分配唯一级别(这里是一种独特颜色),这个过程称为缩放。...ggplot2还将添加一个图例,说明哪些级别对应于哪些。 颜色显示许多不寻常点是双座汽车。这些车似乎不像混合动力车,实际上是跑车!

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数据处理基础—什么是整齐数据和Rich Data

5.6.1 什么是整齐数据? 整齐数据是Hadley Wickham (Wickham 2014)主要定义概念。整齐数据具有以下三个特征: 每个变量都有自己列。 每个观察都有自己行。...每个都有自己单元格。...您应该将包含多个变量名称传递给key,并将包含多个变量名称传递给value。...gather()获取名称是列,key和valueas为两个参数。这次key是变量名称,其为列名,而value是名称,其分布在多个列上。...例如,计数除以以单位为中心特定于细胞大小因子。 logcounts:日志转换计数类似计数。在大多数情况下,这将被定义为对数转换范数,例如,使用log base 2和伪计数1。

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独家 | 一文读懂R中探索性数据分析(附R代码)

在这篇文章中,我们将回顾一些我们在案例分析中使用功能: 第1步:取得并了解数据; 第2步:分析分类变量; 第3步:分析数值变量; 第4步:同时分析数值和分类变量。...基本EDA中一些关键点: 数据类型 异常值 缺失 数值和分类变量分布(数字和图形形式) 分析结果类型 结果有两种类型:信息型操作型。...有含有很多零变量吗? 有高基数变量吗?...函数自动统计数据集中所有因子字符变量: freq(data) ## thal frequency percentage cumulative_perc ## 1 3...这对于处理高基数变量(如邮政编码)非常有用。 将图表以jpeg格式保存到当前目录中: freq(data, path_out = ".") 分类变量所有类别都有意义吗? 有很多缺失吗?

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能「看到」张量运算:​因子可视化

尽管我最初是在模型和消息传递语境中遇到因子,但我很快就意识到它们体现了一种更通用和更简单概念。在这篇文章中,我将主要在高层面介绍因子,而不会涉及模型消息传递等算法具体细节。...这篇文章更详细地介绍了 einsum,并给出了一些很好示例:http://ajcr.net/Basic-guide-to-einsum/ 因子 带有多个不同大小张量和-积表达式也被称为张量网络。...这个有两种节点——因子变量 我们将用方框表示因子,用圆圈表示变量 因子对应张量 (A,B,C) 变量对应索引 (i,j,k) 边仅出现在方框和圆圈之间 边规则很简单——每个因子都连接其每个索引。...我们通过加黑图中对应变量节点来表示它。 上面动画最后一部分给出了一个重要直觉观察: 每个因子都有一个完全收缩状态——爱因斯坦求和右侧(示例中 2 维张量 D)。...因此最终结果大小是各个因子总大小积,这会大很多。最终积每个元素都只是两个数值相乘结果,所以乘法总数量就是最终积项总数。这也很容易可视化: ?

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R语言混合效应逻辑回归(mixed effects logistic)模型分析肺癌数据|附代码数据

因为住院时间是以天为单位,我们可以用气泡来研究癌症阶段与它关系。每个气泡面积与具有这些数值观察数量成正比。对于连续预测因子,我们使用小提琴。所有的原始数据都按癌症阶段分开显示。...我们将小提琴绘制在具有透明度抖动点之上,这样就可以看到原始数据。因为IL6和CRP都有偏斜分布倾向,所以我们在Y轴上使用了平方根刻度。...Wald检验,(frac{Estimate}{SE}),依赖于渐进理论,这里指的是当最高级别的单位大小收敛到无穷大时,这些检验将呈正态分布,并由此得出p(鉴于真实估计为0,获得观察估计更极端概率...然后我们计算:这些是所有不同线性预测因子。最后,我们采取,这就得到 ,这是原始尺度上条件期望,在我们例子中是概率。然后我们可以取每个期望,并将其与我们感兴趣预测因子作对比。...  }) # 获得每个级别的癌症阶段所有j平均值和四分位数 lapply( probs, function(X) {     c(M=mean(x), quantile(x, c(.25, .75

