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MATLAB读取56万行地震目录只需1秒

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传愿
修改2020-03-30 11:37:52
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修改2020-03-30 11:37:52
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简介


现有软件读取目录,经常遇到几种情况。

  • 字符串格式不正确,要关闭软件。
  • 内存超出,要关闭软件。。
  • 进度条载入中,99%出错。。。

于是,写了个小界面。新手入门,一般酷爱循环。因为书本上一开始介绍的就是循环,函数,字符串之类的。前几章学完,就找一些实例去练习。慢慢地,认为没有什么问题是一个循环解决不了的。如果有,那就用两个循环解决。于是,嵌套,并列,判断。选择都用上了。

一开始用循环读目录,经常把MATLAB搞死。后来想了好多办法。比如,切割成小文件读,转换格式后读,等等。其实,菜鸟遇到的问题。大牛们以前都遇到过。诸多大牛大多数都被官方收编。逐渐变成了官方开发人员,推出了更多实用工具。

improt导入数据功能早在2006年之前就推出。但不知道有这个功能。最近发现可以用这个函数导入数据,并可以做前期的数据清理。比如字符串切割劈分,等宽劈分,空格等固定字符劈分功能。而且可以读取带不规则分隔符和头文件的数据信息。比如,现有软件导出的*.MIF边界文件。

实例与代码


先说说MATLAB的ui前置。类似clear函数省略为cl前缀用法。

  • cla——clear axis 清理图层
  • clf——clear figure 清理图窗
  • clc——clear command 清理命令窗口

习惯上,有些人在每一个脚本前都要用到以下命令,清理窗口,变量和图形窗口。

代码语言:matlab
复制
%% 经常使用
clc;
clear;
close all;

每次输入比较麻烦,可以用evalin函数代替。

代码语言:javascript
复制
evalin('base','clc;clear;close all')
% 也可以加其他命令
evalin('base','clc;clear;close all;Zmap') % 打开Zmap软件

交互操作函数

有点跑偏。简单来说,部分函数前加个ui表示该函数的界面交互调用方式。

  • uisetcolor 选择颜色
  • uigetdir 获取目录路径
  • uigetfile 获取文件路径
  • uiload 导入
  • uisave 保存

数据导入

简单介绍下uiimport的使用。只需MATLAB界面输入:

代码语言:javascript
复制
uiimport
选择“文件”
选择“文件”

选择“文件”,导入一个目录。

文件载入
文件载入

红色箭头标注的地方需要设置。

  • 目录是按位保存的。用等宽分割劈分列数据。
  • 范围选择全部。键盘Ctrl+A选择全部,类似Excel可以单独选择用到的有效列。
  • 输出类型。如果是纯数据选择矩阵,带汉字的可以用元胞或表格。
  • 替换。这里选默认即可。如果是MapSis导出的MIF文件,这个功能可以直接把头文件和其他信息过滤。下一节有介绍。
  • 导入所选内容。选择函数,一步生成自己用的函数。比如OpenEqt,方便以后调用函数直接读取EQT格式目录。
  • 列劈分。经度和震级需要切割。右键选择,分割列,拖动鼠标,咵跨跨,切成2列。

导出代码

三种形式利用导入的数据。一,导入工作空间。二,导出为脚本。三,导出为函数。下面是导出脚本的代码。

代码语言:matlab
复制
filename = 'D:\EqCatlog\CEIC_ML2.EQT';
formatSpec = '%15f%6f%7f%4f%6f%C%[^\n\r]';
fileID = fopen(filename,'r');
dataArray = textscan(fileID, formatSpec, 'Delimiter', '', 'WhiteSpace', ...
    '', 'TextType', 'string', 'EmptyValue', NaN,  'ReturnOnError', false);
fclose(fileID);
EqTim  = dataArray{:, 1};
EqLat  = dataArray{:, 2};
EqLon  = dataArray{:, 3};
EqMag  = dataArray{:, 4};
EqDeep = dataArray{:, 5};
EqSite = dataArray{:, 6};
clearvars filename formatSpec fileID dataArray ans;

运行时间查看,代码前加tic,代码后toc。

代码语言:javascript
复制
tic
% 上边的代码
toc

时间已过 1.060942 秒。

举一反三

同样的道理。读取MIF边界文件,效率也极高。首先通过上边的方法生成函数ReadMif.m,然后调用函数转换数据。

代码语言:javascript
复制
B180 = 'D:\Eq\mapData\areaBankuai\版块边界180.MIF';
Bk = ReadMif(B180 , 1, inf); % 路径,开始行,终止行
代码语言:javascript
复制
function D = ReadMif(filename, startRow, endRow)
%IMPORTFILE 将文本文件中的数值数据作为矩阵导入。
%   D = ReadMif(FILENAME) 读取文本文件 FILENAME 中默认选定范围的数据。
%
%   D = ReadMif(FILENAME, STARTROW, ENDROW) 读取文本文件 FILENAME 的 STARTROW
%   行到 ENDROW 行中的数据。
%
% Example:
%   D = ReadMif('版块边界180.MIF', 4, 19580);
%
%    另请参阅 TEXTSCAN。

