关于使用XCMS包中的一个warning

XMCS函数包是我们常用来做代谢组raw数据处理的函数包,其github网址:https://github.com/Bioconductor-mirror/xcms。

在使用的过程中,如果你使用diffreport函数出现了如下警告,不用担心,You can safely ignore duplicate row name warnings!(https://www.kaggle.com/c/15-071x-the-analytics-edge-competition-spring-2015/discussion/13928)。该warning主要是因为在该函数中使用了cbind函数,这个函数在合并数据框和矩阵的时候出现了这个警告(虽然已经检查确实没有重复的row names),一般来讲这个不应该报警告的,深入原因还需要高手不吝赐教!

当然分析这种差异,可以不用这个函数,从结果中提出峰度值以后,可以使用悟空数据分析平台流程式处理代谢组数据进行分析(http://www.omicsolution.org/wu-kong-beta-linux/passwd/modelchuanshao2):

哈哈,原谅我放荡不羁的广告~~目前平台已经有73个模块,外加两个流程式处理蛋白质组和代谢组数据模块,感谢大家继续使用、支持、宣传。

  • 发表于:
  • 原文链接:http://kuaibao.qq.com/s/20171228G0SGVS00?refer=cp_1026

扫码关注云+社区