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R语言混合效应逻辑回归(mixed effects logistic)模型分析肺癌数据|附代码数据

因为住院时间是以天为单位,我们可以用气泡来研究癌症阶段与它关系。每个气泡面积与具有这些数值观察数量成正比。对于连续预测因子,我们使用小提琴。所有的原始数据都按癌症阶段分开显示。...小提琴只是围绕绘图轴反映核密度。我们将小提琴绘制在具有透明度抖动点之上,这样就可以看到原始数据。因为IL6和CRP都有偏斜分布倾向,所以我们在Y轴上使用了平方根刻度。...Wald检验,(frac{Estimate}{SE}),依赖于渐进理论,这里指的是当最高级别的单位大小收敛到无穷大时,这些检验将呈正态分布,并由此得出p(鉴于真实估计为0,获得观察估计更极端概率...然后我们计算:这些是所有不同线性预测因子。最后,我们采取,这就得到 ,这是原始尺度上条件期望,在我们例子中是概率。然后我们可以取每个期望,并将其与我们感兴趣预测因子作对比。...  })# 获得每个级别的癌症阶段所有j平均值和四分位数 lapply( probs, function(X) {    c(M=mean(x), quantile(x, c(.25, .75))

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一份简短又全面的数学建模技能图谱:常用模型&算法总结

【4】匹配问题: 匈牙利算法 、最优指派、相等子、库恩—曼克莱斯 (Kuhn-Munkres) 算法: 用于解决【人员分派问题】:给n个工作人员分配不同n件工作,每个人都适合做其中一件几件,那么请问是否每人都有一份合适工作...Hamilton 就是从一顶点出发【每个顶点】恰通过一次能回到出发点那种。【旅行商问题描述】一名推销员准备前往若干城市推销产品,然后回到他出发地。...,而实际决策中,衡量方案优劣考虑多个目标;这些目标中,有主要,也有次要;有最大,也有最小;有定量, 也有定性;有相互补充,也有相互对立…..求解目标规划可用序贯式算法。...,并研究用 一组变量(常称为自变量预测变量)去预测另一组变量(常称为因变量响应变量);是一种多对多线性回归建模,特别当两组变量个数很多,且都存在多重相关性,而观测数据数量(样本量)又较少时,用偏最小二乘回归建立模型具有传统经典回归分析等方法所没有的优点...在描述数据集中样本时,样本又叫作实例、观测,样本可以由多个属性来描述,这些又可以称为特征、指标、变量、维度,比如描述某企业员工信息时,数据集就是所有员工信息,每个员工就是一个样本,用来描述样本信息性别

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数据科学人才: 如何顺藤摸瓜提高你竞争力

因子分析是个数据精简技术,当你数据集中有很多很多变量,希望适当减少变量个数时候使用。通常,因子分析检查多个变量统计关系(比如,相关性),并尝试用较少变量因子)来呈现和解释这些相关性。...因子矩阵元素代表各个变量和潜在因子之间回归系数(如相关系数)。这些元素(因子载荷)代表了变量和各个潜在因子之间关系强度。因子分析结果将告诉我们两件事情: 1. 因子个数 2....为此,我有几个借助特征来决定因子个数(因子分析输出结果)经验法则。特征代表了每个因子计算出公共方差所占百分比。...此外,为了使读者能在三维角度来看这张,我将点与面相连,平面上点代表了空间点z。 ? 你可以看到这25个数据科学技能是怎样聚集成三个不同群体每个群体代表了一个技能领域。...有少数技能在多个因子中有高输入,这些技能通过多种色彩表示出来了,包括产品设计(有较高商业和技术/编程输入),数据管理(有较高技术/编程和数学/统计输入),自然语言处理和文本挖掘(有较高技术

