WGCNA的理论背景知识
WGCNA的详细分析流程
关键模块和hub基因筛选,在流程中并不可知
模块划分好后如何找到key module
找到模块后如何筛选hub gene
MM= as.data.frame(cor(datExp, MEs, use ="p"))
for intramodular connectivity
KIM = intramodularconnectivity(adjacency, moduleColors, scaleByMax= TRUE)
另外还有很多不基于WGCNA的其他方法,可以综合运用,最终实验证实。
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