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vasp-vtst过渡态计算过程

——课题组概况 vasp-vtst计算过渡态 1935年,Eyring,Evans和Polanyi在统计热力学和量子力学的基础上提出了过渡态理论,可以通过基本物性(分子震动频率、质量、核间距等)计算反应速率常数...NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG...#通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3...#specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does...not move the ions; 这里其实是抛弃VASP自带的优化,选用vtst的优化方法; IOPT=1 #LBFGS = Limited-memory Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno

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【Node.js】npm与【万字教学~详细】

作者主页: 作者主页查看更多前端教学 专栏分享:css重难点教学 Node.js教学 从头开始学习 目录         什么是         的来源         为什么需要        ...删除已发布的 ----         什么是 Node.js中的第三方模块又叫做,指的是同一种东西,知识叫法不同         的来源 不同于Node.js的内置模块与自定义模块,是由第三方个人或团队开发出来的...目录中的,都是项目。...全局 在执行npm install 命令时,如果提供-g参数,则会把安装为全局。...注意:在登录npm,发布之前要将下载地址修改为npm官网地址,否则发布会失败。

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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

下面是各个操作系统下PyMOL的安装方法: A)商业版 前往 https://pymol.org/2/ 下载适合你的PyMOL安装,Windows和Mac系统下都很好操作,说一下Linux的情况。...我们把这个压缩解压,得到一个名为PyVibMS-master的文件夹。...4.2 VASP计算单晶硅的振动分析 在对VASP计算的振动分析进行可视化之前,我们需要振动计算后得到的OUTCAR和CONTCAR文件 (见PyVibMS-master/examples/VASP/original-data...如果想知道这两个硅原子和其他硅原子的相对运动,可以点击 Make Supercell 来建立胞结构。在胞结构中,中心元胞以外的原子会以小一号的球显示。 ?...通过和4.2节类似的操作,我们可以显示原胞和胞下的振动。 ?

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详细抓神器之tcpdump

简介 tcpdump 是一款强大的网络抓包工具,它使用 libpcap 库来抓取网络数据,这个库在几乎在所有的 Linux/Unix 中都有。...默认情况下使用 tcpdump 抓时,会让网络接口进入混杂模式。一般计算机网卡都工作在非混杂模式下,此时网卡只接受来自网络端口的目的地址指向自己的数据。...这些选择数据的语句就是过滤器(filter)! Host过滤器 Host 过滤器用来过滤某个主机的数据报文。...通过排除 echo 和 reply 类型的数据使抓取到的数据不包括标准的 ping : $ tcpdump 'icmp[icmptype] !...抓取 80 端口的 HTTP 有效数据,排除 TCP 连接建立过程的数据(SYN / FIN / ACK) $ tcpdump 'tcp port 80 and (((ip[2:2] - ((ip[

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Python量子力学计算模拟以及数据可视化

VASPy是一个纯Python编写的处理VASP文件数据以及进行数据快速可视化的库,基于OOP的思想提供了操作VASP文件的友好的接口,可以帮助使用者快速编写处理VASP相关文件的脚本,以提升效率。...VASP简介 对于广大做计算化学或者材料模拟的同学肯定听说过VASP的大名或者其科学研究与其息息相关。...VASP的全称是Vienna Ab-initio Simulation Package,是维也纳大学Hafner课题组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟的软件,目前是材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商业软件之一...(http://www.vasp.at/) VASPy项目简介 VASPy的思想是将VASP相关的文件都视为可操作的对象,通过友好的接口对一个或者多个VASP对象进行快速的操作以提升工作效率。...vaspy 从源码安装: $ git clone git@github.com:PytLab/VASPy.git $ cd vaspy $ python setup.py install VASPy的文件结构

