“抗癌登月”提升肿瘤病理规范化,志诺维思助力肿瘤迈向精准医疗时代

8月17日至19日,2018中国肿瘤学大会(CCO)在沈阳召开。本届大会为国内肿瘤学界级别最高的一次学术盛会,共有32位中外院士、527名医院院长、1.4万余名国内外肿瘤医学界精英参会,大会聚焦肿瘤医学的前沿和热点,以 “肿瘤防治,赢在整合”为主题。

作为此次大会的重头戏,肿瘤病理分会场吸引了来自全国各地的数十名肿瘤病理学专家临场。在此次分会场上,丛文铭主任、林冬梅等六位专家主任分别就肝癌、肺癌、胃癌、鼻咽癌、软组织肿瘤、皮肤癌的数据库建设情况与未来发展进行了剖析,并以“中国病理如何运用大数据技术提升病理诊断水平”为话题进行了激烈讨论。

会上启动了“抗癌登月”—— 中国肿瘤精准医学大数据科研协作平台的首推项目——“中国肿瘤病理大数据多中心研究”,复旦大学附属肿瘤医院病理科杜祥教授与志诺维思CEO凌少平共同参与了这一项目的启动仪式。

抗癌任务艰巨,肿瘤精准医学研究刻不容缓

近年来,我国肿瘤患者数据逐年上升,患者的五年生存率低于发达国家平均水平。为了缩短与国外肿瘤治疗水平的差距,深化国内肿瘤病理研究,提高诊疗效果,中国抗癌协会病理专业委员会发起并组织了“中国肿瘤病理大数据多中心研究”。

该项目旨在通过回顾中国近五年来十大恶性肿瘤的病理诊断报告及病理图像数据,研究中国十大恶性肿瘤的病理流行病学特点,评估现有病理诊断现状和规范化水准,并为制定下一代中国十大恶性肿瘤的病理诊断标准打下坚实的数据基础。

2017年8月至今,该计划已经成功启动了肝癌和肺癌的多中心研究项目,累计收到全国19个省的46家三甲医院共20余万例近五年的病理诊断报告。

作为该计划的唯一技术支持单位,志诺维思运用其搭建的“抗癌登月”平台帮助协会完成数据上传、文本数据结构化、规范化初步评估、流行病学分析等工作。

通过“抗癌登月”平台,用户可参与多中心科研项目,实时了解项目进展,与项目其他成员协同沟通。利用平台提供的数据管理工具可以方便地对科研数据进行浏览、管理及共享操作。参与项目的用户还能结合自身数据特点提出子项目的申请,申请获批后便可协同其他单位开展感兴趣的研究。

除了科研协作和数据管理之外,“抗癌登月”平台还融合了志诺维思在中文病理报告自然语言处理、肿瘤基因组生物信息分析和病理图像人工智能等多项核心技术。这将为研究计划提供病理文本、图像和基因组数据分析功能,同时也能为参加项目的其他成员提供标准化分析自身数据的工具。

肝癌指南逐步引导肝癌知识库走向标准

2017年8月,“中国肺癌病理大数据多中心研究”项目(英文缩写:BDLC)正式启动,以中国抗癌协会病理专业委员会肺癌学组的委员单位为研究主体。

BDLC项目旨在评估全国肝癌病理诊断水准和规范化程度、为制定下一代肺癌临床病理诊断指南奠定基础。通过回顾近五年肺癌(包括非小细胞肺癌和肺神经内分泌癌)病理及相关临床数据,汇总整理形成中国肺癌病理数据库,进而研究中国人群肺癌发病及病理学大数据流行病学特征,后续各成员单位并以此为基础进行相关子课题的研究。

这一项目启动两个多月以来,共收集来自14省的19家三甲医院共计10万多份病例信息,预计在2018年12月将完成全部病理文本数据的结构化、规范化初步评估和流行病学的初步分析工作。

为了解BDLC项目的运作情况,动脉网记者采访了第二军医大学东方肝胆外科医院病理科主任丛文铭。

丛文铭主任参与了《原发性肝癌规范化病理诊断指南(2015年版)》编制,提出了肝癌标本“7点基线取材”方案和微血管侵犯(MVI)病理分级等新概念和新指标,为提高我国肝癌规划化病理诊断整体水平提供了依据。

丛文铭主任谈到:“志诺维思作为BDLC项目技术提供方,给我们带来的最实在的价值是让数据更加专业化、条理化、科学化与逻辑化,让一堆杂乱无章的数据,形成符合我们研究目标的数据,并帮助我们能快速进行这个专业方向的数据提取工作。这是我们过去无法实现的,更别说实现多中心研究。”

同时,丛文铭主任表示,志诺维思的大数据平台——抗癌登月,不仅是一个可以让大家运用平台中的数据开展研究,比如可以找出非病毒性肝炎相关肝癌与病毒性肝炎相关肝癌的共性和差异性,并从中研究肝癌的发病机制。更重要的是,抗癌登月搭建了一个互动合作平台,能让更多的肿瘤研究者能通过平台提供的信息找到样品及其他临床资源、病理专业技术、生信技术、组学技术的专业合作方共同开展多中心研究。

