蛋白质测序降解为什么要从n端开始

蛋白质测序降解为什么要从n端开始

蛋白质测序中的降解通常从N端（氨基端）开始主要是由于：

1、酶特异性：

用于蛋白质测序的酶，如Edman降解中的苯异硫氰酸（PITC），特异性地与蛋白质的N端氨基酸反应。这种特异性确保了测序过程的准确性和可重复性。

2、测序简便性：

从N端开始可以逐步去除每个氨基酸并进行鉴定。这种方法较为直接和高效，因为蛋白质的氨基酸序列是从N端到C端合成的。

3、生物学意义：

在某些情况下，蛋白质的N端可能具有特别的生物学意义，如信号肽的存在，这些都是研究者感兴趣的。

图1. 蛋白质N端和C端测序流程

然而，也有从C端开始的蛋白质测序方法，如羧肽酶C（carboxypeptidase C）的使用，但这些方法通常不如从N端开始的方法常见或高效。随着质谱技术的发展，蛋白质质谱分析提供了一种替代的、高度灵活的蛋白质测序方法，可以鉴定蛋白质的全部或部分氨基酸序列，无论是从N端还是C端。