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R语言基础绘图函数散点图~跟着Nature Communications学画图~Figure1

今天继续 跟着Nature Communications学画图系列第二篇。学习R语言基础绘图函数画散点图。...image.png 第一部分先收一下上一篇文章的尾 跟着Nature Communications学画图~Figure1~基础绘图函数箱线图 这篇文章中有人留言说 和原图不是很像,因为配色没有按照论文中提供的代码来..."#E69F00", "#56B4E9", "#009E73") boxplot(log10(rel_crAss)~country,data=HMP,col=cols, axes=F,xlab...image.png 画图用plot()函数,需要指定画图用到的变量y和x,还有画图用到的数据data 原始代码分别对 rel_res 和 rel_crAss取了log10 plot(log10(rel_res...HMP, bg=cols[as.factor(HMP$country)], pch=21, ylab = "Normalized ARG abundance (log10)", xlab

1.2K10

R绘图-ggplot2 (3)

8、分面(Facet) 分面可以让我们按照某种给定的条件,对数据进行分组,然后分别画图。 #在统计变换一节中,提到如果按切工分组作回归线,显然图会很乱,有了分面功能,我们可以分别作图。...price))+geom_point(aes(colour=cut))+scale_y_log10() +facet_wrap(~cut)+stat_smooth() 9、主题(Theme) 通过ggplot画图之后...,我们可能还需要对图进行定制,像title, xlab, ylab这些高频需要用到的,自不用说,ggplot2提供了ggtitle(), xlab()和ylab()来实现。...ggplot2提供一些已经写好的主题,比如theme_grey()为默认主题,我经常用的theme_bw()为白色背景的主题,还有theme_classic()主题,和R的基础画图函数较像。...data.frame(x=radius*sin(theta), y=radius*cos(theta)) ggplot(dd, aes(x, y))+geom_path()+theme_null()+xlab

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