肺癌数据结构化渐入佳境

在当前技术条件下,病理诊断是肿瘤诊断最准确的方法,只有依靠病理才能可靠地确定肿瘤的良恶性。例如在每次乳腺活检中,病理学家通常需要对约60张病理图像进行审查,才能确定患者有无患病。而每张图像都超过2000万像素,信息量极大,却只有几张图像与患病区域真正相关。

尽管病理图像的数字化已存在十余年,但医疗机构并未形成一套完善的数字化诊断流程,导致这些数字化图像较难派上用场。而要想通过AI技术获得有价值的结果,必须先构建标准化数据库。对此,北京大学肿瘤医院病理科主任林冬梅率先在会上对2013年以来的肺癌专项数据库建立状况进行了总结。

目前参与项目并提交数据的13家三甲医院病例量增长情况(单位:份)

通过林冬梅主任对参与数据库建设的13家三甲医院数据分析来看,在病例量增长方面明显,在项目2013年累计肺癌病理报告不足1万份,而这一数字到2017年翻了2.7倍。

目前,越来越多的医院对于数据规范和数据库建设的支持态度呈上升趋势,项目启动已经19家单位参与,三个月内已经有13家单位提交数据,并且还有更多的医院希望报名参加肺癌大数据项目中来。

数据库指标数状态(肿瘤专科医院与综合医院)

整体来看,肺癌肿瘤数据的数量呈现高速上升态势,数据库显示的指标数状态也比较可喜,可见医生们探索出了更有效的指标以结构化数据,提升了病理诊断的内涵,而这些数据对临床知指导都具有深刻的意义。

正如丛文铭主任表达的那样,单纯的大数据平台并不能满足科研的需求,医生需要更加专业化、条理化、科学化与逻辑化的数据来服务肿瘤研究。

而志诺维思的大数据科研协作平台——抗癌登月通过对指标数量以及患者病案的大数据分析,可以形成一套病理规范化诊断评估体系,在未来可帮助医生诊断肺癌的准确性和一致性。同时也可以通过病理图像数据分析发现一些难以发现的病理特征,这是常规工作中可能不易留意到的。

此外,对于大数据的处理,平台可以通过人工智能不断的训练学习去找到疾病的某些内在特征,甚至先获得不同肿瘤病理特征的联系,再去探索病理联系的由来。

“抗癌登月”,指日可待

“抗癌登月”平台首推项目“中国肿瘤病理大数据多中心研究”启动之后,来自全国的病理科主任还展开了激烈讨论,着重探讨了大数据与人工智能未来给病理学带来的挑战与机遇,并谈到了对平台的期望。

专家们的平台诉求大致有以下六点:

1. 需要优秀的平台交互设计,便于医生通过简单的操作获取有效信息;

2. 需要通过大数据与AI判断出肿瘤的良恶性;

3. 需要更多中心的加入,以克服数据的地域采样偏好性;

4. 需要由专业的大数据企业提供技术支持,将数据变为富有价值的“金子”;

5. 需要制作更多高质量标注的病理图像数据集,以形成名符其实的“大数据”。

6. 需要融入更多的临床研究,不仅关注病理诊断而且要关心临床治疗。

对于病理专家们的诉求,志诺维思CEO凌少平博士表示这也真是公司追求的目标。作为“中国肿瘤病理大数据多中心研究”计划的唯一技术支持单位,志诺维思开启的“抗癌登月”平台已经为肿瘤的精准医学多中心研究打好了技术基础。

中国抗癌协会主任委员杜祥教授表示,“抗癌登月”已经帮助各大医院完成病理文本数据的结构化、规范化评估和流行病学的分析。未来协会将利用“抗癌登月”平台的互动标注功能建立病理标准标注数据集合,想想接下来将会有更多种类的肿瘤多中心研究进入志诺维思的“抗癌登月”平台中,我们也相信志诺维思会为更多类型的肿瘤研究提供专业的技术支持和服务。

“抗癌登月”,指日可待。

抗癌登月

奥巴马于2016年1月28日签署总统备忘录,设立以副总统拜登为首的“白宫抗癌登月计划特别小组”,引起医学界广泛关注。登月计划指得是治愈癌症面临着巨大的挑战。美国国家卫生研究院将在今年拿出1亿9500万美元用于癌症研究,2017财政年度白宫将要求国会批准在这一方面投入7亿5500万美元。联邦各相关部会都将尽全力投入。登月是一件需要历经困难、长期坚持的项目,而癌症的治疗亦如此。而人类最终登上了月球,以此寓意人类最终会攻克癌症。

志诺维思搭建的“抗癌登月(www.0cancer.cn)” 是中国肿瘤精准医疗大数据科研协作平台,旨在“链接数据,智慧抗癌”。抗癌登月融合志诺维思在生物信息、图像及文本处理分析上多项核心算法技术,目前该平台的首推项目是与抗癌协会发起的“中国肿瘤病理大数据多中心研究”,目前刚启动肝和肺两大癌种,已经得到了来自19个省46家三甲医院的支持,共累积上传病例超过20万份。

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  • 原文链接:https://kuaibao.qq.com/s/20180828A0I16K00?refer=cp_1026
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