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vasp-vtst过渡态计算过程

——课题组概况 vasp-vtst计算过渡态 1935年,Eyring,Evans和Polanyi在统计热力学和量子力学的基础上提出了过渡态理论,可以通过基本物性(分子震动频率、质量、核间距等)计算反应速率常数...NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG...#通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3...#specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does...not move the ions; 这里其实是抛弃VASP自带的优化,选用vtst的优化方法; IOPT=1 #LBFGS = Limited-memory Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno

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Python量子力学计算模拟以及数据可视化

VASPy是一个纯Python编写的处理VASP文件数据以及进行数据快速可视化的,基于OOP的思想提供了操作VASP文件的友好的接口,可以帮助使用者快速编写处理VASP相关文件的脚本,以提升效率。...VASP简介 对于广大做计算化学或者材料模拟的同学肯定听说过VASP的大名或者其科学研究与其息息相关。...(http://www.vasp.at/) VASPy项目简介 VASPy的思想是将VASP相关的文件都视为可操作的对象,通过友好的接口对一个或者多个VASP对象进行快速的操作以提升工作效率。...安装 VASPy已上传至PyPI可以通过pip来进行安装: $ pip install vaspy 从源码安装: $ git clone git@github.com:PytLab/VASPy.git...类可以抽取文件中的晶格结构信息并结合VASP相关的类进行VASP文件的创建,同样可以方便的讲VASP的文件生成相应的用Material Studio可以显示的文件包括讲XDATCAR生成相应的*.arc

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    哪些领域将成为下半年的监管关注重点?

    该报告的发布标志着 FATF 于 2019 年首次发布的《加密资产和加密资产服务提供商(VASP)指南》已经经历了三个年头。...所以为了应对 DeFi 日益增加的风险,VASP 和金融机构应确保他们使用区块链分析功能来检测与 DeFi 混币器和跨链桥相关的风险。...作为核心,旅行规则要求 VASP 识别超过一定金额的交易的发起人和受益人,并将信息和数据安全的传输给其 VASP 交易对手。该规则的目的是帮助执法部门发现、调查加密资产领域的洗钱和其他金融犯罪。...FATF 的《最新报告》对未实施“旅行规则”的成员国和 VASP 提出了严厉警告——各国应根据 FATF 标准对 VASP 施加信息和数据共享要求。...跨链 DeFi、非托管钱包、NFT 和旅行规则合规性将是 VASP 合规团队的首要问题。

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    使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

    install -c anaconda pip conda install -c anaconda numpy conda install -c conda-forge pmw 来安装相关的python,...4.2 VASP计算单晶硅的振动分析 在对VASP计算的振动分析进行可视化之前,我们需要振动计算后得到的OUTCAR和CONTCAR文件 (见PyVibMS-master/examples/VASP/original-data...然后我们把OUTCAR文件复制一份出来并给它一个.out的后缀,接着将CONTCAR的内容插入到这个.out文件的第一行(见PyVibMS-master/examples/VASP/Si_OUTCAR.out...在打开PyVibMS插件窗口后,点击Input File这一行中三个点(...)的按钮,然后选定 PyVibMS-master/examples/VASP/Si_OUTCAR.out文件,将文件类型调整为...接着,回到PyVibMS界面后,将文件类型XYZ调成VASP 5.x。因为这个VASP输出文件既包含了PBC盒子的信息,又包含了振动模式的信息,我们勾选 Has PBC 和 Has Vib.

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    、拖、洗

    概念 撞是黑客通过收集互联网已经泄露的用户和密码信息,生成对应的字典表,尝试批量登录其它网站后,得到一系列可以登录的用户。...很多用户在不同网站使用的是相同的账号密码,因此黑客可以通过获取用户在A网站的账户从而尝试登录B网站,这就可以理解为撞攻击 防护 撞可采用大数据安全技术来防护,比如:用数据资产梳理发现敏感目录,使用数据加密保护核心数据...,使用数据安全运维防运维人员撞攻击等 拖 概念 拖是指黑客侵入有价值的网络站点,把注册用户的资料数据全部盗走的行为,因为谐音,经常被称为脱裤 洗 概念 在取得大量的用户数据之后,黑客会通过一系列的技术手段和黑色产业链将有价值的用户数据变现...,这也通常被称作‘洗’ 最后黑客将得到的数据在其它网站上尝试登录,叫做撞,很多用户喜欢使用统一的用户名密码,‘撞’也可以使黑客收获颇丰 撞常见姿势 使用ssh登录到服务器中 ssh username

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    Linux共享、静态、动态详解

    1、静态函数,是在程序执行前就加入到目标程序中去了 ; 2、动态函数同共享函数是一个东西(在linux上叫共享对象, 文件后缀是.so ,windows上叫动态加载函数, 文件后缀是.dll)...共享函数 共享函数中的函数是在当一个可执行程序在启动的时候被加载。如果一个共享函数正常安装,所有的程序在重新运行的时候都可以自动加载最新的函数中的函数。...不兼容的函数 如果一个新版的函数要和老版本的二进制的不兼容,则soname需要改变。...共享是程序启动时加载的。...这是加载所有其他。 libc.so.N(N为6以上)。这是C。即使是其他语言也倾向于使用C(至少要实现自己的),所以大多数程序至少包括这个

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    iOS 静态&动态

    iOS下的存在形式 静态:.a和.framework 动态:.dylib和.framework(系统提供给我们的framework都是动态!)...WWDC2014(iOS8)以后,苹果允许开发者自行开发动态。...lipo create or operate on universal files,此命令主要是帮你查看或者创建支持多平台的静态的。比如将两台不同平台的静态进行合并。...调用的时候肯定会出现如下unrecognized selector sent to class错误提示,这时要设置other linker flag,生成静态和调用静态的工程都加上-all_load...---- 2019年11月14日更新 framework跟.a的区别 .a是多个目标文件.o的集合,它在生成的时候只需要所依赖静态的头文件,不需要具体的实现,所以最终用的时候需要链接依赖的静态,这可能会出现

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    动态与静态

    本文目标: ⭐认识动态静态,学会结合gcc选项,制作动静态⭐ ⭐了解动态加载过程⭐ 的一些概念: 静态(.a):程序在编译链接的时候把的代码链接到可执行文件中。...程序运行的时候将不再需要静态。 动态(.so):程序在运行的时候才去链接动态的代码,多个程序共享使用的代码。...因此,gcc默认动态,是建议的意思,对于一个指定的,是动态还是静态,取决于我们使用的的什么。如果在使用的若跟个库里面,只要有一个是动态,那么,这个可执行程序就是动态链接的!...使用者角度:在使用第三方的时候,需要-L带上的路径,-I头文件的路径和-l的名称,注意的名称是去掉lib和后缀之后的。不建议将自己写的第三方安装到系统中。...动态 站在制作者的角度:生成动态 动态也是,跟静态差不多,也是.o文件归档,带上相应的头文件。其中的区别就是多加了一个选项:-fPIC。

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