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深度学习助力研究者解决心血管病最后堡垒

心力衰竭是心血管领域尚未“攻克的堡垒”,据统计70岁以上人群心力衰竭发病率为10%,目前全世界有2250万心力衰竭患者,并以每年200万人的速度增长,中国现有心力衰竭患者高达400万人。心力衰竭致死率高,5年生存率甚至低于多种癌症,同时心衰患者住院率高,生活质量差,经济负担沉重。在过去的十年中,机器学习和深度学习技术发展迅猛,在管理及鉴别多种疾病中展现了巨大的潜力。本期创新周刊我们选译西澳大利亚大学Girish Dwivedi教授课题组关于机器学习在心衰应用的综述,希望能给读者一些启发。

一.机器及深度学习的定义及数据来源

首先我们需要明确该技术的定义。机器学习是利用数据或既往的经验,对能通过经验自动改进的计算机算法研究;而深度学习则是该技术的一种更高效的分支,能够利用人工神经网络从数据中学习有意义的抽象概念。如今,结合生物信息学与医学信息学技术,其在疾病诊断、药物开发、不良反应预测等方面的价值已愈发彰显。

深度学习技术需要既往的数据,有效数据包括了病人的访视、实验室检查、影像及用药记录。这些通常由医生或医疗机构收集,数据的类型可以是文字(病史)、影像(超声、CT)或者心电图。目前已有包括Sutter-PAMF、PhysioNet等多个大型数据库,其中准确收录有全球多国心衰患者的就诊记录、检验结果、用药记录等信息(图1)。基于以上数据库,可利用机器学习与深度学习技术进行心衰相关的数据分析及研究。

△图1 国际心衰研究数据库

二.机器学习辅助心衰诊断及检测

正确利用机器学习正确监测及评价心衰一直是研究人员关注的热点。不同类型的数据库都能应用于心衰的检测(图2)。Yang等于2010年建立了基于血液检查、超声心动图、心电图、六分钟步行试验、体格检查等临床资料的心衰监测系统,通过使用支持向量机(SVM)法进行机器学习,将患者分为健康、心衰无症状期、心衰期三个组别,准确度可达74.44%。2011年,Gharehchopogh等则基于人工神经网络,将40位心衰患者为年龄、性别、血压、吸烟习惯作为变量构建心衰分型模型,使诊断准确度达到95%,且假阳性率仅为9%。Wu等基于电子健康病历数据则可在临床诊断前6个月判断心衰。

在机器学习中设置过多的变量会明显增加系统的复杂性,易产生过拟合等问题,影响分析结果。为此,研究者采用了粗糙集理论及线性回归模型,以减少数据集内部的特征量。在此后的心衰诊断系统中,研究者进一步将胆固醇水平、冠心病家族史、心音特征、心脏储备功能 、心电图等作为评价依据,使机器学习及深度学习在心衰诊断中的应用得到进一步发展。

△图2 病人数据及机器学习技术应用于心衰诊断,分级,预测在住院及药物依从性评估从而改善心衰患者临床预后

三.机器学习用于心衰分类

“在使用临时机械泵的这段时间里,我们可以思考接下来的处理方案--患者是否有必要进行心脏移植,情况是否会发生好转,或者他们是否需要使用左室辅助装置(LVAD)等等,不断地挑战极限。” Dr.Lanfear对采访者说,他们在使用这些装置时,时长常常远超过几个小时,可能是一周或者几周的时间。“在我们医学中心,临时心脏机械泵使用比较常见,我们经常与导管室的介入医生合作,或者是使用ECMO或者LVAD等,这些手段通常是用于应急抢救,后续再评估对于患者的长期情况作何处理。”

四.机器学习预测心衰患者依从性及再入院

对治疗方案及药物的依从性是影响心衰患者不良心血管事件发生率、再入院率及死亡率的重要因素。近年,Karanasiou等依据约100种变量资料,使用机器学习技术对90名心衰患者药物依从性进行预测,准确度最高可达91%,这显示了机器学习模型在预测依从性方面的重要价值。

心衰患者在入院治疗期间大多花费高昂,为个人及社会带来了巨大的负担。因此,通过机器学习预测再入院率的方法应运而生。基于远程监测的生理数据,Koulaouzidis等综合了患者的LVEF、NYHA分级、合并症、血压等数据,对心衰再入院预测模型进行了初步构建,并在此后予以修正与完善。其中,Baechle提出的潜在主题集成学习(Latent Topic Ensemble Learning)理论集成了来自不同医疗机构的目标特异性模型,较传统数据来源更具普适性。利用该模型能够有效协助降低再入院率,缩减经济成本。

五.总结

目前,多种机器学习技术已被成功应用于心衰的诊断、分型、再入院率预测、药物依从性预测等方面。深度学习技术较前者具有更大优势,有望将高维数据所蕴含的复杂特性可视化,并最终适用于未来的科学研究,助力这一迅猛发展的新兴学科。

选摘综述:Awan S, Sohel F, Sanfilippo F, Bennamoun M, Dwivedi G. Machine learning in heart failure: ready for prime time. Current Opinion in Cardiology. 2017;Publish Ahead of Print(2):1.

本期策划:沈雳 殷嘉晟

本期翻译:许菲

后期制作:张倩倩 黄朔阳 高子昂

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  • 原文链接http://kuaibao.qq.com/s/20180512G1TGTT00?refer=cp_1026
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