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WebGestalt 2019在线工具

WebGestalt是用在不同生物的背景下进行功能富集分析的一套使用广泛的基因集富集分析工具,是强大的集成型数据挖掘系统,能够管理、检索、组织、可视化和统计分析大量基因。...而且WebGestalt 2019并比之前的版本增加了新的功能,如支持磷酸化蛋白质组学数据的分析等。接下来,就让我带大家来一探究竟吧!...打开WebGestalt最新版的官网: 1、首先选择目标生物体:用户需要从下拉菜单中选择12个生物体或Others(其他)中的1个选项。...如果用户选择了12个生物体中的一个,则WebGestalt将对所有上传的文件执行ID映射,因此,用户还需要选择上传的功能数据库文件的ID类型。...7、ORA或GSEA方法的输出报告 如果上传数据的ID类型来自WebGestalt 提供的12个生物体之一,则输出报告将包含两个主要部分:总结和富集结果。

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3大在线分析工具:Enrichr、WebGestalt、gprofiler与R包clusterprofiler的比较

但是网页工具我用起来毕竟还是有些丢脸,所以安排学徒比较了一下常用的3大在线分析工具:Enrichr、WebGestalt、gprofiler与R包clusterprofiler,有了这个笔记分享给大家。...WebGestalt同样是高引用率富集分析工具,现引用量超过 2,500(几版加起来),支持3种算法进行富集: Over-Representation Analysis (ORA) Gene Set...PART 06 3种原始库文件比较 因为webgestalt指向GO官网,没有找到2019.01.14的GO版本,暂时放到一边 ?...而webgestalt不仅完全mapping上,还多2个基因在这个term上 ?...而其他三个工具都是non-redudnant的GO数据,省去了很多时间,特别是webgestalt,既有去冗余也有所有GO。 ? ?

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