Daniel Vreeman：自定义LOINC子集在RELMA之中的运用

发布日期：2017年12月24日原文作者：Daniel Vreeman

原文作者简介：丹尼尔·弗里曼（Daniel J. Vreeman）

Biomedical Informatics researcher, physical therapist, LOINC leader, healthcare standards aficionado, father, musician, geek.

生物医学信息学研究员、理疗师、LOINC负责人、医疗保健标准发烧友、父亲、音乐人、极客

几乎没有人需要全部的87,000多条LOINC术语。许多已经采纳LOINC的国家/地区都针对各自管辖区域内的使用情况，分别编纂和维护着在国家/地区层面上经过批准/认可的LOINC术语列表。例如，LOINC子集（subsets）可有助于赞成/偏爱基于摩尔类计量单位的报告（substance-based reporting，物质的量类报告）的管辖区域过滤掉他们所并不需要的那些基于质量类计量单位的LOINC术语（mass-based LOINC terms，质量类LOINC术语）。

作为LOINC映射工具金标准的RELMA软件，其最新版本之中当前备有一项关键的新增功能特性，可以是将搜索结果局限到仅仅是特定的用户定义型子集（user-defined subset）之中所包含的LOINC术语。这样，搜索结果就不会再被那些您并不需要的术语搞得乱七八糟。

现在，就让我们来看看它的工作机制吧！

用户定义型LOINC子集的创建

安装最新版本的RELMA

如果要使用这项新的RELMA功能特性，您需要将其版本更新到6.22版（或更高的版本）。您可以在LOINC网站上免费下载RELMA软件（只是首先需要有个网站loinc.org的免费账户）。RELMA需要操作系统为Microsoft Windows（如果您是像我这样使用的是Apple计算机，则可以先在Mac上安装个虚拟机）。

编制您的LOINC子集

在设置可供在RELMA之中使用的LOINC代码子集之前，首先需要利用相应的LOINC代码列表来建立一份简单的电子表格或CSV文本文件。许多在国家/地区层面上所定义的子集，在发布时还会同时备有一大套其他的属性，如翻译名称、与记账/收费代码的映射关系、计量单位、类别和标签以及注释等等。

就定义子集的目的来说，所有我们需要的就是一张LOINC代码列表。在此，我们强烈建议，仅仅采用所感兴趣的那些LOINC代码，创建仅有一列的CSV文本文件。在Excel当中，可以轻松完成这一步；比如，将LOINC代码列表复制粘贴到新的工作簿（Workbook）当中，并在文件格式菜单当中选择文件格式“CSV UTF-8”。

定义RELMA之中所要使用的LOINC子集

要定义自己的LOINC术语自定义子集（custom subset），请转到LOINC网站上的针对性LOINC子集（Targeted LOINC Subsets）页面。在登录LOINC网站之后，您就可以利用该页面底部的超级链接“Add New Subset”（添加新的子集）来定义新的子集。

在下个页面上，我们定义了关于这种子集的基本元数据，包括名称（Name）、版本（Version）、描述（Description）以及当前子集建立时所依据的LOINC版本（LOINC Version）。

利用文件上传程序，选择之前所准备好的电子表格或CSV文本文件。

友情提示：在上传之前，我们建议对数据文件加以编辑，以便其中仅仅包含一列：即您的子集之中所收录的那些LOINC代码（总之，会忽略掉所有其他的字段）。

一旦上传了您的文件，页面就会自动回到子集清单主页面。

在离开LOINC子集页面之后，利用LOINC用户配置菜单（Profile menu）当中的链接“My Content”（我的内容），始终还可以回到该页面。

请注意，这项LOINC子集功能特性是每个用户所特有的，任何其他人都看不到也无法使用您自己的LOINC子集。

Regenstrief方面已经考虑为特定的用户（比如，那些来自负责编制和维护国家级/地区级子集的机构的人员）或机构建立某种机制，以用于维护和推广广泛使用的子集（highly used subsets），并让其他的人员或机构能够“订阅”这些子集。如果这正是您所希望看到的东西，请知悉LOINC团队。

好啦，现在已经定义好了一部LOINC子集，这时就为RELMA之中的运用做好了准备。

在RELMA之中使用您的LOINC子集

在启动RELMA软件时，请确保利用您的loinc.org证书（即用户名和密码）进行登录（这样才能让您安全稳妥地从LOINC网站上访问您的子集）。

接着，转到RELMA文件菜单之中的“Set User Preferences”（设置用户偏好）菜单项。点击“My Subset”（我的子集）选项卡，就会看到您所已经定义的那些子集。选中所需的子集，单击“OK”（确定）即可。

现在，当您转到RELMA的搜索（Search）或映射（Mapping）屏幕时，可以注意到，有两个标记说明，当前已经启用了您相应的子集，并将会据此来限制为您所返回的搜索结果。

第一个标记就是，标题栏中结尾部分的文字将是“restricted by subset”（利用某某子集加以了限制）字样的消息。

第二个标记则是，窗口底部状态栏/功能行之中的“My Subset”（我的子集）切换开关按钮将呈高亮状态（已启用）。

利用鼠标点击“My Subset”（我的子集）按钮乃是启用和禁用“按用户自己来限制搜索”功能的最为快捷的方式。

针对性LOINC子集功能特性的实际运用

让我们来看看这项子集功能特性的实际作用吧！为了说明问题，我将采用泛加拿大LOINC观测指标代码数据库（pan-Canadian LOINC Observation Code Database，pCLOCD）作为示例。该数据库是加拿大对这部大型的LOINC术语集所施加的约束。

首先，让我们利用我在《LOINC精要》（LOINC Essentials）一书之中所推荐的默认搜索限制，在RELMA（6.22版）之中搜索“calcium ser/plas”（钙 血清/血浆）。

如上图所示，RELMA在搜索结果表格之中显示了大约30条术语，包括许多在加拿大的背景下并不使用的基于质量类计量单位的指标（mass-based measures）。

现在，让我们利用窗口底部的切换开关按钮来启用“My Subset”（我的子集）搜索限制，并重新执行上述的搜索。

真是不赖！这次仅仅返回了8条候选术语，因此，要区分候选术语之间的差异并选出合适的术语，瞬间就变得容易得多啦！

LOINC子集功能特性的其他用途

这种LOINC子集是个灵活的机制，可以用于支持很多可能的用途。例如，假设您是生物梅里埃（bioMérieux）公司之类的体外诊断厂商（IVD vendor），且维护着一份适用于ETEST抗生素敏感性试验（antibiotic susceptibility testing）的LOINC代码列表。

注释：生物梅里埃公司目前采用新的LIVD格式（LIVD format），在其网站https://www.mybiomerieux.com/之上，就备有这样一份公开可用的列表。

可以轻松地以子集的形式下载这份适用LOINC代码列表；尔后，再结合查询“VersionLastChanged:2.63”，还可以查看一下，在最新的发布版本之中，是否对该列表之中的任何术语进行了更新。

很好，全都没有发生变更，也就不需要任何的更新啦！

既然已经领略了新的LOINC子集功能特性的工作机制，我还是鼓励您针对自己的目的亲自加以尝试。

Happy LOINCing!

Using Custom LOINC Subsets in RELMA - Daniel Vreemanhttps://danielvreeman.com/using-custom-loinc-subsets-in-relma/

注释：包括本文中的所有图片均来自的Daniel Vreeman的原文