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性感的React Hooks(二)再谈闭

曾经我去找工作面试的时候,我最讨厌别人问我闭,因为我说不清楚。现在我面试别人了,却又最爱问闭,因为闭真的能直接的检验你对JS的理解深度。可能够回答上来的人真的很少。...就以我和PP同学在面试过程中的对话为引子,对话内容大概如下: 我:能聊聊你对闭的理解吗 PP:函数执行时访问上层作用域的变量,就能形成闭,闭可以持久化保持变量。 我:还有其他的吗?...许多地方喜欢用词法环境,或者词法作用域来定义闭的概念,但是闭是代码执行过程中才会产生的特殊对象,因此我认为使用执行上下文更为准确。当然,这并不影响闭的理解与使用。...根据闭的生成条件与实践场景,我们会发现,模块中,非常容易生成闭。...,闭就会产生。

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详细的网络抓神器 Tcpdump 使用指南

tcpdump 是一款强大的网络抓包工具,它使用 libpcap 库来抓取网络数据,这个库在几乎在所有的 Linux/Unix 中都有。...默认情况下使用 tcpdump 抓时,会让网络接口进入混杂模式。一般计算机网卡都工作在非混杂模式下,此时网卡只接受来自网络端口的目的地址指向自己的数据。...这些选择数据的语句就是过滤器(filter)! Host 过滤器 Host 过滤器用来过滤某个主机的数据报文。...通过排除 echo 和 reply 类型的数据使抓取到的数据不包括标准的 ping : $ tcpdump 'icmp[icmptype] !...抓取 80 端口的 HTTP 有效数据,排除 TCP 连接建立过程的数据(SYN / FIN / ACK): $ tcpdump 'tcp port 80 and (((ip[2:2] - ((ip

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Android获取、更改名的小技巧分享(实用)

前言 小菜因为工作需要,经常需要一套代码修改很多次名,虽然不是什么技术活,但是小菜的用的次数多了就有了一点点小技巧分享给大家,下面话不多说了,来一起看看详细的介绍吧。 方法如下: 1....如果源码是在本机电脑中,首先找到源码多位置,例如:由名 com.aaa.bbb 修改为名 com.ccc.ddd,可以直接重命名,本地修改; 2....把 build.gradle 中 appicationId 替换为新的名; ? 5. sysn now 同步一下; 6....Edit – Find – Replace in Path… 把旧的名全部替换为新的 7. Build – clean Project 就大功告成了。...百试不爽,大家可以尝试一下,一定要删除.gradle啊~ 再给大家分享一个 android获取手机所有应用的名 示例代码 public class Main3Activity extends AppCompatActivity

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Nat. Comput. Sci. | 通过图神经网络快速评估有机分子在金属上的吸附能量

图1 模型与数据部分 密度函数理论:作者使用Vienna Ab-initio Simulation Package (VASP) 5.4.4进行了密度泛函理论(DFT)模拟。...计算中还考虑了晶胞尺寸、布里渊区采样、真空区域大小以及偶极校正等参数。 自动生成DFT数据:作者描述了构建用于机器学习目的的数据集的自动化过程。首先,金属表面通过从块体开始构建。...这些几何文件被转换为VASP POSCAR文件,表示以20埃的立方单元进行建模的分子。对这些分子进行松弛计算,并将其放置在参考金属Rh表面的一定距离处。...通过VASP对这些结构进行松弛,并将松弛后的几何结构应用于其他金属表面。对于BM数据集,分子是手动构建的,并通过VASP进行吸附和松弛计算,包括气相分子。

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哪些领域将成为下半年的监管关注重点?

该报告的发布标志着 FATF 于 2019 年首次发布的《加密资产和加密资产服务提供商(VASP)指南》已经经历了三个年头。...所以为了应对 DeFi 日益增加的风险,VASP 和金融机构应确保他们使用区块链分析功能来检测与 DeFi 混币器和跨链桥相关的风险。...作为核心,旅行规则要求 VASP 识别超过一定金额的交易的发起人和受益人,并将信息和数据安全的传输给其 VASP 交易对手。该规则的目的是帮助执法部门发现、调查加密资产领域的洗钱和其他金融犯罪。...FATF 的《最新报告》对未实施“旅行规则”的成员国和 VASP 提出了严厉警告——各国应根据 FATF 标准对 VASP 施加信息和数据共享要求。...跨链 DeFi、非托管钱包、NFT 和旅行规则合规性将是 VASP 合规团队的首要问题。

