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Genome Biology|常用计算工具会产生相互矛盾和过于乐观的AUPRC值

在生物医学和生物信息学领域,PRC 和 AUPRC 有着非常广泛的应用。然而,常用的计算工具本身存在的问题可能会被研究人员忽略,从而可能导致对结果解读的偏差。2024 年 5 月,香港中文大学曹沁研究助理教授与徐国荣教授、美国SBP研究所Kevin Yip教授在 Genome Biology 上发表了一篇题为《Commonly used software tools produce conflicting and overly-optimistic AUPRC values》的文章,比较了常用软件工具在基因组学研究中的计算结果,发现产生的 AUPRC 值之间存在冲突和过度乐观的情况。研究人员在使用这些工具评估和解释基因组学研究结果时,需要谨慎,避免可能的误导性结果和偏见。

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