% 由 MATLAB 自动生成于 2020/03/27 14:43:00

%% 初始化变量。
delimiter = ' ';
if nargin<=2
    startRow = 1;
    endRow = inf;
end

%% 将数据列作为文本读取:
% 有关详细信息,请参阅 TEXTSCAN 文档。
formatSpec = '%q%q%q%[^\n\r]';

%% 打开文本文件。
fileID = fopen(filename,'r');

%% 根据格式读取数据列。
% 该调用基于生成此代码所用的文件的结构。如果其他文件出现错误,请尝试通过导入工具重新生成代码。
textscan(fileID, '%[^\n\r]', startRow(1)-1, 'WhiteSpace', '', 'ReturnOnError', false);
dataArray = textscan(fileID, formatSpec, endRow(1)-startRow(1)+1, 'Delimiter', delimiter, 'TextType', 'string', 'ReturnOnError', false, 'EndOfLine', '\r\n');
for block=2:length(startRow)
    frewind(fileID);
    textscan(fileID, '%[^\n\r]', startRow(block)-1, 'WhiteSpace', '', 'ReturnOnError', false);
    dataArrayBlock = textscan(fileID, formatSpec, endRow(block)-startRow(block)+1, 'Delimiter', delimiter, 'TextType', 'string', 'ReturnOnError', false, 'EndOfLine', '\r\n');
    for col=1:length(dataArray)
        dataArray{col} = [dataArray{col};dataArrayBlock{col}];
    end
end

%% 关闭文本文件。
fclose(fileID);

%% 将包含数值文本的列内容转换为数值。
% 将非数值文本替换为 NaN。
raw = repmat({''},length(dataArray{1}),length(dataArray)-1);
for col=1:length(dataArray)-1
    raw(1:length(dataArray{col}),col) = mat2cell(dataArray{col}, ones(length(dataArray{col}), 1));
end
numericData = NaN(size(dataArray{1},1),size(dataArray,2));

for col=[1,2]
    % 将输入元胞数组中的文本转换为数值。已将非数值文本替换为 NaN。
    rawData = dataArray{col};
    for row=1:size(rawData, 1)
        % 创建正则表达式以检测并删除非数值前缀和后缀。
        regexstr = '(?<prefix>.*?)(?<numbers>([-]*(\d+[\,]*)+[\.]{0,1}\d*[eEdD]{0,1}[-+]*\d*[i]{0,1})|([-]*(\d+[\,]*)*[\.]{1,1}\d+[eEdD]{0,1}[-+]*\d*[i]{0,1}))(?<suffix>.*)';
        try
            result = regexp(rawData(row), regexstr, 'names');
            numbers = result.numbers;
            
            % 在非千位位置中检测到逗号。
            invalidThousandsSeparator = false;
            if numbers.contains(',')
                thousandsRegExp = '^[-/+]*\d+?(\,\d{3})*\.{0,1}\d*$';
                if isempty(regexp(numbers, thousandsRegExp, 'once'))
                    numbers = NaN;
                    invalidThousandsSeparator = true;
                end
            end
            % 将数值文本转换为数值。
            if ~invalidThousandsSeparator
                numbers = textscan(char(strrep(numbers, ',', '')), '%f');
                numericData(row, col) = numbers{1};
                raw{row, col} = numbers{1};
            end
        catch
            raw{row, col} = rawData{row};
        end
    end
end


%% 将非数值元胞替换为 NaN
R = cellfun(@(x) ~isnumeric(x) && ~islogical(x),raw); % 查找非数值元胞
raw(R) = {NaN}; % 替换非数值元胞

%% 创建输出变量
D = cell2mat(raw);

dlmwrite('bk.txt',D,'precision','%s','delimiter','\t'); % 数据保存

MIF文件读取结果
MIF文件读取结果

数据提取避免了循环,速度很快。自己读取CEIC目录56万行,耗时仅1秒。效率远远大于循环读取。MIF文件也仅仅需要5.7秒。

结语


最后。向提供工作便利的所有付出者致敬,向工作中的所有软件开发者致敬。

计算机的发展,虽然给我们带来了诸多便利。但是也让工作花样变得更多,更复杂,更累人,也很无聊。所以,写笔记找点乐子,没想到又花了好多时间。

最后的最后。感谢阅读,如有兴趣,欢迎留言交流哦。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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  • 简介
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    • 交互操作函数
      • 数据导入
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