早期小鼠心脏形态发生中心肌细胞的时空调控和基因共表达

这两年单细胞相关的文章可谓是井喷式爆发，只要有组织样本，流程式分析一下哪怕不能得到有生物意义的结论，至少能发一下类似atlas之类。但是往往这些文章的稀缺性在于样本的稀缺性，作为生物信息研究者不一定有一手的数据，能不能用公共数据发自己的文章呢？这里分享一篇典型用公共数据的分析文章。分不高，4.6左右，但是不难，而且一般够毕业。

这篇文章主要用了两个不同时期不同心脏位置的单细胞数据，分别做了聚类，基因共表达分析，并找到了一些核心的转录因子。

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将不同时期和位置的心脏细胞分群，并找到10个基因共表达的模块，展示了特定位置的几个基因模块的表达。

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然后对这几个基因共表达的模块做了基因富集分析

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对基因模块典型的转录因子以及对应的motif进行展示，

对比了心房和心室的分群，GSEA富集情况，TF富集的motif，差异的转录因子的共表达模块等等。

文献链接： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Spatiotemporal+Gene+Coexpression+and+Regulation+in+Mouse+Cardiomyocytes+of+Early+Cardiac+Morphogenesis