python实现gabor滤波器提取纹理特征 提取指静脉纹理特征 指静脉切割代码

参考博客:https://blog.csdn.net/xue_wenyuan/article/details/51533953

https://blog.csdn.net/jinshengtao/article/details/17797641

傅里叶变换是一种信号处理中的有力工具,可以帮助我们将图像从空域转换到频域,并提取到空域上不易提取的特征。但是经过傅里叶变换后,

  图像在不同位置的频度特征往往混合在一起,但是Gabor滤波器却可以抽取空间局部频度特征,是一种有效的纹理检测工具。

在图像处理中,Gabor函数是一个用于边缘提取的线性滤波器。Gabor滤波器的频率和方向表达同人类视觉系统类似。研究发现,Gabor滤波器十分适合纹理表达和分离。在空间域中,一个二维Gabor滤波器是一个由正弦平面波调制的高斯核函数。

gabor核函数的表达式:

  复数表达式:

  可以拆解:实部:

       虚部:

其中:

参数介绍:

方向(θ):这个参数指定了Gabor函数并行条纹的方向,它的取值为0到360度

波长(λ):它的值以像素为单位指定,通常大于等于2.但不能大于输入图像尺寸的五分之一。

相位偏移(φ):它的取值范围为-180度到180度。其中,0he180度分别对应中心对称的center-on函数和center-off函数,而-90度和90度对应反对称函数。

长宽比(γ):空间纵横比,决定了Gabor函数形状(support,我翻译为形状)的椭圆率(ellipticity)。当γ= 1时,形状是圆的。当γ< 1时,形状随着平行条纹方向而拉长。通常该值为0.5

带宽(b):Gabor滤波器的半响应空间频率带宽b和σ/ λ的比率有关,其中σ表示Gabor函数的高斯因子的标准差,如下:

σ的值不能直接设置,它仅随着带宽b变化。带宽值必须是正实数,通常为1,此时,标准差和波长的关系为:σ= 0.56 λ。带宽越小,标准差越大,Gabor形状越大,可见平行兴奋和抑制区条纹数量越多。

好介绍完毕。

现在进入主题,我们提取纹理特征。

  提取纹理特征,还有增强纹理特征,很多时候我们都是要先提取ROI感兴趣区域来进行操作的。很多图片上的其他空间其实对我们没有什么太大的作用,还影响程序的运行速度。则我们只拿ROI区域进行纹理提取。

先看看原来的指静脉图片:

这图片区域很多,一般我们只需要中间那部分指静脉纹理最多的ROI区域。

代码:

#!/usr/bin/python
#coding:utf-8
import numpy as np
import os
import cv2

def pathFile(path):
    return os.getcwd() + '/' + path

def brightestColumn(img):
    w, h = img.shape
    r = range(h / 2, h - 1)
    c = range(0, w - 1)
    return img[c][:,r].sum(axis=0).argmax()

#构建GABOR滤波器
def build_filters():
    """ returns a list of kernels in several orientations
    """
    filters = []
    ksize = 31                                                                 #gaborl尺度 这里是一个
    for theta in np.arange(0, np.pi, np.pi / 4):                               #gaborl方向 0 45 90 135 角度尺度的不同会导致滤波后图像不同
        
        params = {'ksize':(ksize, ksize), 'sigma':3.3, 'theta':theta, 'lambd':18.3,    
                  'gamma':4.5, 'psi':0.89, 'ktype':cv2.CV_32F}
                                                                            #gamma越大核函数图像越小,条纹数不变,sigma越大 条纹和图像都越大
                                                                            #psi这里接近0度以白条纹为中心,180度时以黑条纹为中心
                                                                            #theta代表条纹旋转角度
                                                                            #lambd为波长 波长越大 条纹越大
        kern = cv2.getGaborKernel(**params)                                    #创建内核
        kern /= 1.5*kern.sum()
        filters.append((kern,params))
    return filters                                                          

#滤波过程
def process(img, filters):
    """ returns the img filtered by the filter list
    """
    accum = np.zeros_like(img)                                              #初始化img一样大小的矩阵
    for kern,params in filters:
        fimg = cv2.filter2D(img, cv2.CV_8UC3, kern)                         #2D滤波函数  kern为其滤波模板
        np.maximum(accum, fimg, accum)                                      #参数1与参数2逐位比较  取大者存入参数3  这里就是将纹理特征显化更加明显
    return accum

#获取感兴趣区域的top 和 bottom值 用于切割显示图像
def getRoiHCut2(img, p0):
    h, w = img.shape

    maxTop = np.argmax(img[0: h / 2, 0])                                    #在一定区域遍历选取指静脉边缘 具体高宽结合图像
    minTop = np.argmax(img[0: h / 2, w-1])
    if(maxTop < 65):
        maxBottom = np.argmax(img[(13 * h / 16): 40*h/48  , 0]) + 3 * h / 4
        minBottom = np.argmax(img[(13 * h / 16): 40*h/48, w-1]) + 3 * h / 4
    else:
        maxBottom = np.argmax(img[(3 * h / 4): h  , 0]) + 3 * h / 4
        minBottom = np.argmax(img[(3 * h / 4): h, w-1]) + 3 * h / 4
    maxTop = (2*maxTop + minTop) / 3
    maxBottom = (maxBottom + 2*minBottom) / 3

    return img[maxTop:maxBottom,:]

#获取感兴趣区域范围
def getRoi(img):
    height, width = img.shape
    heightDist = height / 4

    w = img.copy()
    w1 = w[heightDist:3 * heightDist,width / 4:]
    p0 = brightestColumn(w1) + heightDist + height / 2                      #将手指边缘的高度加上四分之三原始高度  
    pCol = w[:,p0:p0 + 1]

    pColInv = pCol[::-1]

    clahe = cv2.createCLAHE(clipLimit=2.0, tileGridSize=(8,8))              #构建一个有限对比适应性直方图均衡化器  

    w1_2 = clahe.apply(w[:, (p0 /20):(p0 + p0 / 2)])                       #截取区域宽度大概是p0高度的一点五倍 apply是获取一个返回值 这里是为了方便参数的传递
    w2 = getRoiHCut2(w1_2, p0)

    res = cv2.resize(w2, (270, 150), interpolation=cv2.INTER_CUBIC)

    return clahe.apply(res)

def logImg(img):
    return img.astype(float) / 255                                          #将图像数据转为0-1存储

函数全给了 自己调用后

好现在看看处理后的指静脉图片:

看起来还不错吧,预处理之后就可以 进行纹理特征提取放入文件进行模式匹配啊 进行指静脉识别啊。有兴趣的就期待在下之后的博客。

http://www.cnblogs.com/DOMLX/p/8989836.html 提取纹理特征

http://www.cnblogs.com/DOMLX/p/8672489.html 指静脉细化算法

http://www.cnblogs.com/DOMLX/p/8111507.html 指静脉切割过程

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