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生信技能树七天学习小组 Day4笔记——R语言基础

1.1准备工作ggplot2是tidyverse一个核心R包,首先需要加载tidyverselibrary(tidyverse)此处用到内置数据mpg(mpg是一个数据框)复习数据框概念:变量(列)...1.5 分面将分割成多个分面1.5.1 通过单个变量进行分面facet_wrap()后面跟是离散型变量ggplot(data = mpg) + geom\_point(mapping = aes...空白单元代表没有drv和cyl对应组合(3)以下代码会绘制出什么?“.”作用是什么?...1.6.2 几何对象函数geom_point()geom_smooth()ggplot2中每个几何对象函数都有一个mapping参数同一张图中可以放置多个几何对象ggplot(data = mpg)+...(statistical transformation, stat):绘图时用来计算新数据算法stat_count()可以替换geom_bar()每个几何对象函数都有一个默认统计变换每个统计变换函数都有一个默认几何对象

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金融工程高度概览

整个流程分为 6 大模块,除了开始“数据参数”模块,后 5 个模块都有相对应函数。.... -- Elon Musk 变量指的是金融市场基础变量 (fundamental variable),常见变量包括 折现因子(discount factor) 零息债价格(zero-coupon...核心理念就是从市场已有的标准点对应变量内插外插出非标准点对应变量。 下面我们来看两个例子是如何生成零息债价格和波动率。...如果欧式期权在某个复杂模型有解析解数值积分解,那么会大大提高模型校正效率,因此我们会不遗余力推导出解析解数值积分解。...) 漂移项插 (drift interpolation) 参数平均 (parameter averaging) 但是解析数值积分并不是万金油 比如计算百慕大 (Bermudan) 期权或者亚式一篮子

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新书《R语言编程—基于tidyverse》信息汇总

希望我这本书,如果有幸进入了您法眼,能让您学到正确编程思想,学到最新 R 语言编程知识和编程思维,能真正让您完成 R 语言入门 R 知识汰旧换新。...我写东西特点就是,每个知识点都搜集很多相关最新资料,自己先学得透彻明白,再把自己理解用最通俗易懂语言表达出来。看过我知乎专栏文章的人,应当对此有所体会。 3....同样是讲 R 基本语法,本书不同之处在于,用tidyverse中更一致、更好用相应包加以代替:用tibble代替data.frame、用forcats包处理因子,用stringr讲字符串 (及正则表达式...、输出;接着介绍图形从功能上分类:类别比较、数据关系、数据分布、时间序列、局部整体、地理空间,对每一类图形分别选择其中代表性用实例加以演示。.../连续变量离散化)、基于PCA特征降维; (3) 探索变量关系,包括分类变量之间、分类变量与连续变量、连续变量之间关系。

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R语言入门系列之二

: 缺失是无法进行比较运算,很多函数都有参数na.rm选项来移除缺失,如下所示: 可以使用函数na.omit()来移除变量中缺失矩阵、数据框含有缺失行,如下所示: ②日期 在R中,...数据转换仅仅是对数据中每个观察独立处理,而标准化则涉及到数值之间处理。...(可以通过breaks参数来设置),然后统计随机变量每个范围内数量或者比例,从而展示数据结构信息。...②箱型 对于双变量其中一个为因子变量或者分组变量,可以采用boxplot()箱型来展示不同小组变量数据分布,如下所示: attach(mtcars) boxplot(mpg~cyl, xlab="...ggplot2不能识别矩阵,所有分组信息也必须转换为因子变量组成数据框。由于数据框存储数据量要远大于矩阵,因此ggplot2可以做出信息含量更加丰富图形。

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温故而知新,ggplot2 饼几点笔记

coord_polar coord_polar() 是 ggplot2 中极坐标函数,它可以弯曲横纵坐标,使用这个函数做出蜘蛛效果。...对于堆叠柱状 g,把 y 按照比例划分弧度,因此它们弧度比等于各自 y 比例。...为了确定数据填充先后,同时方便在不同区域上填写上对应数据大小,所以会先去创建有序因子,从而使数据列 dat$Num 自然顺序和因子顺序在一定程度上一致(一致同向对应反向对应)。...1:12, nrow = 3)) [1] 1 3 6 10 15 21 28 36 45 55 66 78 # 对数据框求和,返回结果仍然是数据框,cumsum 会对对每个变量进行求和处理...,不过因子顺序和数据 dat$Num 对应关系是正向对应或者反向对应,会影响相关区块中心位置计算方式,从而影响 geom_text 中文字定位。

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