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vasp-vtst过渡态计算过程

——课题组概况 vasp-vtst计算过渡态 1935年,Eyring,Evans和Polanyi在统计热力学和量子力学的基础上提出了过渡态理论,可以通过基本物性(分子震动频率、质量、核间距等)计算反应速率常数...NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG...#通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3...#specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does...not move the ions; 这里其实是抛弃VASP自带的优化,选用vtst的优化方法; IOPT=1 #LBFGS = Limited-memory Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno

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Python量子力学计算模拟以及数据可视化

熟悉数值算法(最优化方法,蒙特卡洛算法等)与并行化 算法(MPI,OpenMP等多线程以及多进程并行化)以及python优化方法,经常使用C++给python写扩展。...VASPy是一个纯Python编写的处理VASP文件数据以及进行数据快速可视化的库,基于OOP的思想提供了操作VASP文件的友好的接口,可以帮助使用者快速编写处理VASP相关文件的脚本,以提升效率。...VASPy的GitHub地址:https://github.com/PytLab/VASPy VASPy的PyPI地址:https://pypi.python.org/pypi/vaspy/ 使用说明...0.5474, 3.59093], [3.91022, -0.54961, 7.26487], ... ]) 如果要获取所以迭代步中的受力信息,需要使用...目前本项目都是在作者工作需要的基础上不断对其功能和接口进行完善,但仍只是冰山一角,希望做计算模拟使用VASP的Pythoner们能不断参与进来,使其更加出色和高效。

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哪些领域将成为下半年的监管关注重点?

这在 FATF 看来是一个漏洞,因为它允许犯罪分子自由地使用 DeFi 服务。...FATF 对 DeFi 的第二个担忧是在 DeFi 领域越来越多地使用混币器来实现洗钱,包括朝鲜黑客在内的网络犯罪分子越来越多地使用混币服务,以试图掩盖他们的非法活动,比如最为黑客所钟爱的混币器 Tornado...所以为了应对 DeFi 日益增加的风险,VASP 和金融机构应确保他们使用区块链分析功能来检测与 DeFi 混币器和跨链桥相关的风险。...例如,VASP 可以利用交易筛选解决方案来识别他们是否正在处理与 NFT 欺诈和盗窃相关的付款,还可以使用多币种取证工具对以太坊等加密资产中的支付进行深入分析,这些支付是否与非法使用 NFT 支持犯罪分子相关...FATF 的《最新报告》对未实施“旅行规则”的成员国和 VASP 提出了严厉警告——各国应根据 FATF 标准对 VASP 施加信息和数据共享要求。

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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

使用前准备 2.1 PyMOL程序的安装 由于PyVibMS需要依赖PyMOL程序才能使用,在还没有安装PyMOL的情况下,我们需要先安装PyMOL。...商业版的使用需要申请或者购买授权证书,假如没有有效证书的话,商业版PyMOL的还可以打开继续使用,但一些高级功能(如渲染出图)会受到影响。...具体的使用方式请见下一节的实例。使用完成后,请点击PyVibMS窗口的Close按钮。 4....4.2 VASP计算单晶硅的振动分析 在对VASP计算的振动分析进行可视化之前,我们需要振动计算后得到的OUTCAR和CONTCAR文件 (见PyVibMS-master/examples/VASP/original-data...接着,回到PyVibMS界面后,将文件类型XYZ调成VASP 5.x。因为这个VASP输出文件既包含了PBC盒子的信息,又包含了振动模式的信息,我们勾选 Has PBC 和 Has Vib.

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Nat. Comput. Sci. | 通过图神经网络快速评估有机分子在金属上的吸附能量

图1 模型与数据部分 密度函数理论:作者使用Vienna Ab-initio Simulation Package (VASP) 5.4.4进行了密度泛函理论(DFT)模拟。...核心电子使用波函数修正的伪势表示,价电子使用平面波展开,并设置了相应的截断能量。对于气相分子和吸附分子,分别进行了松弛计算和几何优化,以获得最稳定的结构。...然后,使用Open Babel生成FG数据集中分子的几何文件,并应用MMFF94力场。这些几何文件被转换为VASP POSCAR文件,表示以20埃的立方单元进行建模的分子。...通过VASP对这些结构进行松弛,并将松弛后的几何结构应用于其他金属表面。对于BM数据集,分子是手动构建的,并通过VASP进行吸附和松弛计算,包括气相分子。...节点级层使用ReLU作为激活函数。GAME-Net使用285,761个可训练参数进行训练,其中大部分参数集中在GMT汇聚层,其余参数在其他层中均匀分布。

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全球监管新政策下,加密企业如何满足合规要求?

VASP 能否可以快速、便捷地识别用户地址的风险性,就如同 Web2 的征信报告一样快速获取关键信息?...只需要输入钱包地址,工具即可自动化给出 AML 风险报告,并对该地址进行打分,使用 0-99 反映非法加密活动风险。...我们以 FATF(金融行动特别工作组)2021 年 10 月指南为例——这也是目前被广泛采用的监管策略——指南要求所有 VASP(即交易平台)必须制定 AML/CFT 措施。...指南要求所有 VASP(即交易平台)必须制定 AML/CFT 措施。 在履行监管义务中,第一步就是了解客户身份。...投资者所熟知的前「三大」交易平台之一就已在东南亚地区使用了 ADVANCE.AI 的身份核查和 eKYC 产品。

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邹传伟:区块链与利益相关者资本主义

他认为,企业管理层为股东工作,企业唯一的社会责任是在参与公开自由竞争并且不欺诈的前提下,使用自身资源以提升利润。弗里德曼的思想极大影响了美国关于公司治理的法律。...首先是交易手续费,相当于交易发起者用手续费来竞拍公链内有限的系统资源,遵循“谁使用谁付费”原则。其次是出块奖励,矿工获得的新发行Token。...Libra开放生态包括指定经销商、虚拟资产服务提供商(VASP)和非托管钱包用户等参与者。...Libra联盟负责Libra项目的开发和治理,对联盟成员、指定经销商和VASP的尽职调查,为Libra生态参与者建立合规标准,实施协议级的合规控制和其他合规控制,以及运行金融情报智能。

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Composer 使用使用详解

可以使用 composer --version 命令查看,如下图: ?...该文件主要是管理包版本使用的,当我们在使用composer update命令时,composer会自动根据composer.json的包版本依赖,生成对应的composer.lock文件,当我们下次在执行...Composer版本约束 在我们使用composer安装包时,不得不考虑的就是一个版本问题,因为不同的版本,存在兼容性问题,因此我们在使用该工具安装包时需要特别的注意包版本,如果使用不当很容易导致项目因为包版本问题瘫痪...你可以定义多个范围,使用空格或者逗号 , 表示逻辑上的与,使用双竖线 || 表示逻辑上的或。其中与的优先级会大于或。...,file.psr-0逐渐的被抛弃了,由于一些老项目还在使用该规则,因此部分项目仍在使用

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