生信（三）（转载）HLA-typing软件

关键词：HLA; typing; NGS;

本文整理搜集了用于HLA typing的软件，供大家参考。

先贴一张比较全的表格：

表格来源：https://www.nature.com/articles/jhg2015102/tables/2

表格中未列出的HLA-typing软件还包括：

SOAP-HLA: http://soap.genomics.org.cn/SOAP-HLA.html

Erlich et al: https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-12-42

Lange et al: https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-15-63

Dilthey et al: https://www.biorxiv.org/content/early/2014/07/08/006973

GATK HLA Caller: https://gatkforums.broadinstitute.org/gatk/discussion/65/hla-caller

如果有新的软件欢迎告知！