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Android技能树 — 网络小结之 OkHttp详细解析

我们以前网络系列的文章提过,发送到后台,肯定是一个完整的请求,但是我们使用okhttp的时候,只是转入了我们需要给后台的参数,甚至我们如果是get请求,只是传入了相应的url网络地址就能拿到数据,说明...okhttp帮我们把简单的参数输入,然后通过一系列的添加封装,然后变成一个完整的网络请求出去,然后我们在使用okhttp的时候,拿到返回的数据也已经是我们可以直接用的对象,说明接受的时候,已经帮我们把拿到的返回网络...所以在一系列帮我们发送的时候添加参数变成完整网络请求,收到时候帮我们解析返回请求的过程,是Okhttp的一个个拦截器们所处理,它拦截到我们的数据,然后进行处理,比如添加一些数据,变成完整的网络请求等操作

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推荐一款棒的抓分析工具 - Burp Suite

本篇文章我们聊聊一款超级好用的抓分析工具,即:Burp Suite Burp Suite,简称 BP 工具,一般作为渗透测试工具,是一款用于攻击 Web 应用程序的集成平台 主要功能模块包含: Proxy...模块 抓、数据拦截及数据包修改 Target 模块 Site map 站点记录及分析 Intruder 模块 暴力破解 Repeater 模块 重放工具 Decoder 模块 编/解码工具 Comparer...来进行,需要注意的是,破解的前提是本机为 JDK9+ BP 软件主界面图如下: 2、安装配置证书 这里以 Mac、iPhone 为例进行讲解 2-1 Mac 安装证书 为了抓取 https 的数据,...隔空投送等) 然后,在「 通用 - 设备管理 - PortSwigger CA」安装证书 最后,在「 通用 - 关于本机 - 证书信任设置 - 选中信任 PortSwigger CA 证书 」 3、抓...Proxy Listeners 信息,在网络管理中配置代理 即:网页代理(HTTP)、安全网页代理(HTTPS) 然后,保证 BP 工具的数据拦截功能已经关闭 最后,在 PC 微信中打开小程序,数据都会在

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函数依赖集闭、属性集闭键、候选键和最小函数依赖集的求法。

函数依赖集的闭 F:FD的集合称为函数依赖集。 F闭:由F中的所有FD可以推导出所有FD的集合,记为F+。 例1,对于关系模式R(ABC),F={A→B,B→C},求F+。...属性集闭 属性集闭定义 : 对F,F+中所有X→A的A的集合称为X的闭,记为X+。可以理解为X+表示所有X可以决定的属性。 属性集闭的算法: A+:将A置入A+。...键、候选键 若X+包含R的所有属性,则X是键。当X不可约时则为候选键。   如上例:A+=ABC,则A为键,因为A不可约则为候选键。  ...直至X的闭等于U,若等于U,则X为候选码。...(1)   求属性的闭。  按例2可得:A+=ABC,B+=B,C+=C。  (2)    求属性集的闭。  由BC→A,则(BC)+=ABC,其余属性集闭为属性闭的并集。

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【译】73个棒且可提高生产力的 NPM

在这里,我整理了一些我最喜欢的 NPM 的列表。我也将它们分类,因此信息更加结构化,更易于浏览。 当然,你不必安装和学习所有这些工具。在大多数情况下,从每个类别中挑选一个就足够了。...许多现代的 UI 工具都基于它,例如 React Bootstrap[16] 或 Reactstrap[17]。...54.UglifyJS2[77] JavaScript 解析器,压缩程序和美化工具。它可以使用多个输入文件,并支持许多配置选项。 ?‍?...70.CSV[94] 全面的 CSV 套件,结合了 4 个经过测试的软件,可以生成,解析,转换和字符串化 CSV 数据。...希望你找到了对你有用的有用 npm ! 感谢你阅读,可以关注我[98]获取更多信息!

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